MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy

Total Repeats: 876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020549	ATAG	2	8	32	39	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020549	AACG	2	8	69	76	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020549	CAAG	2	8	1010	1017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020549	TTCC	2	8	1339	1346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020549	TAAA	2	8	1600	1607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020549	ATGG	2	8	5244	5251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020549	AAAC	2	8	6026	6033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020549	TTCT	2	8	10678	10685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020549	CAAC	2	8	17233	17240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020549	AAAC	2	8	17251	17258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020549	AATA	2	8	19505	19512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020549	ATCA	2	8	21042	21049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020549	TTGA	2	8	21162	21169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020549	CACT	2	8	21369	21376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020549	AAGC	2	8	23985	23992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020549	AGAA	2	8	24386	24393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020549	ATAA	2	8	24478	24485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020549	TACA	2	8	24488	24495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020549	TTCT	2	8	25586	25593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020549	GTTA	2	8	25835	25842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020549	TCTT	2	8	28035	28042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020549	TTTA	2	8	28826	28833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020549	ATAA	2	8	28860	28867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020549	TGTA	2	8	29204	29211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020549	TAGT	2	8	30446	30453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020549	ACAT	2	8	31565	31572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020549	AGCA	2	8	34547	34554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020549	CTTC	2	8	34792	34799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020549	GCCT	2	8	42941	42948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020549	ATTT	2	8	43072	43079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020549	TATT	2	8	43205	43212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020549	GTTA	2	8	43405	43412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020549	CTTT	2	8	44278	44285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020549	ATTG	2	8	48674	48681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020549	CATA	2	8	52751	52758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020549	TAGA	2	8	57437	57444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020549	ATTC	2	8	57801	57808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020549	TCCT	2	8	57835	57842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020549	GTCG	2	8	58161	58168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020549	GAAA	2	8	60312	60319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020549	ATTA	2	8	61902	61909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020549	AATG	2	8	61910	61917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020549	GGAA	2	8	62393	62400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020549	AAGA	2	8	62643	62650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020549	GAAA	2	8	62663	62670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020549	AATA	2	8	68241	68248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020549	CATC	2	8	68323	68330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020549	TTTA	2	8	70122	70129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020549	CATT	2	8	70271	70278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020549	ACAA	2	8	70617	70624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020549	TTTA	2	8	70674	70681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020549	GAAA	2	8	71233	71240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020549	ATAA	2	8	71453	71460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020549	AATT	2	8	72142	72149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020549	GTAT	2	8	74316	74323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020549	AAAG	2	8	75491	75498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020549	AACA	2	8	75624	75631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020549	ATTT	2	8	75815	75822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020549	TTCA	2	8	77791	77798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020549	AAAT	2	8	79836	79843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020549	CTAT	2	8	79944	79951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020549	AACG	2	8	79978	79985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020549	ATTT	2	8	80013	80020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020549	CAAT	2	8	80064	80071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020549	TTAA	2	8	80447	80454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020549	AATG	2	8	85848	85855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020549	CAAT	2	8	85887	85894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020549	ATTA	2	8	87182	87189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020549	TTTG	2	8	89687	89694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020549	AACA	2	8	89920	89927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020549	ACCG	2	8	90007	90014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020549	CAGA	2	8	90593	90600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020549	CATA	2	8	91130	91137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020549	AAGT	2	8	93044	93051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020549	CTTT	2	8	94498	94505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020549	ATTG	2	8	100284	100291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020549	TTCT	2	8	101848	101855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020549	AAGA	2	8	103120	103127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020549	ATAA	2	8	103152	103159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020549	CAGT	2	8	104385	104392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020549	ATTG	2	8	110584	110591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020549	TTGA	2	8	110708	110715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020549	AATC	2	8	110818	110825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020549	TAGA	2	8	110842	110849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020549	TATT	2	8	110917	110924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020549	CATA	2	8	110996	111003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020549	TTTC	2	8	112322	112329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020549	CTAA	2	8	112330	112337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020549	AAAT	2	8	118317	118324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020549	ACCT	2	8	124729	124736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020549	AAAC	2	8	127970	127977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020549	AATA	2	8	131225	131232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020549	AATT	2	8	134967	134974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020549	TCTT	2	8	141714	141721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020549	ATAA	2	8	142999	143006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020549	AAAT	2	8	146048	146055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020549	TCAT	2	8	146432	146439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020549	CAAT	2	8	148256	148263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020549	ATTG	2	8	152984	152991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020549	ACTA	2	8	154079	154086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020549	ACAT	2	8	154252	154259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020549	AAAT	2	8	154394	154401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020549	ACAA	2	8	154595	154602	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020549	TTAA	2	8	157893	157900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020549	TTCA	2	8	164330	164337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020549	AATT	2	8	166573	166580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020549	CAAA	2	8	166635	166642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020549	AACC	2	8	166674	166681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020549	ATTT	2	8	169716	169723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020549	AATA	2	8	171994	172001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020549	TCTA	2	8	174260	174267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020549	AGGG	2	8	174821	174828	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020549	ATTA	2	8	181316	181323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020549	GTTA	2	8	184057	184064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020549	AATT	2	8	184321	184328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020549	ACAA	2	8	185815	185822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020549	ATGA	2	8	188013	188020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020549	ATTC	2	8	188637	188644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020549	AAAT	2	8	188874	188881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020549	TCAT	2	8	189038	189045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020549	TCTT	3	12	189865	189876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020549	TAAG	2	8	190148	190155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020549	AAAT	2	8	191548	191555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020549	ATTT	2	8	191590	191597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020549	CCAA	2	8	191742	191749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020549	TAAA	2	8	193122	193129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020549	AATA	2	8	193187	193194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020549	CAAA	2	8	197185	197192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020549	CAAA	2	8	197271	197278	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020549	ACCA	2	8	200889	200896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020549	TTAC	2	8	203948	203955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020549	ATGA	2	8	204121	204128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020549	ATAC	2	8	204243	204250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020549	CTTA	2	8	209678	209685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020549	TTTC	2	8	212017	212024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020549	TTCT	2	8	212811	212818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020549	CTAA	2	8	220875	220882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020549	ATTT	3	12	221096	221107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020549	TGAT	2	8	221136	221143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020549	ATCT	2	8	221233	221240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020549	TAGT	2	8	221249	221256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020549	TAAC	2	8	221739	221746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020549	GATT	2	8	221851	221858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020549	GGCA	2	8	222084	222091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020549	AATG	2	8	222291	222298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020549	TCCT	2	8	222540	222547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020549	AAAT	2	8	225957	225964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020549	AATC	2	8	226191	226198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020549	TCCA	2	8	228705	228712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020549	TCGA	2	8	233316	233323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020549	AAGG	2	8	233433	233440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020549	CAAA	2	8	238128	238135	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_020549	ATTT	2	8	242816	242823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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