MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020932	TAT	2	6	184944	184949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020932	GA	3	6	184984	184989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020932	GA	3	6	185016	185021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020932	AGA	2	6	185026	185031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020932	GTT	2	6	186299	186304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020932	GTT	3	9	186699	186707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020932	T	6	6	186713	186718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020932	T	7	7	186721	186727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020932	T	6	6	186733	186738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020932	T	8	8	186783	186790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020932	A	6	6	186806	186811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020932	T	6	6	186828	186833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020932	ATC	2	6	188406	188411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020932	CGATA	2	10	188434	188443	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_020932	T	6	6	188447	188452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020932	TCC	2	6	188467	188472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_020932	ACA	3	9	188473	188481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020932	AGT	2	6	188491	188496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020932	AAAC	2	8	188516	188523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_020932	TGC	2	6	188582	188587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020932	AGT	3	9	188650	188658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020932	AGT	2	6	188673	188678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020932	TTG	2	6	188681	188686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020932	TAT	2	6	188761	188766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020932	T	6	6	188780	188785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020932	GCA	2	6	188833	188838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_020932	CTT	2	6	188848	188853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020932	GGAC	2	8	188875	188882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_020932	AAG	2	6	188985	188990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020932	AG	3	6	189070	189075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020932	AT	3	6	189572	189577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020932	TGT	2	6	189586	189591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020932	GTT	2	6	189954	189959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020932	GCA	2	6	190007	190012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_020932	CTTT	2	8	190087	190094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_020932	AAG	2	6	190134	190139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020932	T	6	6	190184	190189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020932	ATT	2	6	190197	190202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020932	T	6	6	190213	190218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020932	TATGAA	3	18	192189	192206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020932	AGA	2	6	192251	192256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020932	AAC	2	6	192258	192263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020932	ATA	2	6	192278	192283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020932	T	6	6	192303	192308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020932	AGA	2	6	193241	193246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020932	A	7	7	193298	193304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020932	A	7	7	193328	193334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020932	AG	3	6	193350	193355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020932	AAT	2	6	193360	193365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020932	T	9	9	193380	193388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020932	T	6	6	193427	193432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020932	TAC	2	6	193471	193476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020932	ATT	2	6	193480	193485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020932	A	8	8	196275	196282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020932	CTT	2	6	196314	196319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020932	A	8	8	196324	196331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020932	TC	3	6	196342	196347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_020932	CTT	2	6	196351	196356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_020932	ACGA	2	8	198961	198968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_020932	CTAAG	2	10	199127	199136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
561	NC_020932	T	6	6	199235	199240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020932	GAAA	2	8	199247	199254	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020932	A	7	7	199252	199258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020932	T	6	6	200025	200030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020932	TAAA	2	8	200047	200054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020932	CT	3	6	200100	200105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_020932	AAT	2	6	200147	200152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020932	TAG	2	6	200183	200188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020932	AAT	2	6	200196	200201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020932	AAG	2	6	200294	200299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020932	CTT	2	6	200305	200310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_020932	GA	4	8	203159	203166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020932	T	7	7	203189	203195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020932	CT	4	8	203207	203214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_020932	A	6	6	203216	203221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020932	TA	3	6	204788	204793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020932	CCTT	2	8	212381	212388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_020932	GAA	2	6	212403	212408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020932	TTG	2	6	212420	212425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020932	A	6	6	212432	212437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020932	CTC	2	6	213199	213204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_020932	T	7	7	213213	213219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020932	A	7	7	214447	214453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020932	TAA	2	6	214454	214459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020932	AG	3	6	214479	214484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020932	A	6	6	214504	214509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020932	GAA	2	6	214514	214519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020932	TA	3	6	216033	216038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020932	GTC	2	6	216052	216057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_020932	CTAT	2	8	216107	216114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_020932	T	7	7	216122	216128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020932	ATT	2	6	216225	216230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020932	TCT	2	6	216251	216256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020932	GTC	2	6	216279	216284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020932	TCC	2	6	216303	216308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_020932	ATG	2	6	216326	216331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020932	GCAA	2	8	216351	216358	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_020932	TTTTAC	2	12	217510	217521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
599	NC_020932	A	8	8	217573	217580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020932	TAA	2	6	217628	217633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020932	ATTTC	2	10	217655	217664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_020932	CT	3	6	217676	217681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_020932	AATT	2	8	217688	217695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020932	CTTG	2	8	218037	218044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_020932	T	6	6	218092	218097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020932	TC	3	6	220677	220682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_020932	AG	3	6	220708	220713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020932	CAATA	2	10	220778	220787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
609	NC_020932	TAA	2	6	221751	221756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020932	AAAC	2	8	221767	221774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_020932	T	8	8	224242	224249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020932	TCCT	2	8	224391	224398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_020932	GTT	2	6	224434	224439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020932	AGA	2	6	224443	224448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020932	ATT	2	6	224480	224485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020932	AAC	2	6	230882	230887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_020932	AGA	2	6	230909	230914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020932	GAG	2	6	230926	230931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020932	GCT	2	6	230978	230983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020932	ACC	2	6	230987	230992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_020932	A	6	6	231018	231023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020932	ACT	2	6	231082	231087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020932	TGT	2	6	234887	234892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020932	TC	3	6	234907	234912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_020932	AG	3	6	234933	234938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020932	CAT	2	6	235002	235007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020932	T	8	8	235009	235016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020932	A	6	6	238105	238110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020932	AC	3	6	239856	239861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_020932	TCT	2	6	239942	239947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020932	AAAT	2	8	240006	240013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020932	AAGA	2	8	240025	240032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020932	T	6	6	240085	240090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020932	AAG	2	6	242616	242621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020932	TTTC	2	8	242626	242633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
636	NC_020932	TAAA	2	8	243460	243467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020932	ATA	2	6	243482	243487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020932	TTA	2	6	243503	243508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020932	T	6	6	244460	244465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020932	TACAA	2	10	244489	244498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
641	NC_020932	ATA	2	6	244521	244526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020932	GA	3	6	246942	246947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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767	NC_020932	A	6	6	295380	295385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_020932	CA	3	6	298159	298164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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