MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020303	GATGT	2	10	4076	4085	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020303	GTTGA	2	10	13444	13453	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020303	AGACA	2	10	14150	14159	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020303	GCCGC	2	10	14195	14204	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_020303	CGCTT	2	10	18945	18954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_020303	GGGGC	2	10	20377	20386	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020303	TGCGC	2	10	22499	22508	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_020303	GGGGT	2	10	22628	22637	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020303	CCCGC	2	10	24197	24206	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_020303	CGGTT	2	10	26278	26287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020303	GCCGG	2	10	32114	32123	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020303	AACGG	2	10	41274	41283	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020303	GCTGC	2	10	52986	52995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_020303	CATCC	2	10	55442	55451	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_020303	GGTGG	2	10	58528	58537	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020303	CGGTT	2	10	59963	59972	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020303	TCGAT	2	10	64438	64447	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020303	CCCGG	2	10	74343	74352	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_020303	CCGGG	2	10	74521	74530	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020303	CCCCG	2	10	76888	76897	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_020303	TCGCC	2	10	81691	81700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.