MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020936	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020936	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020936	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020936	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020936	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020936	TA	3	6	13924	13929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020936	TA	4	8	14148	14155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020936	AG	3	6	18100	18105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020936	GA	3	6	18113	18118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020936	CT	3	6	19035	19040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020936	AG	3	6	21101	21106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020936	GA	3	6	21259	21264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020936	AG	3	6	21776	21781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020936	CT	3	6	21845	21850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020936	GA	3	6	27097	27102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020936	CT	3	6	27104	27109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020936	TC	3	6	28472	28477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020936	AG	3	6	28555	28560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020936	GA	3	6	36969	36974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020936	AT	3	6	37070	37075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020936	CT	3	6	39337	39342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020936	CT	3	6	40707	40712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020936	AG	3	6	42833	42838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020936	CT	3	6	42899	42904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020936	AG	3	6	43229	43234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020936	TC	3	6	44321	44326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020936	TA	3	6	44473	44478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020936	AG	3	6	48555	48560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020936	TG	4	8	51904	51911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020936	GA	3	6	56174	56179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020936	GA	3	6	61378	61383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020936	AG	4	8	65397	65404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020936	TA	3	6	69716	69721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020936	CT	3	6	72452	72457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020936	TA	3	6	85816	85821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020936	TC	3	6	91037	91042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020936	GA	3	6	91169	91174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020936	CT	3	6	93519	93524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020936	TA	3	6	93685	93690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020936	AG	3	6	93728	93733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020936	AG	3	6	93825	93830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020936	GA	3	6	94047	94052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020936	TA	3	6	94664	94669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020936	TC	3	6	100541	100546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020936	AT	3	6	100592	100597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020936	GC	3	6	102698	102703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020936	TA	3	6	107268	107273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020936	TG	3	6	116522	116527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020936	AG	4	8	119110	119117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020936	GA	3	6	120932	120937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020936	TA	3	6	123240	123245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020936	GT	3	6	124230	124235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020936	CT	3	6	128766	128771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020936	TC	3	6	131088	131093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020936	AG	3	6	131165	131170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020936	AG	3	6	131190	131195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020936	TG	3	6	137603	137608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020936	AG	3	6	138848	138853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020936	AT	3	6	143143	143148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020936	GA	3	6	152383	152388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020936	AG	3	6	157950	157955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020936	TC	3	6	172422	172427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020936	AG	3	6	172554	172559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020936	CT	3	6	172572	172577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020936	TG	3	6	179061	179066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020936	TA	3	6	184256	184261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020936	GA	3	6	184369	184374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020936	GA	3	6	184472	184477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020936	GA	3	6	185113	185118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020936	GA	3	6	185145	185150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020936	AG	3	6	189199	189204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020936	AT	3	6	189701	189706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020936	AG	3	6	193479	193484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020936	CT	3	6	200229	200234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020936	GA	4	8	203288	203295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020936	CT	4	8	203336	203343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020936	TA	3	6	204917	204922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020936	AG	3	6	214608	214613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020936	TA	3	6	216162	216167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020936	CT	3	6	217805	217810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020936	TC	3	6	220806	220811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020936	AG	3	6	220837	220842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020936	TC	3	6	235036	235041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020936	AG	3	6	235062	235067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020936	AC	3	6	239985	239990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020936	GA	3	6	247071	247076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020936	TG	3	6	247181	247186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020936	AG	3	6	247981	247986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020936	GA	3	6	248860	248865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020936	AG	3	6	248985	248990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020936	TA	3	6	250806	250811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020936	AG	3	6	253097	253102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020936	TC	3	6	253123	253128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020936	TA	3	6	260964	260969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020936	AG	3	6	261044	261049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020936	CA	3	6	262771	262776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020936	TC	3	6	264670	264675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020936	CA	3	6	270019	270024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020936	TA	3	6	270221	270226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020936	AT	4	8	280781	280788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020936	CT	3	6	281633	281638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020936	TC	4	8	281724	281731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020936	TC	3	6	283415	283420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020936	TC	3	6	283472	283477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020936	CT	3	6	283945	283950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020936	AT	3	6	295959	295964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020936	CA	3	6	298288	298293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020936	GA	3	6	303019	303024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020936	AG	3	6	312237	312242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020936	CT	3	6	344195	344200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020936	CT	3	6	347266	347271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020936	TC	3	6	351492	351497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020936	CT	3	6	355408	355413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020936	AC	3	6	358741	358746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020936	GA	3	6	360650	360655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020936	TC	3	6	360728	360733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020936	TA	3	6	360929	360934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020936	GC	3	6	362458	362463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020936	TC	3	6	362761	362766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020936	CT	4	8	378064	378071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020936	CG	3	6	387903	387908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020936	CA	3	6	388953	388958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020936	TC	3	6	391500	391505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020936	CT	3	6	391990	391995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020936	GA	3	6	392120	392125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020936	GA	3	6	392244	392249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020936	CT	3	6	406352	406357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020936	CT	3	6	407337	407342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020936	CT	3	6	426072	426077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020936	CT	3	6	427095	427100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020936	AG	3	6	427441	427446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020936	GA	3	6	429136	429141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020936	AC	3	6	433134	433139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020936	CT	3	6	437405	437410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020936	AC	3	6	437443	437448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020936	CA	3	6	439912	439917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020936	CT	3	6	441316	441321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020936	CT	3	6	450598	450603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020936	AG	3	6	456739	456744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020936	TC	3	6	463277	463282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020936	AT	3	6	463346	463351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020936	GA	4	8	464720	464727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020936	TA	3	6	464763	464768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020936	TC	3	6	476588	476593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020936	AC	3	6	482130	482135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020936	GA	4	8	482175	482182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020936	CA	3	6	482212	482217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020936	TC	3	6	482253	482258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020936	AC	3	6	486688	486693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020936	AG	3	6	486850	486855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020936	CT	3	6	486869	486874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020936	AG	3	6	487162	487167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020936	CT	3	6	490149	490154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020936	CT	3	6	490667	490672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.