MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020934	T	10	10	965549	965558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2503	NC_020934	TG	3	6	965587	965592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020934	TCTT	2	8	965621	965628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2505	NC_020934	AAC	2	6	965661	965666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_020934	TAT	2	6	965672	965677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020934	AGA	2	6	965678	965683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020934	TTA	2	6	970736	970741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_020934	T	7	7	970766	970772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2511	NC_020934	CAAA	2	8	970813	970820	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_020934	T	6	6	970877	970882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020934	TCTT	2	8	970886	970893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_020934	AG	3	6	970999	971004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_020934	GCT	2	6	971009	971014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_020934	A	7	7	971027	971033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020934	A	6	6	971038	971043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_020934	CAT	2	6	971064	971069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2520	NC_020934	ATA	2	6	971219	971224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020934	CT	4	8	971252	971259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2553	NC_020934	ATAAA	2	10	981544	981553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2559	NC_020934	T	6	6	986876	986881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2566	NC_020934	T	8	8	989764	989771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020934	GT	3	6	989772	989777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020934	CTAA	2	8	989793	989800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2569	NC_020934	TAAG	2	8	989808	989815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2574	NC_020934	T	8	8	992406	992413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020934	GTA	2	6	992453	992458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2603	NC_020934	CGCC	2	8	1002930	1002937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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2605	NC_020934	AG	3	6	1004761	1004766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_020934	CT	3	6	1004775	1004780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_020934	GTG	2	6	1004842	1004847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_020934	TCA	2	6	1004858	1004863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2610	NC_020934	CAA	2	6	1004975	1004980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_020934	AG	3	6	1005062	1005067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_020934	T	6	6	1005088	1005093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_020934	AAG	2	6	1005094	1005099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_020934	TATTT	2	10	1005111	1005120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_020934	GTG	2	6	1005138	1005143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2619	NC_020934	CTGT	2	8	1005326	1005333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_020934	TA	3	6	1005343	1005348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_020934	ATT	2	6	1005373	1005378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_020934	TAA	2	6	1006754	1006759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_020934	TTG	2	6	1008688	1008693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_020934	TAA	2	6	1008705	1008710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_020934	AGG	2	6	1014744	1014749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2627	NC_020934	AT	3	6	1014824	1014829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_020934	AGG	2	6	1014834	1014839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_020934	CAT	2	6	1014850	1014855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_020934	T	8	8	1014934	1014941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_020934	AGA	2	6	1014993	1014998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_020934	AGA	2	6	1015008	1015013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_020934	GGT	2	6	1015082	1015087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_020934	TCT	2	6	1015177	1015182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.