MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium oncopeltii TCC290E

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020299	ATTAT	2	10	16499	16508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020299	ATTGT	2	10	16627	16636	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020299	TTTAG	2	10	25047	25056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020299	TATAT	3	15	49270	49284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020299	TTATT	2	10	62015	62024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020299	ATATT	2	10	63929	63938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020299	ATATT	2	10	88338	88347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020299	TTTAT	2	10	90451	90460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020299	TTTAT	2	10	107491	107500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020299	GATTT	2	10	113419	113428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020299	AATTA	2	10	121134	121143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020299	GCGGA	2	10	122205	122214	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020299	CATGC	2	10	122427	122436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_020299	ATTTT	2	10	122506	122515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020299	TATTG	2	10	137676	137685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020299	ATTAA	2	10	152655	152664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020299	TTTAA	2	10	154411	154420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020299	AACAA	2	10	155399	155408	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020299	TTGTT	2	10	155441	155450	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020299	GTTTT	2	10	161062	161071	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020299	TATTT	2	10	167303	167312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020299	AAAAC	2	10	171630	171639	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020299	ATAAA	2	10	171702	171711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020299	TAGAA	2	10	172732	172741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020299	CAAAG	2	10	177899	177908	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020299	TAATA	2	10	177945	177954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020299	TCGTG	2	10	187484	187493	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020299	CTCAT	2	10	190977	190986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020299	CTTTA	2	10	195505	195514	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020299	TAAGA	2	10	202376	202385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020299	TCTTT	2	10	202534	202543	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020299	AACAA	2	10	213952	213961	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020299	AATAA	2	10	214630	214639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020299	TTATA	2	10	218242	218251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020299	AATCA	2	10	218371	218380	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020299	TCGTG	2	10	222809	222818	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020299	CTCAT	2	10	226302	226311	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020299	AGTCA	2	10	234405	234414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020299	ATTAT	2	10	238499	238508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020299	TTATC	2	10	250156	250165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020299	ATTAT	2	10	261439	261448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020299	CAGCT	2	10	268168	268177	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020299	GTATA	2	10	291639	291648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020299	AGTAT	2	10	293356	293365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020299	ATCAT	2	10	293711	293720	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020299	ATTTT	2	10	295074	295083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020299	ATTTT	2	10	295142	295151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020299	TTTTA	2	10	301019	301028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020299	AAAAT	2	10	302451	302460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020299	GTTAT	2	10	305127	305136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020299	TTTTA	2	10	305191	305200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020299	ATCTG	2	10	311519	311528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020299	AATAA	2	10	311658	311667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020299	TTTTA	2	10	312178	312187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020299	CTCAT	2	10	312337	312346	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020299	ATAAC	2	10	328067	328076	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020299	AGTAT	2	10	333695	333704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020299	ATTAT	2	10	336752	336761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020299	ATTTT	2	10	343112	343121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020299	TGACA	2	10	346661	346670	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020299	TAATA	2	10	347540	347549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020299	AATTT	2	10	358140	358149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020299	TATTT	2	10	362324	362333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020299	AAATT	2	10	389173	389182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020299	TTTTA	2	10	390674	390683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020299	ATTTT	2	10	396123	396132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020299	AAAAT	2	10	396809	396818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020299	ATTTA	2	10	397128	397137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020299	ATATT	2	10	405441	405450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020299	TATAA	2	10	406128	406137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020299	ATAGA	2	10	408368	408377	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020299	AATTA	2	10	410803	410812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020299	AATCT	2	10	412912	412921	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020299	TAATA	2	10	431919	431928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020299	TAAAT	2	10	439155	439164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020299	ATTAA	2	10	470067	470076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020299	TAATA	2	10	470108	470117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020299	TTAAA	2	10	470410	470419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020299	TATAA	2	10	471582	471591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020299	TTTAT	2	10	486721	486730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020299	TTTCT	2	10	510560	510569	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020299	CAAAT	2	10	526289	526298	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020299	TATAT	2	10	554298	554307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020299	TAAAA	2	10	557247	557256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020299	GAATT	2	10	557304	557313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020299	AAATC	2	10	560876	560885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020299	TAAAC	2	10	561756	561765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020299	CTAAA	2	10	563545	563554	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020299	TATAA	2	10	570772	570781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020299	TACAA	2	10	581503	581512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020299	TGTAT	2	10	581538	581547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020299	AAAAT	2	10	582946	582955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020299	TACTA	2	10	617236	617245	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020299	TCCTG	2	10	634277	634286	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_020299	ATTTA	2	10	637323	637332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020299	GATGA	2	10	638656	638665	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020299	CACGA	2	10	642150	642159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_020299	AAATT	2	10	645827	645836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020299	ACATT	2	10	647612	647621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020299	AATTT	2	10	665687	665696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020299	AATTT	2	10	674474	674483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020299	TAAAT	2	10	683648	683657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020299	TAAAA	2	10	689704	689713	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020299	AAATA	2	10	689848	689857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020299	ATAAC	2	10	701426	701435	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020299	ACATA	2	10	702221	702230	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020299	ATTAT	2	10	702344	702353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020299	TAATT	2	10	702608	702617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020299	AAATT	2	10	706459	706468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020299	AACCC	2	10	711592	711601	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_020299	ATTTA	2	10	716806	716815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020299	ATTTT	2	10	716859	716868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020299	AATTA	2	10	717013	717022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020299	AATAA	2	10	718156	718165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020299	TACAT	2	10	738712	738721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020299	TTTAT	2	10	741023	741032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020299	ATATT	2	10	750571	750580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020299	TAAAT	2	10	759620	759629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020299	AATAT	2	10	759765	759774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020299	TTAAT	2	10	779431	779440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020299	TAAGA	2	10	779532	779541	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020299	TAAAT	2	10	803219	803228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020299	TATGT	2	10	810085	810094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.