MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 8956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020891	GGCCG	2	10	924256	924265	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3003	NC_020891	AGC	2	6	924302	924307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_020891	CGG	2	6	924318	924323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_020891	CG	3	6	924325	924330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_020891	CGG	2	6	924336	924341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_020891	ACC	2	6	924347	924352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_020891	GCG	2	6	924362	924367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_020891	GGGC	2	8	924399	924406	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_020891	GC	4	8	924435	924442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_020891	TCG	2	6	924459	924464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_020891	CACGGT	2	12	924532	924543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_020891	CGC	2	6	924544	924549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_020891	CG	4	8	924636	924643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_020891	GGTCGG	2	12	924646	924657	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3016	NC_020891	GGC	2	6	924663	924668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_020891	TCGG	2	8	924675	924682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_020891	CTC	2	6	924683	924688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_020891	CGGG	2	8	924728	924735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_020891	CGGC	2	8	924776	924783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_020891	GCCG	2	8	925648	925655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_020891	GTCC	2	8	926202	926209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_020891	CAC	2	6	926217	926222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_020891	GCC	2	6	926292	926297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_020891	CTT	2	6	926354	926359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3028	NC_020891	GACC	2	8	931467	931474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_020891	GC	3	6	931499	931504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_020891	CGCCT	2	10	931506	931515	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3031	NC_020891	GA	3	6	931526	931531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_020891	GTGCC	2	10	932708	932717	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3033	NC_020891	CGG	2	6	932765	932770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_020891	CGC	2	6	932774	932779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_020891	CCG	2	6	932792	932797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_020891	CGA	2	6	933580	933585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_020891	GCG	2	6	933588	933593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_020891	CCG	2	6	933600	933605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_020891	GTC	2	6	933653	933658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3041	NC_020891	GATGC	2	10	933691	933700	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_020891	GC	3	6	933699	933704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_020891	ATC	2	6	933720	933725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3045	NC_020891	ACG	2	6	934202	934207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_020891	GGGCC	2	10	934210	934219	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3047	NC_020891	GGC	2	6	935655	935660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3049	NC_020891	GCG	2	6	937195	937200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_020891	GCG	2	6	937204	937209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_020891	GC	3	6	937213	937218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_020891	GC	3	6	937230	937235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_020891	CGGGCG	2	12	937240	937251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_020891	GCG	2	6	937258	937263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_020891	G	6	6	937309	937314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_020891	GCC	2	6	937363	937368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_020891	GAG	2	6	937376	937381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_020891	CGTC	2	8	944162	944169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_020891	CG	4	8	944170	944177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_020891	CGG	2	6	944191	944196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_020891	CGA	2	6	944203	944208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_020891	GCGG	2	8	944243	944250	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_020891	GGAC	2	8	947789	947796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_020891	TGC	2	6	947847	947852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_020891	CGG	2	6	947897	947902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_020891	CCG	2	6	947952	947957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_020891	GGAGG	2	10	949884	949893	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_020891	CCGC	3	12	951968	951979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3073	NC_020891	CGAG	2	8	951992	951999	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_020891	GAC	3	9	953674	953682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3100	NC_020891	GAG	3	9	971531	971539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_020891	CGA	2	6	971575	971580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_020891	CGCC	2	8	971599	971606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3105	NC_020891	CGT	3	9	971641	971649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3108	NC_020891	GC	3	6	971755	971760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_020891	CG	3	6	971762	971767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3112	NC_020891	GCCG	2	8	971848	971855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_020891	ACG	2	6	971959	971964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3119	NC_020891	GCG	2	6	972019	972024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_020891	GC	3	6	972596	972601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_020891	GAG	2	6	972602	972607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_020891	GC	3	6	975189	975194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_020891	CGC	2	6	975212	975217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_020891	GGCG	2	8	975218	975225	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_020891	CG	3	6	975230	975235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_020891	GAT	2	6	975252	975257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_020891	CCCGC	2	10	976708	976717	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3129	NC_020891	CGA	2	6	976721	976726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3131	NC_020891	CGT	2	6	976751	976756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_020891	GTG	2	6	976760	976765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_020891	CG	3	6	978615	978620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_020891	CGC	2	6	979209	979214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3136	NC_020891	CG	3	6	979918	979923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3255	NC_020891	CTC	2	6	1048502	1048507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3402	NC_020891	CCCG	2	8	1099477	1099484	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3403	NC_020891	CCA	2	6	1101098	1101103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3434	NC_020891	CGT	2	6	1111109	1111114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3472	NC_020891	CGG	2	6	1115739	1115744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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