MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC2

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020553	AAC	2	6	1	6	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020553	CAGG	2	8	22	29	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020553	GGCC	2	8	91	98	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020553	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020553	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020553	AACT	2	8	221	228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020553	CGT	2	6	243	248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020553	GTC	2	6	257	262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020553	AAG	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020553	AGC	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020553	AGT	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020553	GAC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020553	CAC	2	6	2911	2916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020553	ACA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020553	TGG	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020553	TCA	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020553	ACG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020553	TGG	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020553	CTGG	2	8	4517	4524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020553	TCG	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020553	TA	3	6	4616	4621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020553	TCA	2	6	5229	5234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020553	TCC	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020553	ATG	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020553	GTC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020553	CAT	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020553	TGG	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020553	CGA	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020553	TCC	2	6	7094	7099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020553	TAC	2	6	7472	7477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020553	CGG	2	6	7491	7496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020553	G	7	7	7580	7586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020553	TCT	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020553	CGT	2	6	8394	8399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020553	GGGC	2	8	8580	8587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020553	GCCT	2	8	8606	8613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020553	TCG	2	6	8631	8636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020553	GAG	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020553	CGG	2	6	8709	8714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020553	TGG	2	6	10783	10788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020553	GTC	2	6	10791	10796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020553	GGGT	2	8	10836	10843	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020553	GCC	2	6	10869	10874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020553	GAA	2	6	11003	11008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020553	TCC	2	6	11043	11048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020553	GCAG	2	8	11081	11088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020553	GAA	2	6	11114	11119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020553	AGG	2	6	11132	11137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020553	AGA	2	6	11734	11739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020553	TCG	2	6	11833	11838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020553	GGC	2	6	11849	11854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020553	CAC	2	6	15354	15359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020553	TAA	2	6	15421	15426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020553	GTCC	2	8	17595	17602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020553	ACTC	2	8	17655	17662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020553	GCT	2	6	17814	17819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020553	CGG	2	6	18995	19000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020553	TCT	2	6	19281	19286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020553	CGG	2	6	19288	19293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020553	CAG	2	6	19304	19309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020553	GCC	2	6	19352	19357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020553	GAA	2	6	20340	20345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020553	TTC	2	6	21523	21528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020553	CTT	2	6	21584	21589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020553	CTT	2	6	21843	21848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020553	TGG	2	6	21851	21856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020553	GCG	3	9	21876	21884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020553	TAA	2	6	21896	21901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020553	TCC	2	6	25398	25403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020553	GAG	2	6	25412	25417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020553	AAGT	2	8	25459	25466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020553	GGA	2	6	25495	25500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020553	CGGG	2	8	25514	25521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020553	TCC	2	6	25523	25528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020553	AT	3	6	25539	25544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020553	ACAA	2	8	25585	25592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020553	A	6	6	25591	25596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020553	CTA	2	6	25628	25633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020553	TCA	2	6	27662	27667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020553	ACC	2	6	27707	27712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020553	GAT	2	6	27726	27731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020553	GAC	2	6	27746	27751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020553	ATT	2	6	27775	27780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020553	CTA	2	6	27795	27800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020553	ATG	2	6	27827	27832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020553	GA	3	6	27859	27864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020553	GAA	2	6	28710	28715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020553	GTT	2	6	28718	28723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020553	TGGG	2	8	28729	28736	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020553	TCA	2	6	29435	29440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020553	ACC	2	6	29480	29485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_020553	GAT	2	6	29499	29504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020553	GAC	2	6	29519	29524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020553	GTC	2	6	31441	31446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020553	ACTC	2	8	31447	31454	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020553	CTT	2	6	31475	31480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020553	AT	3	6	31576	31581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020553	AT	3	6	31584	31589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020553	TTTTC	2	10	32323	32332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020553	TA	3	6	33392	33397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020553	GAC	2	6	33517	33522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020553	ACC	2	6	34835	34840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020553	CACAC	2	10	34868	34877	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_020553	T	6	6	35082	35087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020553	GCT	2	6	35093	35098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020553	T	6	6	35103	35108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020553	ACC	2	6	35109	35114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_020553	AT	3	6	35175	35180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020553	TGT	2	6	35228	35233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020553	CCCA	2	8	35254	35261	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_020553	A	6	6	35265	35270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020553	GAA	2	6	35322	35327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020553	CGC	2	6	35333	35338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020553	TA	3	6	35710	35715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020553	AAT	2	6	35734	35739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020553	ACG	3	9	35775	35783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020553	CCA	2	6	36572	36577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020553	TTCA	2	8	46646	46653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020553	A	6	6	48391	48396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020553	TA	3	6	48416	48421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020553	AT	4	8	48425	48432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020553	ATAA	2	8	48443	48450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020553	GTT	2	6	48492	48497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020553	CAG	2	6	48620	48625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020553	ACTG	2	8	48631	48638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020553	C	6	6	48719	48724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_020553	AAT	2	6	48751	48756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020553	TCG	2	6	48796	48801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020553	CA	3	6	48866	48871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020553	GAC	2	6	48883	48888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020553	TC	3	6	48940	48945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020553	GT	3	6	48951	48956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020553	TTA	2	6	48990	48995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020553	TCT	2	6	49051	49056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020553	TCC	2	6	51224	51229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020553	TAT	2	6	51773	51778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020553	CT	3	6	51785	51790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020553	CTG	2	6	51802	51807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020553	TAA	2	6	51811	51816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020553	CTGA	2	8	51840	51847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020553	TCT	2	6	56278	56283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020553	TCA	2	6	58387	58392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020553	TGT	2	6	58394	58399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020553	GTT	2	6	58407	58412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020553	CCCG	2	8	58518	58525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_020553	GAA	2	6	62385	62390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020553	AAAG	2	8	69629	69636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020553	CT	3	6	70302	70307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020553	GTG	2	6	70315	70320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020553	GGT	2	6	70323	70328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020553	ACC	2	6	70335	70340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_020553	CAC	2	6	70343	70348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_020553	GGC	2	6	74503	74508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_020553	TGGG	2	8	75565	75572	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_020553	GTG	2	6	77686	77691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_020553	TAT	2	6	79328	79333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_020553	TTA	2	6	79383	79388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020553	T	6	6	79390	79395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_020553	AT	3	6	83940	83945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_020553	GCA	2	6	84044	84049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_020553	GAA	2	6	84068	84073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
200	NC_020553	TCCA	2	8	84109	84116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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202	NC_020553	AC	3	6	84881	84886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.