MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Cloacamonas acidaminovorans str. Evry provisional genome sequence from WWE1 candidate division

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020449	CTTTTT	2	12	46059	46070	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020449	CTCTTT	2	12	51341	51352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020449	TGGACT	2	12	78484	78495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020449	GATAGA	2	12	87301	87312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020449	TAAAAA	2	12	87378	87389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020449	TTAGAT	2	12	88823	88834	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020449	AAAATA	2	12	90035	90046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020449	GAAATG	2	12	100769	100780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020449	ATTTTA	2	12	145309	145320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020449	TATATT	2	12	185237	185248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020449	ATAATT	2	12	205070	205081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020449	AAATGA	2	12	205185	205196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020449	ATCTCC	2	12	291182	291193	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020449	ATTTTT	2	12	292350	292361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020449	AGAAAA	2	12	321347	321358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020449	CAGCTT	2	12	396467	396478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020449	AAAGAA	2	12	408256	408267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020449	GGTAAA	2	12	423654	423665	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020449	ACTTTA	2	12	442307	442318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020449	AAGGGC	2	12	528165	528176	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020449	GTGGAA	2	12	603494	603505	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020449	TTTTCT	2	12	626100	626111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020449	TTTTCT	2	12	626917	626928	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020449	CTTTTT	2	12	628105	628116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020449	CTTTTT	2	12	628536	628547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020449	AAAACA	2	12	634222	634233	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020449	AAAACA	2	12	635511	635522	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020449	TTTGAT	2	12	642301	642312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020449	CTTTTT	2	12	653063	653074	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020449	CTTTTC	2	12	657504	657515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020449	TATTGC	2	12	669747	669758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020449	TAAAAT	2	12	731669	731680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020449	TATAAA	2	12	764430	764441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020449	TAATTA	2	12	791530	791541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020449	TAAAAA	2	12	832837	832848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020449	TTTTAC	2	12	852048	852059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020449	TTTTCC	2	12	886503	886514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020449	GGAAGA	2	12	886583	886594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020449	AGAAAT	2	12	887439	887450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020449	TTTCTA	2	12	910340	910351	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020449	ATTTTA	2	12	916359	916370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020449	GAAAAA	2	12	947266	947277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020449	TTCATC	2	12	992875	992886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020449	TCAGAA	2	12	992894	992905	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020449	ATGATT	2	12	995463	995474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020449	TGAAAT	2	12	1037453	1037464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020449	TTATAA	2	12	1042096	1042107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020449	CTCAAC	2	12	1042396	1042407	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020449	CTTTTA	2	12	1071328	1071339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020449	ATAAAT	2	12	1257226	1257237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020449	TTCATC	2	12	1259562	1259573	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020449	GCCTTC	2	12	1269768	1269779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020449	CCTGTT	2	12	1301081	1301092	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020449	ATTCGG	2	12	1323626	1323637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020449	AAAAAG	2	12	1324018	1324029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020449	GAAAAA	2	12	1324289	1324300	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020449	AGAAAT	2	12	1330045	1330056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020449	ATATAG	2	12	1382820	1382831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020449	TTATTC	2	12	1404474	1404485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020449	AGTCGT	2	12	1426750	1426761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020449	TTTCTC	2	12	1480955	1480966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020449	CCCAAA	2	12	1481101	1481112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020449	ATGAAT	2	12	1487560	1487571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020449	GAGTAA	2	12	1491856	1491867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020449	GCCAAG	2	12	1494148	1494159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020449	CAAATA	2	12	1543056	1543067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020449	AATCAA	2	12	1547162	1547173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020449	ATTTTC	2	12	1574652	1574663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020449	CCTCTT	2	12	1583225	1583236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020449	TAAAAG	2	12	1645532	1645543	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020449	ATCGTT	2	12	1652107	1652118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020449	ACCTTC	2	12	1669417	1669428	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020449	AATTAA	2	12	1671641	1671652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020449	ATTTTC	2	12	1712623	1712634	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020449	AACAAT	2	12	1750887	1750898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020449	CGATAA	2	12	1795136	1795147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020449	GCCTTC	2	12	1800463	1800474	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020449	GTTTAA	2	12	1828908	1828919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020449	ATGGCA	2	12	1903333	1903344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020449	TGGAAA	2	12	1903505	1903516	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020449	AAAATA	2	12	1922114	1922125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020449	AGAAAA	2	12	1923872	1923883	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020449	GAAAGG	2	12	1925379	1925390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020449	CAGCCC	2	12	1940283	1940294	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_020449	TAATTC	2	12	1941736	1941747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020449	TTTATG	2	12	2028794	2028805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020449	TTCTCT	2	12	2058183	2058194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020449	TTCTCT	2	12	2058381	2058392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020449	TTTGTT	2	12	2123122	2123133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020449	GGGAAA	2	12	2145159	2145170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020449	TGTTTA	2	12	2161821	2161832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020449	ATTACA	2	12	2162382	2162393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020449	AAATTA	2	12	2164524	2164535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020449	AGCAGA	2	12	2177150	2177161	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020449	ATTTTA	2	12	2246539	2246550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.