MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 2621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_020940	AAAAT	2	10	418979	418988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1005	NC_020940	A	6	6	419046	419051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020940	T	8	8	424530	424537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1009	NC_020940	GAA	2	6	425366	425371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020940	A	8	8	425385	425392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020940	T	6	6	425395	425400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020940	GTT	2	6	425432	425437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020940	AGG	2	6	426882	426887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020940	AGG	2	6	427484	427489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020940	CGT	2	6	428964	428969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1017	NC_020940	CTCTT	2	10	429043	429052	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_020940	A	6	6	429084	429089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020940	T	7	7	429092	429098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020940	CT	3	6	430184	430189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_020940	A	6	6	430194	430199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020940	T	6	6	430210	430215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020940	CT	3	6	431207	431212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_020940	AACT	2	8	431254	431261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_020940	GAT	2	6	431286	431291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1031	NC_020940	A	7	7	431607	431613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020940	GA	3	6	433249	433254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_020940	GA	3	6	468974	468979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_020940	A	6	6	486144	486149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020940	CAAAA	2	10	486162	486171	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1136	NC_020940	A	8	8	486168	486175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020940	AC	3	6	486177	486182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_020940	GA	4	8	486222	486229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020940	CA	3	6	486259	486264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1141	NC_020940	ACT	3	9	486317	486325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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