MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 2664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020930	AGG	2	6	184586	184591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020930	A	6	6	184940	184945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020930	T	8	8	184951	184958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020930	ATA	2	6	185001	185006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020930	A	7	7	185006	185012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020930	TAT	2	6	185083	185088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020930	GA	3	6	185123	185128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020930	GA	3	6	185155	185160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020930	AGA	2	6	185165	185170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020930	GTT	2	6	186438	186443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020930	GTT	3	9	186838	186846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020930	T	6	6	186852	186857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020930	T	7	7	186860	186866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020930	T	6	6	186872	186877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020930	T	8	8	186922	186929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020930	A	6	6	186945	186950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020930	T	6	6	186967	186972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020930	ATC	2	6	188545	188550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020930	CGATA	2	10	188573	188582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_020930	T	6	6	188586	188591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020930	TCC	2	6	188606	188611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_020930	ACA	3	9	188612	188620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020930	AGT	2	6	188630	188635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020930	AAAC	2	8	188655	188662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020930	TGC	2	6	188721	188726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020930	AGT	3	9	188789	188797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020930	AGT	2	6	188812	188817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020930	TTG	2	6	188820	188825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020930	TAT	2	6	188900	188905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020930	T	6	6	188919	188924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020930	GCA	2	6	188972	188977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020930	CTT	2	6	188987	188992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020930	GGAC	2	8	189014	189021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_020930	AAG	2	6	189124	189129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020930	AG	3	6	189209	189214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020930	AT	3	6	189710	189715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020930	TGT	2	6	189724	189729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020930	GTT	2	6	190092	190097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020930	GCA	2	6	190145	190150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020930	CTTT	2	8	190225	190232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_020930	AAG	2	6	190272	190277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020930	T	6	6	190322	190327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020930	ATT	2	6	190335	190340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020930	T	6	6	190351	190356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020930	TATGAA	3	18	192327	192344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020930	AGA	2	6	192389	192394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020930	AAC	2	6	192396	192401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020930	ATA	2	6	192416	192421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020930	T	6	6	192441	192446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020930	AGA	2	6	193380	193385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020930	A	7	7	193437	193443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020930	A	7	7	193467	193473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020930	AG	3	6	193489	193494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020930	AAT	2	6	193499	193504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020930	T	9	9	193519	193527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020930	T	6	6	193566	193571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020930	TAC	2	6	193610	193615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020930	ATT	2	6	193619	193624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020930	A	8	8	196414	196421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020930	CTT	2	6	196453	196458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020930	A	8	8	196463	196470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020930	TC	3	6	196481	196486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_020930	CTT	2	6	196490	196495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020930	ACGA	2	8	199100	199107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020930	CTAAG	2	10	199266	199275	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_020930	T	6	6	199374	199379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020930	GAAA	2	8	199386	199393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020930	A	7	7	199391	199397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020930	T	6	6	200164	200169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020930	TAAA	2	8	200186	200193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020930	CT	3	6	200239	200244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_020930	AAT	2	6	200286	200291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020930	TAG	2	6	200322	200327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020930	AAT	2	6	200335	200340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020930	AAG	2	6	200433	200438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020930	CTT	2	6	200444	200449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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578	NC_020930	T	7	7	203328	203334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020930	CT	4	8	203346	203353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_020930	A	6	6	203355	203360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020930	TA	3	6	204927	204932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020930	CCTT	2	8	212520	212527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_020930	GAA	2	6	212542	212547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020930	TTG	2	6	212559	212564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020930	A	6	6	212571	212576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020930	CTC	2	6	213338	213343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_020930	T	7	7	213352	213358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020930	A	7	7	214586	214592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020930	TAA	2	6	214593	214598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020930	AG	3	6	214618	214623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020930	A	6	6	214643	214648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020930	GAA	2	6	214653	214658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020930	TA	3	6	216172	216177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020930	GTC	2	6	216191	216196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020930	CTAT	2	8	216246	216253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_020930	T	7	7	216261	216267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020930	ATT	2	6	216364	216369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020930	TCT	2	6	216390	216395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020930	GTC	2	6	216418	216423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020930	TCC	2	6	216442	216447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_020930	ATG	2	6	216465	216470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020930	GCAA	2	8	216490	216497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_020930	TTTTAC	2	12	217649	217660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
604	NC_020930	A	8	8	217712	217719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020930	TAA	2	6	217767	217772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020930	ATTTC	2	10	217794	217803	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_020930	CT	3	6	217815	217820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_020930	AATT	2	8	217827	217834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020930	CTTG	2	8	218176	218183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_020930	T	6	6	218231	218236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020930	TC	3	6	220816	220821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_020930	AG	3	6	220847	220852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020930	CAATA	2	10	220917	220926	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_020930	TAA	2	6	221890	221895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020930	AAAC	2	8	221906	221913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_020930	T	8	8	224381	224388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020930	TCCT	2	8	224530	224537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_020930	GTT	2	6	224573	224578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020930	AGA	2	6	224582	224587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020930	ATT	2	6	224619	224624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020930	ACA	2	6	231022	231027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020930	AGA	2	6	231048	231053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020930	GAG	2	6	231065	231070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020930	GCT	2	6	231117	231122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020930	ACC	2	6	231126	231131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020930	A	6	6	231157	231162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020930	ACT	2	6	231221	231226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020930	TGT	2	6	235026	235031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020930	TC	3	6	235046	235051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_020930	AG	3	6	235072	235077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020930	CAT	2	6	235141	235146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020930	T	8	8	235148	235155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020930	A	6	6	238244	238249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020930	AC	3	6	239995	240000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020930	TCT	2	6	240081	240086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020930	AAAT	2	8	240145	240152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020930	AAGA	2	8	240164	240171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020930	T	6	6	240224	240229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020930	AAG	2	6	242755	242760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020930	TTTC	2	8	242765	242772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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642	NC_020930	ATA	2	6	243621	243626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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