MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 2653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020931	AGG	2	6	184589	184594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020931	A	6	6	184943	184948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020931	T	8	8	184954	184961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020931	ATA	2	6	185004	185009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020931	A	8	8	185009	185016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020931	TAT	2	6	185088	185093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020931	GA	3	6	185128	185133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020931	GA	3	6	185160	185165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020931	AGA	2	6	185170	185175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020931	GTT	2	6	186443	186448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020931	GTT	3	9	186843	186851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020931	T	6	6	186857	186862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020931	T	7	7	186865	186871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020931	T	6	6	186877	186882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020931	T	8	8	186927	186934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020931	A	6	6	186950	186955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020931	T	6	6	186972	186977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020931	ATC	2	6	188550	188555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020931	CGATA	2	10	188578	188587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_020931	T	6	6	188591	188596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020931	TCC	2	6	188611	188616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_020931	ACA	3	9	188617	188625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020931	AGT	2	6	188635	188640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020931	AAAC	2	8	188660	188667	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020931	TGC	2	6	188726	188731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020931	AGT	3	9	188794	188802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020931	AGT	2	6	188817	188822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020931	TTG	2	6	188825	188830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020931	TAT	2	6	188905	188910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020931	T	6	6	188924	188929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020931	GCA	2	6	188977	188982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020931	CTT	2	6	188992	188997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020931	GGAC	2	8	189019	189026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_020931	AAG	2	6	189129	189134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020931	AG	3	6	189214	189219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020931	AT	3	6	189716	189721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020931	TGT	2	6	189730	189735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020931	GTT	2	6	190098	190103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020931	GCA	2	6	190151	190156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020931	CTTT	2	8	190231	190238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_020931	AAG	2	6	190278	190283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020931	T	6	6	190328	190333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020931	ATT	2	6	190341	190346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020931	T	6	6	190357	190362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020931	TATGAA	3	18	192333	192350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020931	AGA	2	6	192395	192400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020931	AAC	2	6	192402	192407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020931	ATA	2	6	192422	192427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020931	T	6	6	192447	192452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020931	AGA	2	6	193385	193390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020931	A	7	7	193442	193448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020931	A	7	7	193472	193478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020931	AG	3	6	193494	193499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020931	AAT	2	6	193504	193509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020931	T	9	9	193524	193532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020931	T	6	6	193571	193576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020931	TAC	2	6	193615	193620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020931	ATT	2	6	193624	193629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020931	A	8	8	196419	196426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020931	CTT	2	6	196458	196463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020931	A	8	8	196468	196475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020931	TC	3	6	196486	196491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_020931	CTT	2	6	196495	196500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020931	ACGA	2	8	199105	199112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020931	CTAAG	2	10	199271	199280	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_020931	T	6	6	199379	199384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020931	GAAA	2	8	199391	199398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020931	A	7	7	199396	199402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020931	T	6	6	200169	200174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020931	TAAA	2	8	200191	200198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020931	CT	3	6	200244	200249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_020931	AAT	2	6	200291	200296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020931	TAG	2	6	200327	200332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020931	AAT	2	6	200340	200345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020931	AAG	2	6	200438	200443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020931	CTT	2	6	200449	200454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_020931	GA	4	8	203303	203310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020931	T	7	7	203333	203339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020931	CT	4	8	203351	203358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_020931	A	6	6	203360	203365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020931	TA	3	6	204932	204937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020931	CCTT	2	8	212525	212532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_020931	GAA	2	6	212547	212552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020931	TTG	2	6	212564	212569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020931	A	6	6	212576	212581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020931	CTC	2	6	213343	213348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_020931	T	7	7	213357	213363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020931	A	7	7	214591	214597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020931	TAA	2	6	214598	214603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020931	AG	3	6	214623	214628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020931	A	6	6	214648	214653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020931	GAA	2	6	214658	214663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020931	TA	3	6	216177	216182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020931	GTC	2	6	216196	216201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020931	CTAT	2	8	216251	216258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_020931	T	7	7	216266	216272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020931	ATT	2	6	216369	216374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020931	TCT	2	6	216395	216400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020931	GTC	2	6	216423	216428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020931	TCC	2	6	216447	216452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_020931	ATG	2	6	216470	216475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020931	GCAA	2	8	216495	216502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_020931	TTTTAC	2	12	217654	217665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
604	NC_020931	A	8	8	217717	217724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020931	TAA	2	6	217772	217777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020931	ATTTC	2	10	217799	217808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_020931	CT	3	6	217820	217825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_020931	AATT	2	8	217832	217839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020931	CTTG	2	8	218181	218188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_020931	T	6	6	218236	218241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020931	TC	3	6	220821	220826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_020931	AG	3	6	220852	220857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020931	CAATA	2	10	220922	220931	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_020931	TAA	2	6	221895	221900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020931	AAAC	2	8	221911	221918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_020931	T	8	8	224386	224393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020931	TCCT	2	8	224535	224542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_020931	GTT	2	6	224578	224583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020931	AGA	2	6	224587	224592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020931	ATT	2	6	224624	224629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020931	AAC	2	6	231026	231031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020931	AGA	2	6	231053	231058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020931	GAG	2	6	231070	231075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020931	GCT	2	6	231122	231127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020931	ACC	2	6	231131	231136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020931	A	6	6	231162	231167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020931	ACT	2	6	231226	231231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020931	TGT	2	6	235031	235036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020931	TC	3	6	235051	235056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_020931	AG	3	6	235077	235082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020931	CAT	2	6	235146	235151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020931	T	8	8	235153	235160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020931	A	6	6	238249	238254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020931	AC	3	6	240000	240005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020931	TCT	2	6	240086	240091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020931	AAAT	2	8	240150	240157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020931	AAGA	2	8	240169	240176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020931	T	6	6	240229	240234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020931	AAG	2	6	242760	242765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020931	TTTC	2	8	242770	242777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_020931	TAAA	2	8	243604	243611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020931	ATA	2	6	243626	243631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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