MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020294	TTATAC	2	12	58403	58414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020294	TTAAAT	2	12	74765	74776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020294	TTGTTA	2	12	96482	96493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020294	ATTTAA	2	12	100757	100768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020294	TTTCCT	2	12	130444	130455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020294	TAATGT	2	12	161193	161204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020294	TCGGGG	2	12	170379	170390	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020294	TTGTTT	2	12	181836	181847	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020294	TGTTTG	2	12	200918	200929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020294	TATGAA	2	12	208803	208814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020294	TTAATT	2	12	226499	226510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020294	TAATTA	2	12	298218	298229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020294	TATTTG	2	12	321008	321019	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020294	TGTATA	2	12	325454	325465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020294	ATTTTT	2	12	327073	327084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020294	ATTTTT	2	12	357041	357052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020294	CACTAT	2	12	360811	360822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020294	TATTTA	2	12	367174	367185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020294	TTTTAT	3	18	375399	375416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020294	TAAAAA	2	12	400252	400263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020294	TCATAT	2	12	414527	414538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020294	ATATTT	2	12	444066	444077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020294	ATATAA	2	12	474668	474679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020294	TTTTTA	2	12	486800	486811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020294	ATTTAT	2	12	488360	488371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020294	CAGAAT	2	12	579379	579390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020294	TTTAAT	2	12	607035	607046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020294	TATAAA	2	12	663314	663325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020294	AACAAA	2	12	675214	675225	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020294	TAAAAT	2	12	676467	676478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020294	TTGCAT	2	12	735581	735592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020294	AATATA	2	12	741697	741708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020294	AAACAG	2	12	768850	768861	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020294	CAAAAA	2	12	812218	812229	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.