MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020302	CCCGCG	2	12	16454	16465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020302	TCAGGG	2	12	23045	23056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020302	GGCCGG	2	12	46508	46519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020302	CCCCGC	2	12	59693	59704	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
5	NC_020302	ACCGCC	2	12	59818	59829	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020302	CCGTGG	2	12	62682	62693	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020302	AGGTGC	2	12	75337	75348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020302	CCTGCC	2	12	82229	82240	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020302	GGGTGG	2	12	102105	102116	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020302	GAGCTG	2	12	109697	109708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020302	CTCACG	2	12	111080	111091	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020302	GCATGA	2	12	112572	112583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020302	TTTGAT	2	12	122774	122785	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020302	GGCCTA	2	12	125415	125426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020302	AGCGGA	2	12	153566	153577	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020302	TGGGGG	2	12	157031	157042	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020302	TCGTCC	2	12	203141	203152	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020302	GCCGGA	2	12	206996	207007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020302	GCCACC	2	12	223581	223592	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020302	GGCTCC	2	12	235199	235210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020302	TGCGGA	2	12	255934	255945	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020302	TCCCGG	2	12	270525	270536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020302	TCAGGC	2	12	275744	275755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020302	GCGGGG	2	12	281338	281349	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020302	CCGCCA	2	12	304986	304997	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020302	GCGGGC	2	12	323468	323479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020302	CCCGTT	2	12	324894	324905	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020302	GCCGAC	2	12	325710	325721	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020302	CCGGGG	2	12	331895	331906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020302	CGGGCG	2	12	332055	332066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020302	GCCCCG	2	12	340788	340799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020302	GGGGGA	2	12	365171	365182	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020302	GGCGTG	2	12	402146	402157	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020302	CCGCGG	2	12	445770	445781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020302	AGGGGA	2	12	511787	511798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020302	GGGAAC	2	12	554280	554291	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020302	GCGGTG	2	12	568166	568177	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020302	CGCCGG	2	12	568260	568271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020302	GAAATA	2	12	591410	591421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020302	CGGGGG	2	12	591440	591451	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020302	GGGACG	2	12	614236	614247	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020302	TGGGCG	2	12	616727	616738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020302	CCGGGG	2	12	641140	641151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020302	GTCCCG	2	12	681024	681035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020302	GCCTCG	2	12	700318	700329	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020302	GAGCAT	2	12	700954	700965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020302	CCGGGC	2	12	702424	702435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020302	GGTTCG	2	12	720765	720776	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020302	CCGGGG	2	12	729319	729330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020302	GCTCAG	2	12	751874	751885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020302	GGGGCG	2	12	796867	796878	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020302	CTTACG	2	12	811406	811417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020302	AGCGAA	2	12	856098	856109	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020302	CCGGGC	2	12	868580	868591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020302	CCGTGG	2	12	869774	869785	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020302	GACGGG	2	12	869789	869800	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020302	CGGCCC	2	12	874969	874980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020302	CTTGCA	2	12	882618	882629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020302	CGGGCG	2	12	891750	891761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020302	CGGAAG	2	12	914609	914620	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020302	TCCCGC	2	12	953485	953496	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020302	TCGACG	2	12	953519	953530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020302	CGCCAC	2	12	953703	953714	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020302	GACTGG	2	12	954011	954022	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020302	GCTTTG	2	12	979153	979164	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020302	TGAGGG	2	12	1002676	1002687	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020302	GGGGTA	2	12	1036339	1036350	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020302	TGCCCG	2	12	1037150	1037161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020302	TGCCCG	2	12	1042977	1042988	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020302	CGGTGA	2	12	1047421	1047432	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020302	TCCGCC	2	12	1070091	1070102	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020302	AGTTCA	2	12	1084329	1084340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020302	CCCGGG	2	12	1099598	1099609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020302	GGGGGA	2	12	1107691	1107702	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020302	ACGGCG	2	12	1108803	1108814	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020302	CGGTCC	2	12	1120073	1120084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020302	GGCGCA	2	12	1130552	1130563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020302	CCGGGA	2	12	1139350	1139361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020302	GCTTCA	2	12	1154602	1154613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020302	CGCCCC	2	12	1217969	1217980	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
