MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 2653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020931	GCA	2	6	594705	594710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_020931	A	7	7	594744	594750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020931	TAT	2	6	597922	597927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020931	T	12	12	597930	597941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020931	AGCA	2	8	597942	597949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_020931	A	6	6	597959	597964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020931	TAC	2	6	597966	597971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_020931	GA	3	6	599658	599663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020931	TAG	2	6	600261	600266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020931	AGA	2	6	600276	600281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020931	GGA	2	6	600299	600304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020931	T	6	6	602242	602247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020931	TTC	2	6	602270	602275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_020931	CCT	2	6	602289	602294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_020931	CTAC	2	8	602331	602338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_020931	TAGGGG	2	12	602400	602411	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020931	TA	3	6	602570	602575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020931	CCA	2	6	602624	602629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_020931	TTA	2	6	602657	602662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020931	TC	3	6	602672	602677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_020931	TCT	2	6	602764	602769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_020931	CTT	2	6	602780	602785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_020931	CAA	2	6	602788	602793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_020931	TTGC	2	8	602875	602882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_020931	CCT	2	6	602905	602910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_020931	CT	3	6	603263	603268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_020931	A	6	6	603765	603770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020931	AT	3	6	604499	604504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020931	TTC	2	6	604516	604521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_020931	T	6	6	604552	604557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020931	A	9	9	604605	604613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020931	T	7	7	607723	607729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020931	ACT	2	6	607775	607780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_020931	TC	3	6	607798	607803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_020931	TAT	2	6	607804	607809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020931	AC	3	6	607822	607827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_020931	ATCC	2	8	607842	607849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_020931	CGC	2	6	607856	607861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_020931	CT	3	6	607879	607884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_020931	TCT	2	6	607904	607909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_020931	AAG	2	6	607931	607936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020931	GAC	2	6	607941	607946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_020931	TAC	2	6	607949	607954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_020931	ATG	2	6	607966	607971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020931	A	6	6	608001	608006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020931	AC	3	6	608074	608079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_020931	A	6	6	613312	613317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020931	CT	3	6	613326	613331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_020931	AG	3	6	613368	613373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020931	A	6	6	613381	613386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020931	GGAA	2	8	613396	613403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020931	A	7	7	613408	613414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020931	TATT	2	8	614308	614315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020931	TAA	2	6	614317	614322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020931	AAAT	2	8	614340	614347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020931	T	7	7	614347	614353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020931	TCTTTT	2	12	614394	614405	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1558	NC_020931	T	6	6	614402	614407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020931	ATG	2	6	614408	614413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020931	TTA	2	6	614422	614427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020931	CTT	2	6	615419	615424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_020931	T	6	6	616924	616929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020931	CAG	2	6	616967	616972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_020931	CT	3	6	618292	618297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_020931	T	7	7	618320	618326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020931	T	6	6	618331	618336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020931	GTT	2	6	618349	618354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020931	T	6	6	618365	618370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020931	TTCT	2	8	618380	618387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_020931	TCT	2	6	619991	619996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_020931	GAT	2	6	620042	620047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020931	T	6	6	620075	620080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020931	TAAG	2	8	621359	621366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020931	A	6	6	621395	621400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020931	AGA	2	6	621408	621413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020931	GATT	2	8	621482	621489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020931	TTC	2	6	625116	625121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_020931	T	6	6	625141	625146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020931	CCT	2	6	625147	625152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_020931	T	6	6	625767	625772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020931	CT	3	6	625852	625857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_020931	TTTCC	2	10	625858	625867	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1583	NC_020931	CTTC	2	8	625893	625900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_020931	ATC	2	6	625906	625911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_020931	A	6	6	628325	628330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020931	GTGA	2	8	628367	628374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020931	AG	3	6	630210	630215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020931	TCT	2	6	630217	630222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_020931	AT	3	6	630241	630246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020931	A	8	8	630249	630256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020931	T	6	6	630280	630285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020931	A	6	6	630347	630352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020931	CCTG	2	8	630438	630445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_020931	A	9	9	633262	633270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020931	CTCC	2	8	633274	633281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1596	NC_020931	A	6	6	633282	633287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_020931	TTG	2	6	633321	633326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020931	T	6	6	633794	633799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020931	A	6	6	633860	633865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020931	CCT	2	6	636197	636202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_020931	CCT	2	6	637387	637392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_020931	AAC	2	6	642396	642401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_020931	A	6	6	642410	642415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020931	A	8	8	642442	642449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020931	T	7	7	642482	642488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020931	A	7	7	642492	642498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020931	A	7	7	642500	642506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020931	GA	3	6	645376	645381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020931	GA	3	6	645388	645393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020931	AGG	2	6	645420	645425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020931	AC	3	6	645450	645455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_020931	GCT	2	6	645456	645461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_020931	TTA	2	6	645500	645505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020931	TTA	2	6	645529	645534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020931	TAG	2	6	645574	645579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020931	TTATT	2	10	645587	645596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020931	T	7	7	645595	645601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020931	TCGTC	2	10	646690	646699	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1620	NC_020931	AG	3	6	646715	646720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020931	T	6	6	648197	648202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020931	GT	3	6	648213	648218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020931	CTTT	2	8	649544	649551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_020931	AAC	2	6	650637	650642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_020931	TTG	2	6	650648	650653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020931	A	7	7	650667	650673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020931	A	7	7	650701	650707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020931	A	6	6	650717	650722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020931	CTC	2	6	650761	650766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_020931	T	6	6	650884	650889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020931	ATT	2	6	652850	652855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020931	CA	3	6	652862	652867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_020931	A	6	6	652940	652945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020931	CAGG	2	8	652964	652971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_020931	TTC	2	6	653012	653017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_020931	TCC	2	6	653229	653234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1638	NC_020931	ATC	2	6	655358	655363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_020931	GAT	2	6	655372	655377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1641	NC_020931	AAC	2	6	656572	656577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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