MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020936	GTT	2	6	403570	403575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020936	CCT	2	6	403576	403581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_020936	CAAA	2	8	403631	403638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_020936	A	6	6	403653	403658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020936	GAG	2	6	403693	403698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020936	A	6	6	403726	403731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020936	T	6	6	403768	403773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020936	T	6	6	403779	403784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020936	TAA	2	6	406030	406035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020936	A	6	6	406034	406039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020936	AAC	2	6	406048	406053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_020936	TAA	2	6	406080	406085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020936	TAA	2	6	406115	406120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020936	TATCT	2	10	406258	406267	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_020936	TTA	2	6	406282	406287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020936	T	6	6	406304	406309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020936	GGA	2	6	406328	406333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020936	CTT	2	6	406339	406344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_020936	CT	3	6	406352	406357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_020936	T	6	6	406376	406381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020936	TAG	2	6	406389	406394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020936	CT	3	6	407337	407342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_020936	TTA	2	6	408866	408871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020936	TAA	2	6	408888	408893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020936	AGA	2	6	408916	408921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020936	TTA	2	6	408955	408960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020936	TGA	2	6	408966	408971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020936	CCA	2	6	412917	412922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_020936	GCA	2	6	412971	412976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020936	GTATA	2	10	412977	412986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020936	AGCAA	2	10	413013	413022	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_020936	ATTT	2	8	413048	413055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020936	AGAA	2	8	413058	413065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020936	A	6	6	414821	414826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020936	CAA	2	6	414840	414845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020936	ATTA	2	8	414847	414854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020936	AAC	2	6	414856	414861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020936	AAAAT	2	10	414862	414871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020936	A	7	7	414884	414890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020936	A	6	6	414929	414934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020936	T	8	8	420419	420426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020936	TGC	2	6	420430	420435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020936	TTC	2	6	420436	420441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_020936	GAA	2	6	421255	421260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020936	A	7	7	421274	421280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020936	T	6	6	421283	421288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020936	TTA	2	6	421311	421316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020936	GTT	2	6	421320	421325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020936	CAA	2	6	422761	422766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_020936	A	6	6	422765	422770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020936	GAT	2	6	423167	423172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020936	A	7	7	423205	423211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020936	GTAA	2	8	423242	423249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020936	ACATCA	2	12	423279	423290	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_020936	GAAA	2	8	423291	423298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020936	CTG	2	6	423351	423356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_020936	AGG	2	6	423372	423377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020936	CGT	2	6	424852	424857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_020936	TTCT	2	8	424910	424917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_020936	CTCTT	2	10	424931	424940	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_020936	A	6	6	424972	424977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020936	T	7	7	424980	424986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020936	CT	3	6	426072	426077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_020936	A	6	6	426082	426087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020936	T	6	6	426098	426103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020936	CT	3	6	427095	427100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_020936	AACT	2	8	427142	427149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_020936	GAT	2	6	427174	427179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020936	A	8	8	427222	427229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020936	A	7	7	427426	427432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020936	AG	3	6	427441	427446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020936	TAAAA	2	10	427473	427482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020936	CAAA	2	8	427489	427496	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_020936	A	7	7	427494	427500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020936	GA	3	6	429136	429141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020936	CTT	2	6	429143	429148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020936	ACTC	2	8	432180	432187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_020936	A	8	8	432233	432240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020936	TCT	2	6	433104	433109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_020936	AC	3	6	433134	433139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_020936	AGAAA	2	10	433147	433156	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020936	A	7	7	433175	433181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020936	CTCTT	2	10	433186	433195	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1084	NC_020936	GAAGA	2	10	433196	433205	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020936	ATG	2	6	433215	433220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020936	TAT	2	6	433439	433444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020936	A	6	6	433467	433472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020936	AAATT	2	10	433475	433484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020936	AATTT	2	10	433496	433505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020936	T	6	6	433551	433556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020936	TCC	2	6	437181	437186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_020936	AAC	2	6	437206	437211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_020936	AAAC	2	8	437212	437219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_020936	GTA	2	6	437228	437233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020936	TCC	2	6	437254	437259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_020936	TCT	2	6	437329	437334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_020936	AAAT	2	8	437354	437361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020936	AGC	2	6	437382	437387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_020936	CT	3	6	437405	437410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_020936	TTC	2	6	437437	437442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020936	AC	3	6	437443	437448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_020936	ACA	2	6	439536	439541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_020936	CA	3	6	439912	439917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_020936	TAAC	2	8	439920	439927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_020936	CAA	2	6	439928	439933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_020936	CCT	2	6	439958	439963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_020936	AAG	2	6	439985	439990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020936	TCT	2	6	440006	440011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020936	T	6	6	440025	440030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020936	CT	3	6	441316	441321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_020936	CCA	2	6	441367	441372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_020936	GGT	2	6	441403	441408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020936	CTA	2	6	443613	443618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_020936	AATT	2	8	444784	444791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020936	AAAC	2	8	444797	444804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_020936	TTA	2	6	444820	444825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020936	A	7	7	444866	444872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020936	CTTC	2	8	444939	444946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_020936	T	8	8	450576	450583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020936	A	6	6	450584	450589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020936	CT	3	6	450598	450603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_020936	TCTT	2	8	450604	450611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_020936	TAAT	2	8	450617	450624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020936	CAT	2	6	450698	450703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_020936	CTA	2	6	450719	450724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_020936	ATT	2	6	452906	452911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020936	T	6	6	452923	452928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020936	CTT	2	6	452983	452988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_020936	T	6	6	453040	453045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020936	GGA	2	6	453100	453105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020936	A	6	6	453961	453966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020936	GCT	2	6	454118	454123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020936	AAC	2	6	454187	454192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020936	GAG	2	6	454231	454236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020936	GCAA	2	8	454271	454278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_020936	T	7	7	454331	454337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020936	A	7	7	455344	455350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020936	GAA	2	6	456578	456583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_020936	A	6	6	456608	456613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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