MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 2651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020933	A	7	7	400689	400695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020933	AAGCG	2	10	400745	400754	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_020933	A	6	6	401418	401423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020933	TCT	2	6	401434	401439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020933	TTC	2	6	401458	401463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020933	GAA	2	6	401498	401503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020933	TCAT	2	8	401510	401517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_020933	AGA	2	6	401579	401584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020933	GTT	2	6	403585	403590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020933	CCT	2	6	403591	403596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_020933	CAAA	2	8	403646	403653	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_020933	A	6	6	403668	403673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020933	GAG	2	6	403708	403713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020933	A	6	6	403741	403746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020933	T	6	6	403783	403788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020933	T	6	6	403794	403799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020933	TAA	2	6	406045	406050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020933	A	6	6	406049	406054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020933	AAC	2	6	406063	406068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_020933	TAA	2	6	406095	406100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020933	TAA	2	6	406130	406135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020933	TATCT	2	10	406273	406282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1023	NC_020933	TTA	2	6	406297	406302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020933	T	6	6	406319	406324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020933	GGA	2	6	406343	406348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020933	CTT	2	6	406354	406359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_020933	CT	3	6	406367	406372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_020933	T	6	6	406391	406396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020933	TAG	2	6	406404	406409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020933	CT	3	6	407352	407357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_020933	TTA	2	6	408881	408886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020933	TAA	2	6	408903	408908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020933	AGA	2	6	408931	408936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020933	TTA	2	6	408970	408975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020933	TGA	2	6	408981	408986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020933	CCA	2	6	412932	412937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_020933	GCA	2	6	412986	412991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020933	GTATA	2	10	412992	413001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020933	AGCAA	2	10	413028	413037	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_020933	ATTT	2	8	413063	413070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020933	AGAA	2	8	413073	413080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020933	A	6	6	414836	414841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020933	CAA	2	6	414855	414860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_020933	ATTA	2	8	414862	414869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020933	AAC	2	6	414871	414876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_020933	AAAAT	2	10	414877	414886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020933	A	7	7	414899	414905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020933	A	6	6	414944	414949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020933	T	8	8	420434	420441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020933	TGC	2	6	420445	420450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_020933	TTC	2	6	420451	420456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020933	GAA	2	6	421270	421275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020933	A	7	7	421289	421295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020933	T	6	6	421298	421303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020933	TTA	2	6	421326	421331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020933	GTT	2	6	421335	421340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020933	CAA	2	6	422776	422781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_020933	A	6	6	422780	422785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020933	GAT	2	6	423182	423187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020933	A	7	7	423220	423226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020933	GTAA	2	8	423257	423264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020933	ACATCA	2	12	423294	423305	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_020933	GAAA	2	8	423306	423313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020933	CTG	2	6	423366	423371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020933	AGG	2	6	423387	423392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020933	CGT	2	6	424867	424872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_020933	TTCT	2	8	424925	424932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_020933	CTCTT	2	10	424946	424955	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1069	NC_020933	A	6	6	424987	424992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020933	T	7	7	424995	425001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020933	CT	3	6	426087	426092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_020933	A	6	6	426097	426102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020933	T	6	6	426113	426118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020933	CT	3	6	427110	427115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_020933	AACT	2	8	427157	427164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_020933	GAT	2	6	427189	427194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020933	A	8	8	427237	427244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020933	A	7	7	427441	427447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020933	AG	3	6	427456	427461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020933	TAAAA	2	10	427488	427497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020933	CAAA	2	8	427504	427511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_020933	A	7	7	427509	427515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020933	GA	3	6	429151	429156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020933	CTT	2	6	429158	429163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_020933	ACTC	2	8	432195	432202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_020933	A	8	8	432248	432255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020933	TCT	2	6	433119	433124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_020933	AC	3	6	433149	433154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_020933	AGAAA	2	10	433162	433171	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020933	A	7	7	433190	433196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020933	CTCTT	2	10	433201	433210	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1092	NC_020933	GAAGA	2	10	433211	433220	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020933	ATG	2	6	433230	433235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020933	TAT	2	6	433454	433459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020933	A	6	6	433482	433487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020933	AAATT	2	10	433490	433499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020933	AATTT	2	10	433511	433520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020933	T	6	6	433566	433571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020933	TCC	2	6	437196	437201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_020933	AAC	2	6	437221	437226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020933	AAAC	2	8	437227	437234	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_020933	GTA	2	6	437243	437248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020933	TCC	2	6	437269	437274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_020933	TCT	2	6	437344	437349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_020933	AAAT	2	8	437369	437376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020933	AGC	2	6	437397	437402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_020933	CT	3	6	437420	437425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_020933	TTC	2	6	437452	437457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020933	AC	3	6	437458	437463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_020933	ACA	2	6	439551	439556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_020933	CA	3	6	439927	439932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_020933	TAAC	2	8	439935	439942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_020933	CAA	2	6	439943	439948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_020933	CCT	2	6	439973	439978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_020933	AAG	2	6	440000	440005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020933	TCT	2	6	440021	440026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020933	T	6	6	440040	440045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020933	CT	3	6	441331	441336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_020933	CCA	2	6	441382	441387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_020933	GGT	2	6	441418	441423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020933	CTA	2	6	443628	443633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_020933	AATT	2	8	444799	444806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020933	AAAC	2	8	444812	444819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_020933	TTA	2	6	444835	444840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020933	A	7	7	444881	444887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020933	CTTC	2	8	444954	444961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_020933	T	8	8	450591	450598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020933	A	6	6	450599	450604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020933	CT	3	6	450613	450618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_020933	TCTT	2	8	450619	450626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_020933	TAAT	2	8	450632	450639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020933	CAT	2	6	450713	450718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020933	CTA	2	6	450734	450739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020933	ATT	2	6	452921	452926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020933	T	6	6	452938	452943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020933	CTT	2	6	452998	453003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_020933	T	6	6	453055	453060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020933	GGA	2	6	453115	453120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_020933	GCT	2	6	454133	454138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1272	NC_020933	TCC	3	9	508199	508207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1273	NC_020933	CAT	2	6	508217	508222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_020933	CAG	2	6	508227	508232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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