MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 2958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020512	TGT	2	6	182880	182885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020512	T	6	6	182898	182903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020512	T	7	7	182905	182911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020512	AAAG	2	8	182957	182964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020512	GATG	2	8	182989	182996	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020512	TCT	2	6	183006	183011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_020512	AGG	2	6	183060	183065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020512	GGA	2	6	183094	183099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020512	TTGAG	2	10	183140	183149	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020512	GAATG	2	10	183165	183174	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020512	CT	3	6	183215	183220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_020512	TGA	2	6	183229	183234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020512	GA	4	8	183257	183264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020512	AAC	2	6	183312	183317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_020512	TGA	2	6	183331	183336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020512	TGC	2	6	183367	183372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_020512	CCAG	2	8	183387	183394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_020512	TTG	2	6	183396	183401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020512	GAC	2	6	183405	183410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020512	GAT	2	6	183435	183440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020512	GA	3	6	183461	183466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020512	GCG	2	6	183469	183474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020512	ACT	2	6	183517	183522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_020512	TAG	2	6	183551	183556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020512	GCA	2	6	183606	183611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020512	TCGC	2	8	183649	183656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
527	NC_020512	AGA	2	6	183660	183665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020512	GCA	2	6	183669	183674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020512	GAA	2	6	183697	183702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020512	AGA	2	6	183736	183741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020512	GA	3	6	183775	183780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020512	GTT	2	6	183792	183797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020512	GTT	2	6	183827	183832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020512	CTT	2	6	183835	183840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_020512	GA	3	6	183878	183883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020512	GTT	2	6	183889	183894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020512	GAG	2	6	183910	183915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020512	GAA	2	6	183930	183935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020512	TTG	2	6	183941	183946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020512	AGG	2	6	183980	183985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020512	AGA	2	6	184076	184081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020512	TGA	2	6	184098	184103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020512	CAG	3	9	184171	184179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_020512	GTA	2	6	184214	184219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020512	GTTG	2	8	184254	184261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020512	GGA	3	9	184269	184277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020512	TC	3	6	184285	184290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_020512	ATT	2	6	184304	184309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020512	A	7	7	184334	184340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020512	T	8	8	184346	184353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020512	ATA	2	6	184396	184401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020512	A	6	6	184401	184406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020512	TAT	2	6	184477	184482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020512	GA	3	6	184517	184522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020512	GTT	2	6	185839	185844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020512	GTT	4	12	186237	186248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020512	T	6	6	186254	186259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020512	T	7	7	186262	186268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020512	T	6	6	186274	186279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020512	T	7	7	186324	186330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020512	A	7	7	186346	186352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020512	T	6	6	186369	186374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020512	ATC	2	6	188064	188069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020512	CGATA	2	10	188092	188101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
565	NC_020512	T	6	6	188105	188110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020512	TAT	2	6	188419	188424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020512	T	6	6	188438	188443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020512	GCA	2	6	188491	188496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020512	CTT	2	6	188506	188511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_020512	GGAC	2	8	188533	188540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_020512	AAG	2	6	188643	188648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020512	TTG	2	6	188665	188670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020512	CAT	2	6	188675	188680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_020512	T	7	7	188714	188720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020512	TAA	2	6	188793	188798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020512	TTG	2	6	188821	188826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020512	CGTA	2	8	189302	189309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_020512	G	10	10	189321	189330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020512	TCC	2	6	189356	189361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_020512	CAG	2	6	189364	189369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_020512	A	6	6	189383	189388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020512	AGA	2	6	189398	189403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020512	GAA	2	6	189404	189409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020512	GGA	2	6	189410	189415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020512	CTT	2	6	189418	189423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_020512	AGA	2	6	189479	189484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020512	TAAA	2	8	189532	189539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020512	AAG	2	6	192623	192628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020512	TC	3	6	192633	192638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_020512	GAG	2	6	192715	192720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020512	TCT	2	6	192730	192735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_020512	TATGC	2	10	192788	192797	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
593	NC_020512	GAA	2	6	192891	192896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020512	AAGAA	2	10	192954	192963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020512	AAT	2	6	192964	192969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020512	AT	3	6	192975	192980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020512	TGT	2	6	192989	192994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020512	ATGC	2	8	193349	193356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_020512	GTT	2	6	193357	193362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020512	GCA	2	6	193410	193415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_020512	CTTT	2	8	193490	193497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_020512	AAG	2	6	193537	193542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020512	T	6	6	193587	193592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020512	ATT	2	6	193600	193605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020512	T	6	6	193616	193621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020512	TATGAA	2	12	195592	195603	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020512	AGA	2	6	195648	195653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020512	AAC	2	6	195655	195660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_020512	ATA	2	6	195675	195680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020512	T	7	7	195700	195706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020512	TGA	2	6	195810	195815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020512	CTC	2	6	196890	196895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_020512	GGA	2	6	196946	196951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020512	A	7	7	197730	197736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020512	AG	3	6	197752	197757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020512	AAT	2	6	197762	197767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020512	T	9	9	197782	197790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020512	T	6	6	197829	197834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020512	TAC	2	6	197873	197878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020512	ATT	2	6	197882	197887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020512	A	8	8	200677	200684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020512	CTT	2	6	200716	200721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020512	A	8	8	200726	200733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020512	TC	3	6	200744	200749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_020512	CTT	2	6	200753	200758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_020512	A	6	6	202522	202527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020512	AG	3	6	202576	202581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020512	TGC	2	6	202630	202635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020512	AGG	2	6	202651	202656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020512	ACGA	2	8	203363	203370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_020512	CTAAG	2	10	203529	203538	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
632	NC_020512	T	6	6	203636	203641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020512	GAAA	2	8	203648	203655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020512	A	7	7	203653	203659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020512	T	6	6	204427	204432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020512	TAAA	2	8	204449	204456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020512	CT	3	6	204502	204507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_020512	AAT	2	6	204549	204554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020512	TAG	2	6	204585	204590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020512	AAT	2	6	204598	204603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_020512	T	7	7	341921	341927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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