MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020932	AGCA	2	8	597798	597805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_020932	A	6	6	597815	597820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020932	TAC	2	6	597822	597827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_020932	GA	3	6	599514	599519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020932	TAG	2	6	600117	600122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020932	AGA	2	6	600132	600137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020932	GGA	2	6	600155	600160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020932	T	6	6	602098	602103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020932	TTC	2	6	602126	602131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_020932	CCT	2	6	602145	602150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_020932	CTAC	2	8	602187	602194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_020932	TAGGGG	2	12	602256	602267	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020932	TA	3	6	602426	602431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020932	CCA	2	6	602480	602485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_020932	TTA	2	6	602513	602518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020932	TC	3	6	602528	602533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_020932	TCT	2	6	602620	602625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_020932	CTT	2	6	602636	602641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_020932	CAA	2	6	602644	602649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_020932	TTGC	2	8	602731	602738	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_020932	CCT	2	6	602761	602766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_020932	CT	3	6	603119	603124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_020932	A	6	6	603621	603626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020932	AT	3	6	604355	604360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020932	TTC	2	6	604372	604377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_020932	T	6	6	604408	604413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020932	A	9	9	604461	604469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020932	T	7	7	607579	607585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020932	ACT	2	6	607631	607636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_020932	TC	3	6	607654	607659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_020932	TAT	2	6	607660	607665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020932	AC	3	6	607678	607683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_020932	ATCC	2	8	607698	607705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_020932	CGC	2	6	607712	607717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_020932	CT	3	6	607735	607740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_020932	TCT	2	6	607760	607765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_020932	AAG	2	6	607787	607792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020932	GAC	2	6	607797	607802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_020932	TAC	2	6	607805	607810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_020932	ATG	2	6	607822	607827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020932	A	6	6	607857	607862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020932	AC	3	6	607930	607935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_020932	A	6	6	613168	613173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020932	CT	3	6	613182	613187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_020932	AG	3	6	613224	613229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020932	A	6	6	613237	613242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020932	GGAA	2	8	613252	613259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020932	A	7	7	613264	613270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020932	TATT	2	8	614164	614171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020932	TAA	2	6	614173	614178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020932	AAAT	2	8	614196	614203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020932	T	7	7	614203	614209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020932	TCTTTT	2	12	614250	614261	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1554	NC_020932	T	6	6	614258	614263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020932	ATG	2	6	614264	614269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020932	TTA	2	6	614278	614283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020932	CTT	2	6	615275	615280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_020932	T	6	6	616780	616785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020932	CAG	2	6	616823	616828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_020932	CT	3	6	618148	618153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_020932	T	7	7	618176	618182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020932	T	6	6	618187	618192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020932	GTT	2	6	618205	618210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020932	T	6	6	618221	618226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020932	TTCT	2	8	618236	618243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_020932	TCT	2	6	619847	619852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_020932	GAT	2	6	619898	619903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020932	T	6	6	619931	619936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020932	TAAG	2	8	621215	621222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020932	A	6	6	621251	621256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020932	AGA	2	6	621264	621269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020932	GATT	2	8	621338	621345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020932	TTC	2	6	624972	624977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_020932	T	6	6	624997	625002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020932	CCT	2	6	625003	625008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_020932	T	6	6	625623	625628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020932	CT	3	6	625708	625713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_020932	TTTCC	2	10	625714	625723	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1579	NC_020932	CTTC	2	8	625749	625756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_020932	ATC	2	6	625762	625767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_020932	A	6	6	628181	628186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020932	GTGA	2	8	628223	628230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020932	AG	3	6	630066	630071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020932	TCT	2	6	630073	630078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_020932	AT	3	6	630097	630102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020932	A	8	8	630105	630112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020932	T	6	6	630136	630141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020932	A	6	6	630203	630208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020932	CCTG	2	8	630294	630301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_020932	A	9	9	633118	633126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020932	CTCC	2	8	633130	633137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1592	NC_020932	A	6	6	633138	633143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020932	TTC	2	6	633151	633156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_020932	TTG	2	6	633177	633182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020932	T	6	6	633650	633655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020932	A	6	6	633716	633721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020932	CCT	2	6	636053	636058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_020932	CCT	2	6	637243	637248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_020932	AAC	2	6	642252	642257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_020932	A	6	6	642266	642271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020932	A	8	8	642298	642305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020932	T	7	7	642338	642344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020932	A	7	7	642348	642354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020932	A	7	7	642356	642362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020932	GA	3	6	645232	645237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020932	GA	3	6	645244	645249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020932	AGG	2	6	645276	645281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020932	AC	3	6	645306	645311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_020932	GCT	2	6	645312	645317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_020932	TTA	2	6	645356	645361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020932	TTA	2	6	645385	645390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020932	TAG	2	6	645430	645435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020932	TTATT	2	10	645443	645452	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020932	T	7	7	645451	645457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020932	TCGTC	2	10	646546	646555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_020932	AG	3	6	646571	646576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020932	T	6	6	648053	648058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020932	GT	3	6	648069	648074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020932	CTTT	2	8	649400	649407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_020932	AAC	2	6	650493	650498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_020932	TTG	2	6	650504	650509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020932	A	7	7	650523	650529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020932	A	7	7	650557	650563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020932	A	6	6	650573	650578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020932	CTC	2	6	650617	650622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_020932	T	6	6	650740	650745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020932	ATT	2	6	652706	652711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020932	CA	3	6	652718	652723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_020932	A	6	6	652796	652801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020932	CAGG	2	8	652820	652827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_020932	TTC	2	6	652868	652873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_020932	AAT	2	6	652961	652966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020932	TCC	2	6	653085	653090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_020932	ATC	2	6	655214	655219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_020932	GAT	2	6	655228	655233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_020932	T	6	6	655356	655361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_020932	AAC	2	6	656428	656433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_020932	CTA	2	6	658492	658497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_020932	GGA	2	6	658550	658555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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