MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020913	CCCCA	2	10	74	83	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_020913	GATTG	2	10	4105	4114	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020913	TTCTT	2	10	32917	32926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020913	GTAAT	2	10	34859	34868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020913	CTGGG	2	10	75737	75746	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020913	ATTTT	2	10	88731	88740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020913	TCCTC	2	10	89894	89903	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_020913	TTCCC	2	10	142404	142413	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_020913	CATGT	2	10	155504	155513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020913	CTGGA	2	10	157750	157759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020913	TATAA	2	10	169288	169297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020913	TTTAT	2	10	210577	210586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020913	CTTTT	2	10	210805	210814	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020913	GTTCT	2	10	214455	214464	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020913	TCCCC	2	10	219572	219581	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_020913	ATCGA	2	10	229911	229920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020913	TCCGA	2	10	244206	244215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020913	ACGGT	2	10	254541	254550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020913	GTCGG	2	10	254573	254582	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020913	AGGGC	2	10	262894	262903	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020913	TGTCC	2	10	268228	268237	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_020913	GATTG	2	10	268383	268392	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020913	AATTT	2	10	268617	268626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020913	GATAC	2	10	279525	279534	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020913	TAATA	2	10	281149	281158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020913	CACTA	2	10	286293	286302	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020913	ATCGC	2	10	290250	290259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_020913	CTGCG	2	10	295402	295411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020913	TAATA	2	10	305162	305171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020913	TTAAG	2	10	307005	307014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020913	TTCAT	2	10	308920	308929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020913	ATTTT	2	10	313269	313278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020913	GGGGA	2	10	321288	321297	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020913	TTTTA	2	10	328474	328483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020913	AATGA	2	10	341248	341257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020913	GGTCC	2	10	343142	343151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_020913	CCGAG	2	10	358975	358984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020913	CCAAT	2	10	369646	369655	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_020913	CTATT	2	10	380395	380404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020913	CCTAC	2	10	389764	389773	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_020913	TCTTT	2	10	394403	394412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020913	TATGT	2	10	402231	402240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020913	TTTTG	2	10	415098	415107	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020913	TTGGA	2	10	425158	425167	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020913	TAGTT	2	10	435809	435818	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020913	TCCGA	2	10	473346	473355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020913	ATACG	2	10	478485	478494	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020913	AATGG	2	10	484883	484892	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020913	TGGAT	2	10	496660	496669	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020913	TCCTT	2	10	520478	520487	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_020913	CCGAT	2	10	521825	521834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_020913	GGACC	2	10	542636	542645	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_020913	TTGGA	2	10	565567	565576	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020913	GGACT	2	10	568416	568425	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020913	TTCCC	2	10	588223	588232	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_020913	AGGGG	2	10	590154	590163	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020913	CAAAA	2	10	600108	600117	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020913	ATTCT	2	10	608022	608031	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020913	GGACG	2	10	608032	608041	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020913	AAAAT	2	10	645147	645156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020913	GAACT	2	10	663096	663105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020913	TAGAA	2	10	667703	667712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020913	TTTGT	2	10	683962	683971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020913	GGAAG	2	10	722527	722536	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020913	GCACC	2	10	748424	748433	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_020913	TGGAT	2	10	752129	752138	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020913	CATCC	2	10	770007	770016	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_020913	GAATA	2	10	785068	785077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020913	GATCC	2	10	785507	785516	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_020913	TCAAT	2	10	791635	791644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020913	ATATT	2	10	791659	791668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020913	AACCG	2	10	793510	793519	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020913	TTCCG	2	10	796271	796280	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_020913	AGAGA	2	10	822068	822077	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020913	CATAT	2	10	825762	825771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020913	GGGAG	2	10	826027	826036	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020913	GGGAT	2	10	826257	826266	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020913	AGTAA	2	10	848014	848023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020913	TTAAC	2	10	849944	849953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020913	