MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 2649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020941	TTG	2	6	188412	188417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020941	CAT	2	6	188422	188427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_020941	T	7	7	188461	188467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020941	TAA	2	6	188540	188545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020941	TTG	2	6	188568	188573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020941	AAG	2	6	192371	192376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020941	TC	3	6	192381	192386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_020941	AT	3	6	192723	192728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020941	TGT	2	6	192737	192742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020941	ATGC	2	8	193097	193104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_020941	GTT	2	6	193105	193110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020941	GCA	2	6	193158	193163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020941	CTTT	2	8	193238	193245	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_020941	AAG	2	6	193285	193290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020941	T	6	6	193335	193340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020941	ATT	2	6	193348	193353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020941	T	6	6	193364	193369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020941	TATGAA	2	12	195340	195351	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020941	AGA	2	6	195396	195401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020941	AAC	2	6	195403	195408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020941	ATA	2	6	195423	195428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020941	T	7	7	195448	195454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020941	TGA	2	6	195558	195563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020941	CTC	2	6	196333	196338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_020941	CTA	2	6	196655	196660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020941	ATTT	2	8	196688	196695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020941	A	7	7	197174	197180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020941	AG	3	6	197196	197201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020941	AAT	2	6	197206	197211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020941	T	8	8	197226	197233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020941	T	6	6	197272	197277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020941	TAC	2	6	197316	197321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020941	ATT	2	6	197325	197330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020941	A	8	8	200120	200127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020941	CTT	2	6	200159	200164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_020941	A	8	8	200169	200176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020941	TC	3	6	200187	200192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_020941	CTT	2	6	200196	200201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020941	ACGA	2	8	202806	202813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_020941	CTAAG	2	10	202972	202981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
541	NC_020941	T	6	6	203080	203085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020941	GAAA	2	8	203092	203099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020941	A	7	7	203097	203103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020941	T	6	6	203870	203875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020941	CAT	2	6	203899	203904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_020941	CT	3	6	203945	203950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_020941	AAT	2	6	203992	203997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020941	TAG	2	6	204028	204033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020941	AAT	2	6	204041	204046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020941	AAG	2	6	204139	204144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020941	CTT	2	6	204150	204155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_020941	GA	4	8	207004	207011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020941	T	7	7	207034	207040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020941	CT	4	8	207052	207059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_020941	A	6	6	207061	207066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020941	CCTT	2	8	216226	216233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_020941	GAA	2	6	216248	216253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020941	TTG	2	6	216265	216270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020941	A	6	6	216277	216282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020941	CTC	2	6	217044	217049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_020941	A	7	7	218293	218299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020941	TAA	2	6	218300	218305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020941	AG	4	8	218325	218332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020941	A	6	6	218350	218355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020941	GAA	2	6	218360	218365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020941	TA	3	6	219879	219884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020941	GTC	2	6	219898	219903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_020941	CTAT	2	8	219953	219960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_020941	T	6	6	219969	219974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020941	ATT	2	6	220071	220076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020941	TCT	2	6	220096	220101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_020941	TCC	2	6	220148	220153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_020941	ATG	2	6	220171	220176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020941	GCAA	2	8	220196	220203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_020941	TTTTAC	2	12	221355	221366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
576	NC_020941	A	7	7	221417	221423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020941	TAA	2	6	221471	221476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020941	ATTTC	2	10	221498	221507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_020941	CT	3	6	221519	221524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_020941	AATT	2	8	221531	221538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020941	CTTG	2	8	221880	221887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_020941	T	6	6	221935	221940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020941	TC	3	6	224520	224525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_020941	AG	3	6	224551	224556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020941	CAATA	2	10	224621	224630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
586	NC_020941	TAA	2	6	225594	225599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020941	AAAC	2	8	225610	225617	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_020941	T	8	8	228085	228092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020941	TGT	2	6	228154	228159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020941	TCCT	2	8	228235	228242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_020941	AGA	2	6	228287	228292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020941	ATT	2	6	228324	228329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020941	AAC	2	6	234726	234731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020941	AGA	2	6	234753	234758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020941	GAG	2	6	234770	234775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020941	GCT	2	6	234822	234827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_020941	ACC	2	6	234831	234836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_020941	A	6	6	234862	234867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020941	ACT	2	6	234926	234931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020941	TGT	2	6	238731	238736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020941	TC	3	6	238751	238756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_020941	AG	3	6	238777	238782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020941	CAT	2	6	238846	238851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_020941	T	8	8	238853	238860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020941	CA	3	6	243701	243706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_020941	AAAT	2	8	243850	243857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020941	AAGA	2	8	243869	243876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020941	GT	3	6	243918	243923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020941	T	6	6	243929	243934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020941	AAG	2	6	246460	246465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020941	TTTC	2	8	246470	246477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_020941	TAAA	2	8	247304	247311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020941	ATA	2	6	247326	247331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020941	TTA	2	6	247347	247352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020941	T	6	6	248304	248309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020941	TACAA	2	10	248333	248342	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
617	NC_020941	ATA	2	6	248365	248370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020941	GA	3	6	250786	250791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020941	ACT	2	6	250846	250851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020941	TG	3	6	250896	250901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020941	AATA	2	8	250963	250970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020941	T	6	6	250985	250990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020941	T	7	7	251004	251010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020941	A	6	6	251012	251017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020941	ACA	2	6	251112	251117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_020941	CTT	2	6	251119	251124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020941	AAG	2	6	251150	251155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020941	GCA	2	6	251169	251174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020941	TTG	2	6	251189	251194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020941	CTC	2	6	251609	251614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_020941	CAA	2	6	251653	251658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020941	AG	3	6	251698	251703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020941	A	8	8	251704	251711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020941	AAG	2	6	251722	251727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020941	TCC	2	6	252562	252567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_020941	GAAA	2	8	252583	252590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020941	T	7	7	252604	252610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020941	GCAG	2	8	252632	252639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
639	NC_020941	AGAA	2	8	252665	252672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020941	AG	3	6	252707	252712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020941	TAT	2	6	252730	252735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020941	ACA	2	6	252771	252776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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