MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/440/LN complete genome

Total Repeats: 2650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020937	AGG	2	6	184581	184586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020937	A	6	6	184935	184940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020937	T	8	8	184946	184953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020937	ATA	2	6	184996	185001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020937	A	7	7	185001	185007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020937	TAT	2	6	185079	185084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020937	GA	3	6	185119	185124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020937	GA	3	6	185151	185156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020937	AGA	2	6	185161	185166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020937	GTT	2	6	186434	186439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020937	GTT	3	9	186834	186842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020937	T	6	6	186848	186853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020937	T	7	7	186856	186862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020937	T	6	6	186868	186873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020937	T	8	8	186918	186925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020937	A	6	6	186941	186946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020937	T	6	6	186963	186968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020937	ATC	2	6	188541	188546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020937	CGATA	2	10	188569	188578	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_020937	T	6	6	188582	188587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020937	TCC	2	6	188602	188607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_020937	ACA	3	9	188608	188616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020937	AGT	2	6	188626	188631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020937	AAAC	2	8	188651	188658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020937	TGC	2	6	188717	188722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020937	AGT	3	9	188785	188793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020937	AGT	2	6	188808	188813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020937	TTG	2	6	188816	188821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020937	TAT	2	6	188896	188901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020937	T	6	6	188915	188920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020937	GCA	2	6	188968	188973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020937	CTT	2	6	188983	188988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020937	GGAC	2	8	189010	189017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_020937	AAG	2	6	189120	189125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020937	AG	3	6	189205	189210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020937	AT	3	6	189707	189712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020937	TGT	2	6	189721	189726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020937	GTT	2	6	190089	190094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020937	GCA	2	6	190142	190147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020937	CTTT	2	8	190222	190229	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_020937	AAG	2	6	190269	190274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020937	T	6	6	190319	190324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020937	ATT	2	6	190332	190337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020937	T	6	6	190348	190353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020937	TATGAA	3	18	192324	192341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020937	AGA	2	6	192386	192391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020937	AAC	2	6	192393	192398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020937	ATA	2	6	192413	192418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020937	T	6	6	192438	192443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020937	AGA	2	6	193377	193382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020937	A	8	8	193434	193441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020937	AG	3	6	193457	193462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020937	AAT	2	6	193467	193472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020937	T	9	9	193487	193495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020937	T	6	6	193534	193539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020937	TAC	2	6	193578	193583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_020937	ATT	2	6	193587	193592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020937	A	8	8	196382	196389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020937	CTT	2	6	196421	196426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_020937	A	8	8	196431	196438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020937	TC	3	6	196449	196454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_020937	CTT	2	6	196458	196463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020937	ACGA	2	8	199068	199075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_020937	CTAAG	2	10	199234	199243	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
565	NC_020937	T	6	6	199342	199347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020937	GAAA	2	8	199354	199361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020937	A	7	7	199359	199365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020937	T	6	6	200132	200137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020937	TAAA	2	8	200154	200161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020937	CT	3	6	200207	200212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_020937	AAT	2	6	200254	200259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020937	TAG	2	6	200290	200295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020937	AAT	2	6	200303	200308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020937	AAG	2	6	200401	200406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_020937	T	7	7	203296	203302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020937	CT	4	8	203314	203321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_020937	A	6	6	203323	203328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020937	TA	3	6	204895	204900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020937	CCTT	2	8	212488	212495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_020937	GAA	2	6	212510	212515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020937	TTG	2	6	212527	212532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020937	A	6	6	212539	212544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020937	CTC	2	6	213306	213311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_020937	T	7	7	213320	213326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020937	A	7	7	214554	214560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020937	TAA	2	6	214561	214566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020937	AG	3	6	214586	214591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020937	A	6	6	214611	214616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020937	GAA	2	6	214621	214626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020937	TA	3	6	216140	216145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020937	GTC	2	6	216159	216164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020937	CTAT	2	8	216214	216221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_020937	T	7	7	216229	216235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020937	ATT	2	6	216332	216337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020937	TCT	2	6	216358	216363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_020937	GTC	2	6	216386	216391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020937	TCC	2	6	216410	216415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_020937	ATG	2	6	216433	216438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020937	GCAA	2	8	216458	216465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_020937	TTTTAC	2	12	217617	217628	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_020937	A	8	8	217680	217687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020937	TAA	2	6	217735	217740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020937	ATTTC	2	10	217762	217771	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
606	NC_020937	CT	3	6	217783	217788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_020937	AATT	2	8	217795	217802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020937	CTTG	2	8	218144	218151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_020937	T	6	6	218199	218204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020937	TC	3	6	220784	220789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_020937	AG	3	6	220815	220820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020937	CAATA	2	10	220885	220894	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_020937	TAA	2	6	221858	221863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020937	AAAC	2	8	221874	221881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_020937	T	8	8	224349	224356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020937	TCCT	2	8	224498	224505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_020937	GTT	2	6	224541	224546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020937	AGA	2	6	224550	224555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020937	ATT	2	6	224587	224592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020937	AAC	2	6	230989	230994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_020937	AGA	2	6	231016	231021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020937	GAG	2	6	231033	231038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020937	GCT	2	6	231085	231090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020937	ACC	2	6	231094	231099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_020937	A	6	6	231125	231130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020937	ACT	2	6	231189	231194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020937	TGT	2	6	234994	234999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020937	TC	3	6	235014	235019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_020937	AG	3	6	235040	235045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020937	CAT	2	6	235109	235114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020937	T	8	8	235116	235123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020937	A	6	6	238212	238217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020937	AC	3	6	239963	239968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_020937	TCT	2	6	240049	240054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020937	AAAT	2	8	240113	240120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020937	AAGA	2	8	240132	240139	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020937	T	6	6	240192	240197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020937	AAG	2	6	242723	242728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020937	TTTC	2	8	242733	242740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
640	NC_020937	TAAA	2	8	243567	243574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_020937	TTA	2	6	243610	243615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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