MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Cloacamonas acidaminovorans str. Evry provisional genome sequence from WWE1 candidate division

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020449	AGAAA	2	10	1662	1671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020449	AAGGG	2	10	16439	16448	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020449	ATTTA	2	10	16505	16514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020449	TAACA	2	10	30614	30623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020449	CAATA	2	10	33552	33561	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020449	ATTGC	2	10	33626	33635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020449	AGGAA	2	10	36742	36751	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020449	TAAAA	2	10	58609	58618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020449	GGAAA	2	10	65891	65900	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020449	AAGTT	2	10	73468	73477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020449	AAAAG	2	10	78872	78881	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020449	TATTT	2	10	81675	81684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020449	TGAAA	2	10	82104	82113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020449	AATAA	2	10	100756	100765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020449	GTTAT	2	10	101520	101529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020449	ATTAT	2	10	103067	103076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020449	TTAAA	2	10	121212	121221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020449	TTAAA	2	10	123421	123430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020449	AGGCA	2	10	123605	123614	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020449	GAAAC	2	10	137568	137577	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020449	TTAAG	2	10	142378	142387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020449	TTTAT	2	10	145168	145177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020449	TTAAT	2	10	152171	152180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020449	AAACC	2	10	159273	159282	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020449	CAAAA	2	10	159403	159412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020449	TTTCC	2	10	169963	169972	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020449	ATAAG	2	10	189212	189221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020449	TCCCT	2	10	203058	203067	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_020449	TTCTT	2	10	213797	213806	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020449	TTCTT	2	10	213885	213894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020449	TTCTT	2	10	213972	213981	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020449	TTTCT	2	10	214059	214068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020449	TTTAC	2	10	231630	231639	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020449	AAACC	2	10	266265	266274	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_020449	TGAAC	2	10	295698	295707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020449	GCAAT	2	10	307645	307654	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020449	TTTTG	2	10	320897	320906	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020449	ATATG	2	10	320953	320962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020449	TTTTG	2	10	324315	324324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020449	TGATT	2	10	334469	334478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020449	AGAAA	2	10	334493	334502	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020449	TGTTT	2	10	334529	334538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020449	AGAAA	2	10	335046	335055	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020449	TATTT	2	10	340397	340406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020449	TATAA	2	10	348587	348596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020449	TTATG	2	10	386035	386044	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020449	AAGGA	2	10	390895	390904	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020449	TCAAG	2	10	393418	393427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020449	TCTTT	2	10	424921	424930	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020449	AATAT	2	10	425701	425710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020449	TGCTA	2	10	434109	434118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020449	AAACA	2	10	444366	444375	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020449	TTATT	2	10	448065	448074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020449	AGGAA	2	10	448724	448733	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020449	TTTTA	2	10	472437	472446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020449	ATATT	2	10	487745	487754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020449	AAATA	2	10	504618	504627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020449	TTTAA	2	10	511930	511939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020449	CTTTT	2	10	526856	526865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020449	TGGAG	2	10	528057	528066	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020449	CTCGC	2	10	565256	565265	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_020449	CCTAA	2	10	566308	566317	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020449	TAAAA	2	10	582634	582643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020449	ATGAT	2	10	582715	582724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020449	AGCAA	2	10	582883	582892	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020449	TCCAA	2	10	592996	593005	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_020449	CAAAA	2	10	593198	593207	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020449	TTGTT	2	10	598043	598052	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020449	GAAAG	2	10	598088	598097	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020449	GAAAA	2	10	610246	610255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020449	CCTAA	2	10	614938	614947	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_020449	TCCAA	2	10	626468	626477	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020449	TCCAA	2	10	626835	626844	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_020449	TCCAA	2	10	627285	627294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_020449	CAAAA	2	10	628840	628849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020449	AGGTA	2	10	642283	642292	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020449	GAAAA	2	10	658271	658280	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020449	CCACC	2	10	669682	669691	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
79	NC_020449	AAAAG	2	10	670529	670538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020449	TAAGA	2	10	674267	674276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020449	TAATC	2	10	674859	674868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020449	CTTTT	2	10	689149	689158	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020449	ATTAT	2	10	699823	699832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020449	TGGCT	2	10	704288	704297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020449	TTTAT	2	10	712880	712889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020449	TAAAA	2	10	728666	728675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020449	TAAAA	2	10	728864	728873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020449	TTTGT	2	10	743665	743674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020449	ATTAT	2	10	766536	766545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020449	TTCTT	2	10	805103	805112	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020449	ATAAA	2	10	805249	805258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020449	ATTAT	2	10	810005	810014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020449	CATAT	2	10	811317	811326	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020449	GGCAG	2	10	829459	829468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020449	GAAAA	2	10	835430	835439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020449	TTTTC	2	10	835765	835774	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020449	CTCTT	2	10	835926	835935	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_020449	AATTC	2	10	836335	836344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020449	ATGAA	2	10	855705	855714	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020449	GGTTG	2	10	874740	874749	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020449	CAAAA	2	10	887507	887516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020449	TATTT	2	10	904853	904862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020449	AGATT	2	10	916149	916158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020449	AGATT	2	10	916253	916262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020449	ATTTT	2	10	920315	920324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020449	ATTTT	2	10	920371	920380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020449	AAATC	2	10	920655	920664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020449	ATTTT	2	10	922109	922118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020449	AAAAT	2	10	927690	927699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020449	TATTT	2	10	931227	931236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020449	TATAA	2	10	944047	944056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020449	ATTTT	2	10	970921	970930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020449	CTTAT	2	10	970980	970989	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020449	AAAAT	2	10	971989	971998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020449	TTATT	2	10	985263	985272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020449	GTTTT	2	10	993346	993355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020449	TTGAA	2	10	994893	994902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020449	TTGAA	2	10	995121	995130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020449	TAAGA	2	10	999028	999037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020449	TAAAT	2	10	999394	999403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020449	AAAAT	2	10	999650	999659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020449	ATTTT	2	10	1006204	1006213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020449	TTCCT	2	10	1007237	1007246	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_020449	GAAAA	2	10	1007304	1007313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020449	AAAAT	2	10	1010746	1010755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020449	CTATT	2	10	1010766	1010775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020449	ATTTT	2	10	1025687	1025696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020449	GAAAG	2	10	1042672	1042681	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020449	ATATT	2	10	1060877	1060886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020449	AAATA	2	10	1094646	1094655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020449	AGATA	2	10	1094673	1094682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020449	ATAGG	2	10	1097332	1097341	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020449	AAAAG	2	10	1113797	1113806	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020449	TAAAA	2	10	1155928	1155937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020449	TTCCG	2	10	1165627	1165636	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_020449	GATTT	2	10	1168299	1168308	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020449	ATTAT	2	10	1177074	1177083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020449	TTTCT	2	10	1177085	1177094	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020449	AAAAT	2	10	1186844	1186853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020449	TAAAA	2	10	1195398	1195407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020449	GGTTG	2	10	1215335	1215344	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020449	AATAA	2	10	1215365	1215374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020449	TATTT	2	10	1217598	1217607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020449	AAAGA	2	10	1235943	1235952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020449	CAAAA	2	10	1243674	1243683	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020449	CTTTA	2	10	1265235	1265244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_020449	TAAAA	2	10	1265648	1265657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.