MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 2622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020939	TAC	2	6	613274	613279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_020939	ATG	2	6	613291	613296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020939	A	6	6	613326	613331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020939	GTAT	2	8	613363	613370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020939	AC	3	6	613399	613404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_020939	CTC	2	6	618540	618545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_020939	A	6	6	618637	618642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020939	CT	3	6	618651	618656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_020939	AG	3	6	618693	618698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020939	A	6	6	618706	618711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020939	GGAA	2	8	618721	618728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020939	A	7	7	618733	618739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020939	TATT	2	8	619633	619640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020939	TAA	2	6	619642	619647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020939	AAAT	2	8	619665	619672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020939	T	7	7	619672	619678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020939	TCTTTT	2	12	619719	619730	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1518	NC_020939	T	6	6	619727	619732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020939	ATG	2	6	619733	619738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020939	TTA	2	6	619747	619752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020939	CTT	2	6	620744	620749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_020939	T	6	6	622249	622254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020939	CAG	2	6	622292	622297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_020939	CT	3	6	623617	623622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_020939	T	7	7	623645	623651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020939	T	6	6	623656	623661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020939	GTT	2	6	623675	623680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020939	T	6	6	623691	623696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020939	TTCT	2	8	623706	623713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_020939	TCT	2	6	625317	625322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_020939	GAT	2	6	625368	625373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020939	T	6	6	625401	625406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020939	TAAG	2	8	626686	626693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020939	A	6	6	626722	626727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020939	AGA	2	6	626735	626740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020939	GATT	2	8	626809	626816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_020939	CCT	2	6	630474	630479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_020939	T	6	6	631093	631098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020939	CT	3	6	631178	631183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_020939	TTTCC	2	10	631184	631193	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1543	NC_020939	CTTC	2	8	631219	631226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_020939	ATC	2	6	631232	631237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1546	NC_020939	TGG	2	6	633691	633696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020939	AT	3	6	635570	635575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020939	A	8	8	635578	635585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020939	T	6	6	635609	635614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020939	A	6	6	635676	635681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020939	CCTG	2	8	635767	635774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_020939	A	9	9	638591	638599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020939	CTCC	2	8	638603	638610	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1554	NC_020939	A	6	6	638611	638616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020939	TTC	2	6	638624	638629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1559	NC_020939	A	6	6	639190	639195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_020939	A	6	6	647740	647745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020939	A	8	8	647772	647779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020939	T	7	7	647812	647818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020939	A	6	6	647822	647827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020939	A	7	7	647829	647835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020939	GA	3	6	650705	650710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020939	GA	3	6	650717	650722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020939	AGG	2	6	650749	650754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1571	NC_020939	A	8	8	650772	650779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020939	AC	3	6	650793	650798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_020939	GCT	2	6	650799	650804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1589	NC_020939	A	6	6	656061	656066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_020939	A	7	7	665508	665514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_020939	GAT	2	6	675651	675656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_020939	GAAT	2	8	675835	675842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_020939	CAT	2	6	675844	675849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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