MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/440/LN complete genome

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020937	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020937	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020937	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020937	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020937	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020937	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020937	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020937	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020937	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020937	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020937	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020937	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020937	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020937	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020937	GA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020937	CT	3	6	27118	27123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020937	TC	3	6	28486	28491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020937	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020937	GA	3	6	36983	36988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020937	AT	3	6	37084	37089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020937	CT	3	6	39351	39356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020937	CT	3	6	40721	40726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020937	AG	3	6	42847	42852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020937	CT	3	6	42913	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020937	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020937	TC	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020937	TA	3	6	44487	44492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020937	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020937	TG	3	6	51921	51926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020937	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020937	GA	3	6	61387	61392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020937	AG	4	8	65406	65413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020937	TA	3	6	69725	69730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020937	CT	3	6	72461	72466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020937	TA	3	6	85825	85830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020937	TC	3	6	91046	91051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020937	GA	3	6	91178	91183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020937	CT	3	6	93528	93533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020937	TA	3	6	93694	93699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020937	AG	3	6	93737	93742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020937	AG	3	6	93834	93839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020937	GA	3	6	94056	94061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020937	TA	3	6	94673	94678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020937	TC	3	6	100549	100554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020937	AT	3	6	100600	100605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020937	GC	3	6	102706	102711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020937	TA	3	6	107276	107281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020937	TG	3	6	116530	116535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020937	AG	4	8	119118	119125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020937	GA	3	6	120940	120945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020937	TA	3	6	123248	123253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020937	GT	3	6	124238	124243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020937	CT	3	6	128774	128779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020937	TC	3	6	131096	131101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020937	AG	3	6	131173	131178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020937	AG	3	6	131198	131203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020937	TG	3	6	137611	137616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020937	AG	3	6	138856	138861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020937	AT	3	6	143151	143156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020937	AG	3	6	157958	157963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020937	TC	3	6	172431	172436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020937	AG	3	6	172563	172568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020937	CT	3	6	172581	172586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020937	TG	3	6	179069	179074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020937	TA	3	6	184263	184268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020937	GA	3	6	184376	184381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020937	GA	3	6	184479	184484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020937	GA	3	6	185119	185124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020937	GA	3	6	185151	185156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020937	AG	3	6	189205	189210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020937	AT	3	6	189707	189712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020937	AG	3	6	193457	193462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020937	TC	3	6	196449	196454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020937	CT	3	6	200207	200212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020937	GA	4	8	203266	203273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020937	CT	4	8	203314	203321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020937	TA	3	6	204895	204900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020937	AG	3	6	214586	214591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020937	TA	3	6	216140	216145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020937	CT	3	6	217783	217788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020937	TC	3	6	220784	220789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020937	AG	3	6	220815	220820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020937	TC	3	6	235014	235019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020937	AG	3	6	235040	235045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020937	AC	3	6	239963	239968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020937	GA	3	6	247049	247054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020937	TG	3	6	247159	247164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020937	AG	3	6	247959	247964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020937	GA	3	6	248838	248843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020937	AG	3	6	248963	248968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020937	TA	3	6	250784	250789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020937	AG	3	6	253075	253080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020937	TC	3	6	253101	253106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020937	TA	3	6	260942	260947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020937	AG	3	6	261022	261027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020937	CA	3	6	262749	262754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020937	TC	3	6	264648	264653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020937	CA	3	6	269997	270002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020937	TA	3	6	270199	270204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020937	AT	4	8	280759	280766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020937	CT	3	6	281611	281616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020937	TC	4	8	281702	281709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020937	TC	3	6	283393	283398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020937	TC	3	6	283450	283455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020937	CT	3	6	283923	283928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020937	AT	3	6	295937	295942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020937	CA	3	6	298266	298271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020937	GA	3	6	302997	303002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020937	AG	3	6	312215	312220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020937	CT	3	6	344174	344179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020937	CT	3	6	347245	347250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020937	TC	3	6	351471	351476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020937	CT	3	6	355387	355392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020937	AC	3	6	358720	358725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020937	GA	3	6	360630	360635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020937	TC	3	6	360708	360713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020937	TA	3	6	360909	360914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020937	GC	3	6	362438	362443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020937	TC	3	6	362741	362746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020937	CT	4	8	378043	378050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020937	CG	3	6	387882	387887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020937	CA	3	6	388932	388937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020937	TC	3	6	391479	391484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020937	CT	3	6	391969	391974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020937	GA	3	6	392099	392104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020937	GA	3	6	392223	392228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020937	CT	3	6	406331	406336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020937	CT	3	6	407316	407321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020937	CT	3	6	426051	426056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020937	CT	3	6	427074	427079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020937	AG	3	6	427420	427425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020937	GA	3	6	429115	429120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020937	AC	3	6	433113	433118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020937	CT	3	6	437384	437389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020937	AC	3	6	437422	437427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020937	CA	3	6	439891	439896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020937	CT	3	6	441295	441300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020937	CT	3	6	450577	450582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020937	AG	3	6	456718	456723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020937	TC	3	6	463256	463261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020937	AT	3	6	463325	463330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020937	GA	4	8	464699	464706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020937	TA	3	6	464742	464747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020937	TC	3	6	476567	476572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020937	AC	3	6	482109	482114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020937	GA	4	8	482154	482161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020937	CA	3	6	482191	482196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020937	TC	3	6	482232	482237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020937	AC	3	6	486667	486672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020937	AG	3	6	486829	486834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020937	CT	3	6	486848	486853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020937	AG	3	6	487141	487146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020937	CT	3	6	490127	490132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020937	CT	3	6	490645	490650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.