MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020932	AAGT	2	8	828555	828562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2003	NC_020932	AAG	2	6	828666	828671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_020932	AAG	2	6	828695	828700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_020932	TCT	2	6	828736	828741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_020932	AAGA	2	8	828779	828786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_020932	AG	3	6	831389	831394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_020932	GAT	2	6	831406	831411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_020932	T	6	6	831458	831463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_020932	AGGG	2	8	831472	831479	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_020932	G	6	6	831477	831482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_020932	AG	3	6	831506	831511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_020932	CTT	2	6	831517	831522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_020932	CT	3	6	831528	831533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_020932	ATG	2	6	831548	831553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_020932	TTTTTA	2	12	831561	831572	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_020932	AG	3	6	831585	831590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_020932	GTT	2	6	831599	831604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_020932	GA	3	6	831608	831613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_020932	TTA	2	6	831633	831638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2025	NC_020932	AGA	2	6	841952	841957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_020932	T	8	8	841978	841985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_020932	CTT	2	6	843366	843371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2032	NC_020932	AG	3	6	843593	843598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_020932	AG	3	6	843602	843607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2045	NC_020932	A	8	8	850679	850686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_020932	A	7	7	850688	850694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2053	NC_020932	GAAG	2	8	850851	850858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_020932	CGC	2	6	851421	851426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_020932	GT	3	6	851427	851432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_020932	AAG	2	6	851518	851523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_020932	CAG	2	6	851542	851547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2099	NC_020932	ATA	2	6	853992	853997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_020932	GC	3	6	854507	854512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2110	NC_020932	G	6	6	854606	854611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2112	NC_020932	GTA	2	6	854881	854886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2114	NC_020932	ATT	2	6	855064	855069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2128	NC_020932	GAA	2	6	856442	856447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_020932	TGT	2	6	856449	856454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_020932	CTT	2	6	856463	856468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_020932	GAA	2	6	856478	856483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_020932	A	6	6	857861	857866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_020932	T	6	6	857876	857881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_020932	TTA	2	6	857888	857893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_020932	TTA	2	6	858299	858304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2137	NC_020932	TCC	2	6	859612	859617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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