MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 340

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020930	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020930	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020930	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020930	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020930	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020930	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020930	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020930	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020930	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020930	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020930	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020930	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020930	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020930	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020930	GA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020930	CT	3	6	27118	27123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020930	TC	3	6	28486	28491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020930	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020930	GA	3	6	36983	36988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020930	AT	3	6	37084	37089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020930	CT	3	6	39351	39356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020930	CT	3	6	40721	40726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020930	AG	3	6	42847	42852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020930	CT	3	6	42913	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020930	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020930	TC	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020930	TA	3	6	44487	44492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020930	AG	3	6	48571	48576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020930	TG	3	6	51922	51927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020930	GA	3	6	56190	56195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020930	GA	3	6	61387	61392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020930	AG	4	8	65406	65413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020930	TA	3	6	69725	69730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020930	CT	3	6	72461	72466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020930	TA	3	6	85825	85830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020930	TC	3	6	91046	91051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020930	GA	3	6	91178	91183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020930	CT	3	6	93528	93533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020930	TA	3	6	93694	93699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020930	AG	3	6	93737	93742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020930	AG	3	6	93834	93839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020930	GA	3	6	94056	94061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020930	TA	3	6	94673	94678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020930	TC	3	6	100549	100554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020930	AT	3	6	100600	100605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020930	GC	3	6	102706	102711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020930	TA	3	6	107276	107281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020930	TG	3	6	116530	116535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020930	AG	4	8	119118	119125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020930	GA	3	6	120940	120945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020930	TA	3	6	123248	123253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020930	GT	3	6	124238	124243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020930	CT	3	6	128774	128779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020930	TC	3	6	131096	131101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020930	AG	3	6	131173	131178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020930	AG	3	6	131198	131203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020930	TG	3	6	137612	137617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020930	AG	3	6	138857	138862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020930	AT	3	6	143152	143157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020930	AG	3	6	157959	157964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020930	TC	3	6	172431	172436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020930	AG	3	6	172563	172568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020930	CT	3	6	172581	172586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020930	TG	3	6	179070	179075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020930	TA	3	6	184268	184273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020930	GA	3	6	184381	184386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020930	GA	3	6	184484	184489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020930	GA	3	6	185123	185128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020930	GA	3	6	185155	185160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020930	AG	3	6	189209	189214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020930	AT	3	6	189710	189715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020930	AG	3	6	193489	193494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020930	TC	3	6	196481	196486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020930	CT	3	6	200239	200244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020930	GA	4	8	203298	203305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020930	CT	4	8	203346	203353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020930	TA	3	6	204927	204932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020930	AG	3	6	214618	214623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020930	TA	3	6	216172	216177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020930	CT	3	6	217815	217820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020930	TC	3	6	220816	220821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020930	AG	3	6	220847	220852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020930	TC	3	6	235046	235051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020930	AG	3	6	235072	235077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020930	AC	3	6	239995	240000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020930	GA	3	6	247081	247086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020930	TG	3	6	247191	247196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020930	AG	3	6	247991	247996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020930	GA	3	6	248870	248875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020930	AG	3	6	248995	249000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020930	TA	3	6	250816	250821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020930	AG	3	6	253107	253112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020930	TC	3	6	253133	253138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020930	TA	3	6	260974	260979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020930	AG	3	6	261054	261059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020930	CA	3	6	262781	262786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020930	TC	3	6	264680	264685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020930	CA	3	6	270029	270034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020930	TA	3	6	270231	270236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020930	AT	4	8	280791	280798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020930	CT	3	6	281643	281648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020930	TC	4	8	281734	281741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020930	TC	3	6	283425	283430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020930	TC	3	6	283482	283487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020930	CT	3	6	283955	283960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020930	AT	3	6	295969	295974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020930	CA	3	6	298298	298303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020930	GA	3	6	303029	303034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020930	AG	3	6	312247	312252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020930	CT	3	6	344207	344212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020930	CT	3	6	347278	347283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020930	TC	3	6	351504	351509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020930	AC	3	6	358753	358758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020930	GA	3	6	360664	360669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020930	TC	3	6	360742	360747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020930	TA	3	6	360943	360948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020930	GC	3	6	362472	362477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020930	TC	3	6	362775	362780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020930	CT	4	8	378077	378084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020930	CG	3	6	387916	387921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020930	CA	3	6	388966	388971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020930	TC	3	6	391513	391518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020930	CT	3	6	392003	392008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020930	GA	3	6	392133	392138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020930	GA	3	6	392257	392262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020930	CT	3	6	406365	406370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020930	CT	3	6	407350	407355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020930	CT	3	6	426085	426090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020930	CT	3	6	427108	427113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020930	AG	3	6	427454	427459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020930	GA	3	6	429149	429154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020930	AC	3	6	433147	433152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020930	CT	3	6	437418	437423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020930	AC	3	6	437456	437461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020930	CA	3	6	439925	439930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020930	CT	3	6	441329	441334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020930	CT	3	6	450611	450616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020930	AG	3	6	456752	456757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020930	TC	3	6	463290	463295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020930	AT	3	6	463359	463364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020930	GA	4	8	464733	464740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020930	TA	3	6	464776	464781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020930	TC	3	6	476601	476606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020930	AC	3	6	482142	482147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020930	GA	4	8	482187	482194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020930	CA	3	6	482224	482229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020930	TC	3	6	482265	482270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020930	AC	3	6	486700	486705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020930	AG	3	6	486862	486867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020930	CT	3	6	486881	486886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020930	AG	3	6	487174	487179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020930	CT	3	6	490160	490165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020930	CT	3	6	490678	490683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020930	TG	3	6	490711	490716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.