ATAAA	2	10	849989	849998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020913	GAGGC	2	10	851745	851754	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020913	TACTG	2	10	857408	857417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020913	CCTTT	2	10	857489	857498	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_020913	CCGAA	2	10	868330	868339	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_020913	CCCTT	2	10	904472	904481	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_020913	TATAA	2	10	911609	911618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020913	AGATT	2	10	920039	920048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020913	AAAGC	2	10	934869	934878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020913	CACTT	2	10	934898	934907	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_020913	ACATC	2	10	948050	948059	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_020913	GGACC	2	10	948158	948167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_020913	ATGGC	2	10	948415	948424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020913	CACTG	2	10	953821	953830	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_020913	CTTGA	2	10	954016	954025	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020913	TATCA	2	10	974025	974034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020913	GAAAA	2	10	995623	995632	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020913	GGCCG	2	10	1004287	1004296	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_020913	TTTAT	2	10	1032583	1032592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020913	ATTTT	2	10	1039176	1039185	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020913	TGGAC	2	10	1066296	1066305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020913	CAAAC	2	10	1082373	1082382	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_020913	TGGAT	2	10	1103500	1103509	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020913	CGATG	2	10	1104879	1104888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020913	GGGAC	2	10	1111067	1111076	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020913	GAACA	2	10	1126534	1126543	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020913	TAATA	2	10	1126655	1126664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020913	GGGGA	2	10	1130154	1130163	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020913	TTGGA	2	10	1151926	1151935	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020913	TATAA	2	10	1175315	1175324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020913	TATAA	2	10	1180654	1180663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020913	GACGG	2	10	1199050	1199059	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020913	GATAT	2	10	1202218	1202227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020913	ACAGA	2	10	1208752	1208761	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020913	CCGTC	2	10	1211174	1211183	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_020913	TTTTC	2	10	1217560	1217569	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020913	ATTAT	2	10	1221436	1221445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020913	GTAGT	2	10	1225612	1225621	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020913	TTCCC	2	10	1252706	1252715	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_020913	ATTAA	2	10	1254144	1254153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020913	GGTCC	2	10	1254534	1254543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_020913	GGTCC	2	10	1254909	1254918	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_020913	ATCGA	2	10	1265490	1265499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020913	AGAAA	2	10	1266584	1266593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020913	CCATC	2	10	1275952	1275961	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_020913	GGTCC	2	10	1284407	1284416	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_020913	GGTCC	2	10	1284785	1284794	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_020913	GGTCC	2	10	1285153	1285162	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_020913	GGGCT	2	10	1297480	1297489	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_020913	TCCCG	2	10	1310590	1310599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_020913	CTACA	2	10	1318575	1318584	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_020913	TATAG	2	10	1357444	1357453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020913	AAACC	2	10	1362673	1362682	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020913	CTAAA	2	10	1363796	1363805	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020913	CCACG	2	10	1376427	1376436	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_020913	GTAGT	2	10	1376593	1376602	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020913	GGTAG	2	10	1415072	1415081	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020913	CCCGG	2	10	1430426	1430435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_020913	AACGG	2	10	1430468	1430477	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020913	TGGGC	2	10	1432856	1432865	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020913	GTTTA	2	10	1446756	1446765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020913	GAAGA	2	10	1456413	1456422	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020913	CGATG	2	10	1456472	1456481	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_020913	GAAGG	2	10	1463809	1463818	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020913	TCATC	2	10	1470831	1470840	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_020913	GAACC	2	10	1487150	1487159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_020913	TAAAA	2	10	1509980	1509989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020913	CCGAG	2	10	1526458	1526467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_020913	TTGAA	2	10	1559018	1559027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020913	CCGGC	2	10	1577196	1577205	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
150	NC_020913	ACGGA	2	10	1592410	1592419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_020913	TAATA	2	10	1606244	1606253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020913	GAGGG	2	10	1608085	1608094	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020913	TAGCT	2	10	1626319	1626328	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_020913	TGGGT	2	10	1638491	1638500	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020913	GCTCG	2	10	1647211	1647220	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
156	NC_020913	GCAGA	2	10	1665124	1665133	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.