81	NC_020302	CGGGGA	2	12	1230513	1230524	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020302	GCCGAC	2	12	1244820	1244831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020302	GACTTC	2	12	1245033	1245044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020302	TGCGAT	2	12	1331311	1331322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020302	GGAGGG	2	12	1363372	1363383	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020302	TAAAGT	2	12	1388106	1388117	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020302	GGAAAG	2	12	1388121	1388132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020302	TCCGGA	2	12	1413042	1413053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020302	CGACGG	2	12	1413760	1413771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020302	TTGTAG	2	12	1414133	1414144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020302	GTGGTC	2	12	1414343	1414354	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020302	GGGACG	2	12	1414598	1414609	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020302	GTTGAC	2	12	1424147	1424158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020302	CGCGCA	2	12	1426872	1426883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020302	GGGGCG	2	12	1431237	1431248	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020302	GCCCCG	2	12	1456793	1456804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020302	GACCTC	2	12	1478418	1478429	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020302	GCGTTT	2	12	1494601	1494612	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020302	AGCGAA	2	12	1497858	1497869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020302	CGAGAA	2	12	1500633	1500644	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020302	CGACGG	2	12	1559153	1559164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020302	TCCACG	2	12	1561013	1561024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020302	ATATGA	2	12	1573950	1573961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020302	GGGCGC	2	12	1586563	1586574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020302	CCCCGC	2	12	1589052	1589063	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_020302	GCTTCC	2	12	1593031	1593042	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020302	CGGGCC	2	12	1604397	1604408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020302	CTCCCC	2	12	1612484	1612495	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
109	NC_020302	CCCGCC	2	12	1622143	1622154	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
110	NC_020302	CCCGGC	2	12	1622166	1622177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020302	CTGGCG	2	12	1697148	1697159	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020302	GTACCT	2	12	1697482	1697493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020302	GCTCCC	2	12	1718549	1718560	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020302	CACGTC	2	12	1742766	1742777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020302	GGGCGT	2	12	1775137	1775148	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020302	CAGCCG	2	12	1819922	1819933	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020302	TCCGGG	2	12	1840894	1840905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020302	GCCACC	2	12	1876638	1876649	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_020302	GGCACC	2	12	1877328	1877339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020302	CCCGGC	2	12	1906229	1906240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_020302	GCCCCC	2	12	1928493	1928504	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
122	NC_020302	GGTTTC	2	12	1929427	1929438	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020302	ATTGCA	2	12	1938259	1938270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020302	TACTGG	2	12	1944950	1944961	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020302	CCCCGT	2	12	1953142	1953153	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_020302	GCGCCC	2	12	1953250	1953261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_020302	CCGGCC	2	12	1970289	1970300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_020302	ATCCTG	2	12	2001875	2001886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020302	CAGGTG	2	12	2043586	2043597	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020302	GGCCGT	2	12	2053484	2053495	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020302	GCCGGG	2	12	2074883	2074894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020302	CCGGGG	2	12	2076810	2076821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020302	TCCCCC	2	12	2102632	2102643	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
134	NC_020302	CAACGG	2	12	2107516	2107527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020302	GGGCCG	2	12	2107557	2107568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020302	CGGGAG	2	12	2110993	2111004	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_020302	CGGCCC	2	12	2120116	2120127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_020302	ACCCCA	2	12	2127208	2127219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020302	GCCCCC	2	12	2147670	2147681	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
140	NC_020302	CCCCGG	2	12	2166966	2166977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020302	CCTGCC	2	12	2168592	2168603	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_020302	CCTCCC	2	12	2178677	2178688	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
143	NC_020302	CCCGCG	2	12	2182650	2182661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_020302	GCGGGG	2	12	2188728	2188739	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_020302	CACCTC	2	12	2212252	2212263	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_020302	CCCCCG	2	12	2212373	2212384	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
147	NC_020302	CCCACC	2	12	2231030	2231041	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
148	NC_020302	ACGTCC	2	12	2231918	2231929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020302	GTCTTC	2	12	2244140	2244151	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_020302	GCCGGT	2	12	2268512	2268523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020302	GTTGAG	2	12	2295355	2295366	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020302	CGGGGC	2	12	2306490	2306501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_020302	TGGCGA	2	12	2343347	2343358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_020302	GCCGGC	2	12	2407030	2407041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_020302	GGCCCT	2	12	2510004	2510015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_020302	GCGGCT	2	12	2512779	2512790	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_020302	GGGGTG	2	12	2515493	2515504	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020302	GGGCCG	2	12	2517790	2517801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_020302	CCCGGC	2	12	2572400	2572411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_020302	TTCGCT	2	12	2586682	2586693	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_020302	CCGGTC	2	12	2597121	2597132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
162	NC_020302	CGCCAA	2	12	2622644	2622655	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
163	NC_020302	CCCACT	2	12	2641709	2641720	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_020302	GCCCCG	2	12	2699842	2699853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_020302	CCCCCG	2	12	2699893	2699904	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
166	NC_020302	GGACGG	2	12	2723561	2723572	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_020302	CGAGGC	4	24	2732205	2732228	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_020302	TCCCCC	2	12	2733024	2733035	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
169	NC_020302	GCCGCA	2	12	2733102	2733113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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171	NC_020302	GCGGGG	2	12	2753358	2753369	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_020302	CCGGTG	2	12	2795460	2795471	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_020302	CCCCCG	2	12	2813466	2813477	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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175	NC_020302	GCGGAG	2	12	2881427	2881438	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
176	NC_020302	CCCGTT	2	12	2913821	2913832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
177	NC_020302	CGGTCT	2	12	2949112	2949123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_020302	GTCACC	2	12	2956098	2956109	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
179	NC_020302	TTCGCT	2	12	2982939	2982950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_020302	ACCCCA	2	12	3084284	3084295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_020302	AACTGG	2	12	3107902	3107913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_020302	GGTTCC	2	12	3108186	3108197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_020302	CTGAGA	2	12	3132817	3132828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.