MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 2621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020940	A	7	7	617300	617306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1503	NC_020940	TAA	2	6	618209	618214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020940	AAAT	2	8	618232	618239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020940	T	7	7	618239	618245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020940	TCTTTT	2	12	618286	618297	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1507	NC_020940	T	6	6	618294	618299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020940	ATG	2	6	618300	618305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020940	TTA	2	6	618314	618319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1511	NC_020940	T	6	6	620816	620821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020940	CAG	2	6	620859	620864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_020940	CT	3	6	622184	622189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_020940	T	7	7	622212	622218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020940	T	6	6	622223	622228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020940	GTT	2	6	622242	622247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020940	T	6	6	622258	622263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020940	TTCT	2	8	622273	622280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_020940	TCT	2	6	623883	623888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_020940	GAT	2	6	623934	623939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020940	T	6	6	623967	623972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020940	TAAG	2	8	625252	625259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020940	A	6	6	625288	625293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020940	AGA	2	6	625301	625306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020940	GATT	2	8	625375	625382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1542	NC_020940	A	8	8	637158	637165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020940	CTCC	2	8	637169	637176	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1544	NC_020940	A	6	6	637177	637182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_020940	A	6	6	637756	637761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1553	NC_020940	A	6	6	646306	646311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020940	A	8	8	646338	646345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020940	T	8	8	646378	646385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020940	A	6	6	646389	646394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020940	A	7	7	646396	646402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_020940	GA	3	6	649284	649289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_020940	A	8	8	649339	649346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_020940	T	6	6	652108	652113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020940	GT	3	6	652124	652129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_020940	T	6	6	666082	666087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_020940	CT	3	6	670941	670946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1619	NC_020940	AC	3	6	674384	674389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_020940	GAAT	2	8	674401	674408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_020940	GAAG	2	8	675439	675446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_020940	AGAA	2	8	683038	683045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_020940	A	7	7	854667	854673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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