MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020929	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020929	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020929	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020929	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020929	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020929	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020929	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020929	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020929	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020929	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020929	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020929	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020929	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020929	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020929	GA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020929	CT	3	6	27118	27123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020929	TC	3	6	28486	28491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020929	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020929	GA	3	6	36983	36988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020929	AT	3	6	37084	37089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020929	CT	3	6	39351	39356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020929	CT	3	6	40721	40726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020929	AG	3	6	42847	42852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020929	CT	3	6	42913	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020929	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020929	TC	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020929	TA	3	6	44487	44492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020929	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020929	TG	3	6	51921	51926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020929	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020929	GA	3	6	61396	61401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020929	AG	4	8	65415	65422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020929	TA	3	6	69734	69739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020929	CT	3	6	72470	72475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020929	TA	3	6	85834	85839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020929	TC	3	6	91055	91060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020929	GA	3	6	91187	91192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020929	CT	3	6	93537	93542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020929	TA	3	6	93703	93708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020929	AG	3	6	93746	93751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020929	AG	3	6	93843	93848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020929	GA	3	6	94065	94070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020929	TA	3	6	94682	94687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020929	TC	3	6	100558	100563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020929	AT	3	6	100609	100614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020929	GC	3	6	102715	102720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020929	TA	3	6	107285	107290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020929	TG	3	6	116539	116544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020929	AG	4	8	119127	119134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020929	GA	3	6	120949	120954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020929	TA	3	6	123257	123262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020929	GT	3	6	124247	124252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020929	CT	3	6	128783	128788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020929	TC	3	6	131105	131110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020929	AG	3	6	131182	131187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020929	AG	3	6	131207	131212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020929	TG	3	6	137620	137625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020929	AG	3	6	138865	138870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020929	AT	3	6	143160	143165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020929	AG	3	6	157967	157972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020929	TC	3	6	172439	172444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020929	AG	3	6	172571	172576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020929	CT	3	6	172589	172594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020929	TG	3	6	179078	179083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020929	TA	3	6	184222	184227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020929	GA	3	6	184335	184340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020929	GA	3	6	184438	184443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020929	GA	3	6	185078	185083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020929	GA	3	6	185110	185115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020929	AG	3	6	189163	189168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020929	AT	3	6	189665	189670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020929	AG	3	6	193442	193447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020929	TC	3	6	196434	196439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020929	CT	3	6	200192	200197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020929	GA	4	8	203251	203258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020929	CT	4	8	203299	203306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020929	TA	3	6	204880	204885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020929	AG	3	6	214571	214576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020929	TA	3	6	216125	216130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020929	CT	3	6	217768	217773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020929	TC	3	6	220769	220774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020929	AG	3	6	220800	220805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020929	TC	3	6	234999	235004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020929	AG	3	6	235025	235030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020929	AC	3	6	239948	239953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020929	GA	3	6	247034	247039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020929	TG	3	6	247144	247149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020929	AG	3	6	247944	247949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020929	GA	3	6	248823	248828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020929	AG	3	6	248948	248953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020929	TA	3	6	250769	250774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020929	AG	3	6	253061	253066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020929	TC	3	6	253087	253092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020929	TA	3	6	260928	260933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020929	AG	3	6	261008	261013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020929	CA	3	6	262735	262740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020929	TC	3	6	264634	264639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020929	CA	3	6	269983	269988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020929	TA	3	6	270185	270190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020929	AT	4	8	280745	280752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020929	CT	3	6	281597	281602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020929	TC	4	8	281688	281695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020929	TC	3	6	283379	283384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020929	TC	3	6	283436	283441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020929	CT	3	6	283909	283914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020929	AT	3	6	295923	295928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020929	CA	3	6	298252	298257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020929	GA	3	6	302983	302988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020929	AG	3	6	312201	312206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020929	CT	3	6	344161	344166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020929	CT	3	6	347232	347237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020929	TC	3	6	351458	351463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020929	CT	3	6	355374	355379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020929	AC	3	6	358707	358712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020929	GA	3	6	360617	360622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020929	TC	3	6	360695	360700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020929	TA	3	6	360896	360901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020929	GC	3	6	362425	362430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020929	TC	3	6	362728	362733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020929	CT	4	8	378034	378041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020929	CG	3	6	387873	387878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020929	CA	3	6	388923	388928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020929	TC	3	6	391470	391475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020929	CT	3	6	391960	391965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020929	GA	3	6	392090	392095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020929	GA	3	6	392214	392219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020929	CT	3	6	406322	406327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020929	CT	3	6	407307	407312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020929	CT	3	6	426042	426047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020929	CT	3	6	427065	427070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020929	AG	3	6	427411	427416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020929	GA	3	6	429106	429111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020929	AC	3	6	433104	433109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020929	CT	3	6	437375	437380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020929	AC	3	6	437413	437418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020929	CA	3	6	439882	439887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020929	CT	3	6	441286	441291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020929	CT	3	6	450568	450573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020929	AG	3	6	456709	456714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020929	TC	3	6	463247	463252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020929	AT	3	6	463316	463321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020929	GA	4	8	464690	464697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020929	TA	3	6	464733	464738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020929	TC	3	6	476558	476563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020929	AC	3	6	482099	482104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020929	GA	4	8	482144	482151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020929	CA	3	6	482181	482186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020929	TC	3	6	482222	482227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020929	AC	3	6	486657	486662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020929	AG	3	6	486819	486824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020929	CT	3	6	486838	486843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020929	AG	3	6	487131	487136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020929	CT	3	6	490119	490124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020929	CT	3	6	490637	490642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.