MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 2958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020512	GAT	2	6	556484	556489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020512	AAAAG	2	10	558722	558731	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020512	ACAA	2	8	558744	558751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_020512	GAT	2	6	558752	558757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020512	GAAA	2	8	558767	558774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020512	A	6	6	558781	558786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020512	AGGA	2	8	558792	558799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020512	A	9	9	558823	558831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020512	CT	3	6	558849	558854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_020512	A	6	6	558860	558865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020512	AAT	2	6	558872	558877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020512	CTT	2	6	558901	558906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_020512	AAC	2	6	558926	558931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_020512	AGA	2	6	558935	558940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020512	CTT	2	6	558943	558948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_020512	TCT	2	6	558951	558956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_020512	TCA	2	6	558963	558968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_020512	CAG	2	6	558982	558987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_020512	GCA	2	6	558990	558995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_020512	T	6	6	559022	559027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020512	AAT	2	6	559062	559067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020512	TC	3	6	559083	559088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_020512	A	6	6	559093	559098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020512	TCT	2	6	559982	559987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_020512	ATA	2	6	560012	560017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020512	TTC	2	6	560035	560040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_020512	CTG	2	6	560052	560057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_020512	GAG	2	6	560087	560092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1530	NC_020512	TCT	2	6	560869	560874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_020512	AAG	2	6	560906	560911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020512	GTT	2	6	560939	560944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020512	AAG	2	6	560966	560971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020512	TCT	2	6	560974	560979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_020512	GCTT	2	8	561004	561011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1539	NC_020512	T	8	8	561109	561116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020512	TCT	2	6	561129	561134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_020512	AG	3	6	561143	561148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020512	A	9	9	561169	561177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020512	GA	3	6	562641	562646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020512	CCAC	2	8	564509	564516	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1545	NC_020512	CTTG	2	8	565844	565851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_020512	AGA	2	6	565854	565859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020512	GAAAA	2	10	565906	565915	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_020512	A	6	6	567267	567272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020512	ATT	2	6	567288	567293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020512	A	6	6	567294	567299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020512	ACAA	2	8	567305	567312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_020512	ATT	2	6	567320	567325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020512	A	6	6	567334	567339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020512	ATTTT	2	10	567343	567352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020512	AAAAAT	2	12	567363	567374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020512	A	6	6	567389	567394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020512	TAA	2	6	573317	573322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020512	CAA	2	6	573348	573353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_020512	TAAA	2	8	573391	573398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020512	A	6	6	573396	573401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020512	ATACT	2	10	573416	573425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1563	NC_020512	TCT	2	6	573437	573442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_020512	TCCT	2	8	575075	575082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_020512	TGC	2	6	575229	575234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1567	NC_020512	AGCA	2	8	575869	575876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_020512	CAA	2	6	575917	575922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_020512	A	6	6	575921	575926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020512	CAAA	3	12	575931	575942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_020512	AG	3	6	575975	575980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020512	AAC	2	6	576064	576069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_020512	T	10	10	576109	576118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020512	A	6	6	576151	576156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020512	CTT	2	6	577757	577762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1579	NC_020512	A	6	6	577922	577927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020512	A	7	7	577958	577964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020512	ATAG	2	8	577989	577996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1585	NC_020512	GCAC	2	8	581058	581065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_020512	AAAGG	2	10	582372	582381	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1594	NC_020512	A	8	8	583243	583250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_020512	AGT	2	6	587583	587588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_020512	TTC	2	6	595690	595695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_020512	CTTC	2	8	595697	595704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1601	NC_020512	CAAA	2	8	597539	597546	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_020512	GGC	2	6	597547	597552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_020512	CA	3	6	597584	597589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_020512	GAA	2	6	597684	597689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020512	A	6	6	597780	597785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020512	A	6	6	597827	597832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020512	ACCT	2	8	598738	598745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_020512	TACA	2	8	598760	598767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_020512	AG	3	6	598774	598779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020512	GCA	2	6	598821	598826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_020512	A	6	6	598860	598865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020512	TAT	2	6	602038	602043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020512	T	12	12	602046	602057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020512	AGCA	2	8	602058	602065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_020512	A	6	6	602075	602080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020512	TAC	2	6	602082	602087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_020512	GA	3	6	603774	603779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020512	TAG	2	6	604377	604382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1620	NC_020512	GGA	2	6	604415	604420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020512	TTC	2	6	606386	606391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_020512	CTTC	2	8	606405	606412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_020512	CTAC	2	8	606447	606454	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_020512	TAGGGG	2	12	606516	606527	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020512	TA	3	6	606686	606691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020512	AGA	2	6	606723	606728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020512	CCA	2	6	606740	606745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_020512	TTA	2	6	606773	606778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020512	TC	3	6	606788	606793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_020512	TCT	2	6	606880	606885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_020512	CTT	2	6	606896	606901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_020512	CAA	2	6	606904	606909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_020512	TTGC	2	8	606991	606998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_020512	CCT	2	6	607021	607026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_020512	CT	3	6	607379	607384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_020512	A	6	6	607881	607886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_020512	TTC	2	6	608632	608637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_020512	T	6	6	608668	608673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1640	NC_020512	T	8	8	611828	611835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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