MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020506	TTCTTT	2	12	15019	15030	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020506	AAGGAG	2	12	22031	22042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020506	GATGGC	2	12	97493	97504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020506	ATTAAT	2	12	97888	97899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020506	GTATGT	2	12	100716	100727	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020506	TTGTGG	2	12	105581	105592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020506	CCTCTC	2	12	106512	106523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020506	GTATGT	2	12	108799	108810	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020506	TTGTGG	2	12	113664	113675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020506	TGGACT	2	12	139574	139585	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020506	GCTCTT	2	12	186194	186205	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020506	TTGGCT	2	12	186954	186965	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020506	GTGACT	2	12	240008	240019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020506	TCACTT	2	12	243944	243955	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020506	CGGGCG	2	12	275839	275850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020506	ATAGGT	2	12	292590	292601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020506	TTTCTT	2	12	325120	325131	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020506	CACCGC	2	12	345673	345684	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_020506	TGTCAG	2	12	459536	459547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020506	AGTCAC	2	12	500103	500114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020506	ACGCAT	2	12	531496	531507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020506	ACGCAC	2	12	585583	585594	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020506	GGAGGT	2	12	606320	606331	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020506	TGTTTT	2	12	618042	618053	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020506	CCAGCA	2	12	627045	627056	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020506	GAGCTG	2	12	709135	709146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020506	CTTGCG	2	12	735524	735535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020506	AGCTGA	2	12	794322	794333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020506	ACATAC	2	12	815402	815413	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020506	TTGTGG	2	12	834114	834125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020506	ACTTTC	2	12	850760	850771	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020506	TTCACA	2	12	854000	854011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020506	TAACAA	2	12	857916	857927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020506	AAGGGG	2	12	1012650	1012661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020506	TTCAGC	2	12	1033023	1033034	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020506	CTTTCA	2	12	1096949	1096960	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020506	CAGCTT	2	12	1152562	1152573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020506	GGGCTT	2	12	1187104	1187115	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020506	AACCCA	2	12	1198919	1198930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020506	CAGAAC	2	12	1215035	1215046	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020506	ATCGAC	2	12	1284439	1284450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020506	AGTATC	2	12	1292968	1292979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020506	GAAAAA	2	12	1321762	1321773	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020506	TTTTCC	2	12	1323607	1323618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020506	AAAAAT	2	12	1329768	1329779	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020506	TAAAGC	2	12	1358549	1358560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020506	TTTAAA	2	12	1392289	1392300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020506	GTATGT	2	12	1392364	1392375	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020506	TTGTGG	2	12	1397229	1397240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020506	CAATCA	2	12	1418890	1418901	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020506	GTTTTA	2	12	1454794	1454805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020506	CTTATG	2	12	1458292	1458303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020506	AAAGTT	2	12	1512235	1512246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020506	ACAACT	2	12	1514689	1514700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020506	GACTTC	2	12	1515228	1515239	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020506	CCAGGA	2	12	1515257	1515268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020506	CCACTG	2	12	1579832	1579843	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020506	AGAAAG	2	12	1600124	1600135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020506	ACTCTT	2	12	1615017	1615028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020506	CACAAA	2	12	1621397	1621408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020506	CAAAAA	2	12	1692828	1692839	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020506	GACCTG	2	12	1749680	1749691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020506	TGCAGC	2	12	1790843	1790854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020506	ACCCCC	2	12	1810022	1810033	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
65	NC_020506	AGTGGC	2	12	1823006	1823017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020506	TTTTCA	2	12	1831619	1831630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020506	GATTCA	2	12	1840262	1840273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020506	CCAAAG	2	12	1840335	1840346	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020506	CATCAA	2	12	1842616	1842627	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020506	AAAACA	2	12	1964616	1964627	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020506	CCCTTT	2	12	2016370	2016381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020506	AAAGCC	2	12	2113888	2113899	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020506	CCAGCA	2	12	2115567	2115578	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020506	CGCCAC	2	12	2195677	2195688	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020506	TGCCAC	2	12	2294928	2294939	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020506	ACCACA	2	12	2311526	2311537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020506	ACCACA	2	12	2312560	2312571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020506	CCAACA	2	12	2314463	2314474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020506	GCGCCC	2	12	2392834	2392845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020506	CCAGAA	2	12	2493310	2493321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020506	TAAGAT	2	12	2510293	2510304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020506	GCGGAA	2	12	2532988	2532999	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020506	CCACAC	2	12	2548486	2548497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_020506	TTTTAG	2	12	2583316	2583327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020506	ATCCCC	2	12	2610635	2610646	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020506	CAGGAG	2	12	2658232	2658243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020506	ACCACA	2	12	2703886	2703897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020506	ACCACA	2	12	2704920	2704931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020506	CCAACA	2	12	2706823	2706834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020506	GGAGAG	2	12	2711038	2711049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020506	ACCACA	2	12	2711969	2711980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020506	ACCACA	2	12	2713003	2713014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020506	CCAACA	2	12	2714906	2714917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020506	ACATTC	2	12	2717540	2717551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020506	CCAATC	2	12	2786599	2786610	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020506	GCGACC	2	12	2799225	2799236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.