MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020935	CTT	2	6	184387	184392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_020935	GA	3	6	184430	184435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020935	GTT	2	6	184441	184446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020935	GAG	2	6	184462	184467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020935	GAA	2	6	184482	184487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020935	TTG	2	6	184493	184498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020935	AGG	2	6	184532	184537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020935	A	6	6	184886	184891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020935	T	8	8	184897	184904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020935	ATA	2	6	184947	184952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020935	A	8	8	184952	184959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020935	TAT	2	6	185031	185036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020935	GA	3	6	185071	185076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020935	GA	3	6	185103	185108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020935	AGA	2	6	185113	185118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020935	GTT	2	6	186386	186391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020935	GTT	3	9	186786	186794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020935	T	6	6	186800	186805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020935	T	7	7	186808	186814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020935	T	6	6	186820	186825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020935	T	8	8	186870	186877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020935	A	6	6	186893	186898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020935	T	6	6	186915	186920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020935	ATC	2	6	188493	188498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020935	CGATA	2	10	188521	188530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_020935	T	6	6	188534	188539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020935	TCC	2	6	188554	188559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_020935	ACA	3	9	188560	188568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020935	AGT	2	6	188578	188583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020935	AAAC	2	8	188603	188610	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_020935	TGC	2	6	188669	188674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020935	AGT	3	9	188737	188745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020935	AGT	2	6	188760	188765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020935	TTG	2	6	188768	188773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020935	TAT	2	6	188848	188853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020935	T	6	6	188867	188872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020935	GCA	2	6	188920	188925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_020935	CTT	2	6	188935	188940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020935	GGAC	2	8	188962	188969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
540	NC_020935	AAG	2	6	189072	189077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020935	AG	3	6	189157	189162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020935	AT	3	6	189659	189664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020935	TGT	2	6	189673	189678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020935	GTT	2	6	190041	190046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020935	GCA	2	6	190094	190099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_020935	CTTT	2	8	190174	190181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_020935	AAG	2	6	190221	190226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020935	ATT	2	6	190283	190288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020935	T	6	6	190299	190304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020935	TATGAA	3	18	192275	192292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020935	AGA	2	6	192337	192342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020935	AAC	2	6	192344	192349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020935	ATA	2	6	192364	192369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020935	T	6	6	192389	192394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020935	AGA	2	6	193327	193332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020935	A	7	7	193384	193390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020935	A	7	7	193414	193420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020935	AG	3	6	193436	193441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020935	AAT	2	6	193446	193451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020935	T	9	9	193466	193474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020935	T	6	6	193513	193518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020935	TAC	2	6	193557	193562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020935	ATT	2	6	193566	193571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020935	A	8	8	196361	196368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020935	CTT	2	6	196400	196405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_020935	A	8	8	196410	196417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020935	TC	3	6	196428	196433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_020935	CTT	2	6	196437	196442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020935	ACGA	2	8	199044	199051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_020935	CTAAG	2	10	199210	199219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
571	NC_020935	T	6	6	199318	199323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020935	GAAA	2	8	199330	199337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020935	A	7	7	199335	199341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020935	T	6	6	200108	200113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020935	TAAA	2	8	200130	200137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020935	CT	3	6	200183	200188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_020935	AAT	2	6	200230	200235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020935	TAG	2	6	200266	200271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020935	AAT	2	6	200279	200284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020935	AAG	2	6	200377	200382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020935	CTT	2	6	200388	200393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_020935	GA	4	8	203242	203249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020935	T	7	7	203272	203278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020935	CT	4	8	203290	203297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_020935	A	6	6	203299	203304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020935	TA	3	6	204871	204876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020935	CCTT	2	8	212464	212471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_020935	GAA	2	6	212486	212491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020935	TTG	2	6	212503	212508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020935	A	6	6	212515	212520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020935	CTC	2	6	213283	213288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_020935	T	7	7	213297	213303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020935	A	7	7	214531	214537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020935	TAA	2	6	214538	214543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020935	AG	3	6	214563	214568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020935	A	6	6	214588	214593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020935	GAA	2	6	214598	214603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020935	TA	3	6	216117	216122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020935	GTC	2	6	216136	216141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020935	CTAT	2	8	216191	216198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_020935	T	7	7	216206	216212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020935	ATT	2	6	216309	216314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020935	TCT	2	6	216335	216340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_020935	GTC	2	6	216363	216368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_020935	TCC	2	6	216387	216392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_020935	ATG	2	6	216410	216415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020935	GCAA	2	8	216435	216442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_020935	TTTTAC	2	12	217594	217605	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
609	NC_020935	A	8	8	217657	217664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020935	TAA	2	6	217711	217716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020935	ATTTC	2	10	217738	217747	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_020935	CT	3	6	217759	217764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_020935	AATT	2	8	217771	217778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020935	CTTG	2	8	218120	218127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_020935	T	6	6	218175	218180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020935	TC	3	6	220760	220765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_020935	AG	3	6	220791	220796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020935	CAATA	2	10	220861	220870	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
619	NC_020935	TAA	2	6	221834	221839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020935	AAAC	2	8	221850	221857	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_020935	T	8	8	224325	224332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020935	TCCT	2	8	224474	224481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_020935	GTT	2	6	224517	224522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020935	AGA	2	6	224526	224531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020935	ATT	2	6	224563	224568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020935	AAC	2	6	230965	230970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020935	AGA	2	6	230992	230997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020935	GAG	2	6	231009	231014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020935	GCT	2	6	231061	231066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020935	ACC	2	6	231070	231075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_020935	A	6	6	231101	231106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020935	ACT	2	6	231165	231170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_020935	TGT	2	6	234970	234975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020935	TC	3	6	234990	234995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020935	AG	3	6	235016	235021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020935	CAT	2	6	235085	235090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_020935	T	8	8	235092	235099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020935	A	6	6	238188	238193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020935	AC	3	6	239939	239944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
640	NC_020935	TCT	2	6	240025	240030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_020935	AAAT	2	8	240089	240096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020935	AAGA	2	8	240108	240115	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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