MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 2663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020929	AGG	2	6	184540	184545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020929	A	6	6	184894	184899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020929	T	8	8	184905	184912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020929	ATA	2	6	184955	184960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020929	A	7	7	184960	184966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020929	TAT	2	6	185038	185043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020929	GA	3	6	185078	185083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020929	GA	3	6	185110	185115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020929	AGA	2	6	185120	185125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020929	GTT	2	6	186393	186398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020929	GTT	3	9	186793	186801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020929	T	6	6	186807	186812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020929	T	7	7	186815	186821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020929	T	6	6	186827	186832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020929	T	7	7	186877	186883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020929	A	6	6	186899	186904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020929	T	6	6	186921	186926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020929	ATC	2	6	188499	188504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020929	CGATA	2	10	188527	188536	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_020929	T	6	6	188540	188545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020929	TCC	2	6	188560	188565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_020929	ACA	3	9	188566	188574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020929	AGT	2	6	188584	188589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020929	AAAC	2	8	188609	188616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020929	TGC	2	6	188675	188680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020929	AGT	3	9	188743	188751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020929	AGT	2	6	188766	188771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020929	TTG	2	6	188774	188779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020929	TAT	2	6	188854	188859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020929	T	6	6	188873	188878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020929	GCA	2	6	188926	188931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020929	CTT	2	6	188941	188946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020929	GGAC	2	8	188968	188975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_020929	AAG	2	6	189078	189083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020929	AG	3	6	189163	189168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020929	AT	3	6	189665	189670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020929	TGT	2	6	189679	189684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020929	GTT	2	6	190047	190052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020929	GCA	2	6	190100	190105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020929	CTTT	2	8	190180	190187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_020929	AAG	2	6	190227	190232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020929	T	6	6	190277	190282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020929	ATT	2	6	190290	190295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020929	T	6	6	190306	190311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020929	TATGAA	3	18	192282	192299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020929	AGA	2	6	192344	192349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020929	AAC	2	6	192351	192356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020929	ATA	2	6	192371	192376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020929	T	6	6	192396	192401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020929	AGA	2	6	193333	193338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020929	A	7	7	193390	193396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020929	A	7	7	193420	193426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020929	AG	3	6	193442	193447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020929	AAT	2	6	193452	193457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020929	T	9	9	193472	193480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020929	T	6	6	193519	193524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020929	TAC	2	6	193563	193568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020929	ATT	2	6	193572	193577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020929	A	8	8	196367	196374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020929	CTT	2	6	196406	196411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020929	A	8	8	196416	196423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020929	TC	3	6	196434	196439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_020929	CTT	2	6	196443	196448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020929	ACGA	2	8	199053	199060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020929	CTAAG	2	10	199219	199228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_020929	T	6	6	199327	199332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020929	GAAA	2	8	199339	199346	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020929	A	7	7	199344	199350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020929	T	6	6	200117	200122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_020929	CT	3	6	200192	200197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_020929	AAT	2	6	200239	200244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020929	TAG	2	6	200275	200280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020929	AAT	2	6	200288	200293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020929	AAG	2	6	200386	200391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020929	CTT	2	6	200397	200402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_020929	CT	4	8	203299	203306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_020929	A	6	6	203308	203313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020929	TA	3	6	204880	204885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020929	CCTT	2	8	212473	212480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_020929	GAA	2	6	212495	212500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020929	TTG	2	6	212512	212517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020929	A	6	6	212524	212529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020929	CTC	2	6	213291	213296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_020929	T	7	7	213305	213311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020929	A	7	7	214539	214545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020929	TAA	2	6	214546	214551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_020929	A	6	6	214596	214601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020929	GAA	2	6	214606	214611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020929	TA	3	6	216125	216130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020929	GTC	2	6	216144	216149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020929	CTAT	2	8	216199	216206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_020929	T	7	7	216214	216220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020929	ATT	2	6	216317	216322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020929	TCT	2	6	216343	216348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020929	GTC	2	6	216371	216376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020929	TCC	2	6	216395	216400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_020929	ATG	2	6	216418	216423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020929	GCAA	2	8	216443	216450	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_020929	TTTTAC	2	12	217602	217613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
604	NC_020929	A	8	8	217665	217672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020929	TAA	2	6	217720	217725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020929	ATTTC	2	10	217747	217756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_020929	CT	3	6	217768	217773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_020929	AATT	2	8	217780	217787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020929	CTTG	2	8	218129	218136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_020929	T	6	6	218184	218189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020929	TC	3	6	220769	220774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_020929	AG	3	6	220800	220805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020929	CAATA	2	10	220870	220879	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_020929	TAA	2	6	221843	221848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020929	AAAC	2	8	221859	221866	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_020929	T	8	8	224334	224341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020929	TCCT	2	8	224483	224490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_020929	GTT	2	6	224526	224531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020929	AGA	2	6	224535	224540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020929	ATT	2	6	224572	224577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020929	AAC	2	6	230974	230979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020929	AGA	2	6	231001	231006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020929	GAG	2	6	231018	231023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020929	GCT	2	6	231070	231075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020929	ACC	2	6	231079	231084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020929	A	6	6	231110	231115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020929	ACT	2	6	231174	231179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020929	TGT	2	6	234979	234984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020929	TC	3	6	234999	235004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_020929	AG	3	6	235025	235030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020929	CAT	2	6	235094	235099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020929	T	8	8	235101	235108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020929	A	6	6	238197	238202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020929	AC	3	6	239948	239953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020929	TCT	2	6	240034	240039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020929	AAAT	2	8	240098	240105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020929	AAGA	2	8	240117	240124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020929	T	6	6	240177	240182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020929	AAG	2	6	242708	242713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020929	TTTC	2	8	242718	242725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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642	NC_020929	ATA	2	6	243574	243579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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