MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020294	TTAAT	2	10	32721	32730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020294	AAAGT	2	10	32785	32794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020294	ATTTT	2	10	38795	38804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020294	TAATT	2	10	40824	40833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020294	TGGTT	2	10	63789	63798	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020294	TAATA	2	10	66564	66573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020294	TTTAT	2	10	72825	72834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020294	ATTAA	2	10	82986	82995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020294	TTAAG	2	10	89934	89943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020294	TGTTT	2	10	105759	105768	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020294	TCTTA	2	10	120743	120752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020294	TAAAT	2	10	120836	120845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020294	GCGGA	2	10	121878	121887	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020294	CATGC	2	10	122091	122100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_020294	GAATT	2	10	131709	131718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020294	ATTAA	2	10	138752	138761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020294	AATTA	2	10	138824	138833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020294	TTTTA	2	10	142785	142794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020294	ATTAG	2	10	154994	155003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020294	TTTTA	2	10	167580	167589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020294	TAGAT	2	10	170488	170497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020294	TTATT	2	10	171672	171681	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020294	ATTTT	2	10	181462	181471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020294	AACAT	2	10	183971	183980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020294	TTAAT	2	10	188923	188932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020294	TCGTG	2	10	191507	191516	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020294	GGGAG	2	10	193005	193014	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020294	CTCAT	2	10	195004	195013	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020294	TTTAT	2	10	195504	195513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020294	ATTGT	2	10	201014	201023	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020294	ATTAA	2	10	205862	205871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020294	TAAAA	2	10	208678	208687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020294	TAAAT	2	10	208714	208723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020294	TTAAT	2	10	215791	215800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020294	CTAAA	2	10	218368	218377	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020294	ATTAA	2	10	218919	218928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020294	AACAA	2	10	222822	222831	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020294	TCGTG	2	10	231455	231464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020294	GGGAG	2	10	232953	232962	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020294	CTCAT	2	10	234952	234961	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_020294	TTTAT	2	10	235452	235461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020294	TGTTT	2	10	240656	240665	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020294	AAGTG	2	10	257338	257347	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020294	TATTT	2	10	260368	260377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020294	ATATA	2	10	278888	278897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020294	TTTAA	2	10	279680	279689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020294	TAGTC	2	10	279826	279835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020294	TAATA	2	10	289720	289729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020294	TGTTT	2	10	296537	296546	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020294	ATTTA	2	10	312298	312307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020294	TATAT	2	10	324271	324280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020294	ATATT	2	10	325390	325399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020294	TTTTA	2	10	329284	329293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020294	AAAGA	2	10	348778	348787	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020294	TTTGT	2	10	360649	360658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020294	TATAG	2	10	367001	367010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020294	ATGAT	2	10	390735	390744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020294	TTTTA	2	10	390921	390930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020294	TTTTA	2	10	399799	399808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020294	AATAA	2	10	409188	409197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020294	ATTGG	2	10	418114	418123	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020294	AGAAA	2	10	422569	422578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020294	ATATA	2	10	423020	423029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020294	AAAAG	2	10	425587	425596	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020294	TGTAT	2	10	427808	427817	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020294	TAAAT	2	10	440959	440968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020294	AATAT	2	10	451202	451211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020294	ATTAT	2	10	467259	467268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020294	TAAAA	2	10	468078	468087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020294	TTATT	2	10	486133	486142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020294	TATGA	2	10	487005	487014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020294	TATAA	2	10	488388	488397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020294	TAAAA	2	10	518027	518036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020294	TAAAA	2	10	528111	528120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020294	TACGT	2	10	530953	530962	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020294	TTTTA	2	10	534018	534027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020294	TATAA	2	10	536347	536356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020294	AATAA	2	10	544979	544988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020294	ATATA	2	10	549723	549732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020294	AGTAA	2	10	569386	569395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020294	TAGTA	2	10	572358	572367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020294	ATTAA	2	10	577037	577046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020294	TTCAA	2	10	579332	579341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020294	CGAAA	2	10	579511	579520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020294	ATATA	2	10	595726	595735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020294	GAATT	2	10	614048	614057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020294	AAATA	2	10	616987	616996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020294	TGTAT	2	10	617003	617012	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020294	TAAAA	2	10	617056	617065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020294	TTAAG	2	10	623759	623768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020294	ATTTA	2	10	625002	625011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020294	ATTTT	2	10	625019	625028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020294	ATTAT	2	10	637287	637296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020294	AATAT	2	10	657678	657687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020294	ATAAA	2	10	657895	657904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020294	GATGA	2	10	658395	658404	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020294	CTCCC	2	10	660395	660404	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_020294	CACGA	2	10	661893	661902	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_020294	TTTTC	2	10	663257	663266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020294	TCAAA	2	10	668027	668036	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020294	CACCC	2	10	688561	688570	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
102	NC_020294	TATAT	2	10	692328	692337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020294	TATAA	2	10	695489	695498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020294	AAAAT	2	10	697104	697113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020294	AAGAA	2	10	701292	701301	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020294	AATTA	2	10	704514	704523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020294	AAATT	2	10	706788	706797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020294	TAATT	2	10	712465	712474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020294	AATTA	2	10	713740	713749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020294	TATAT	2	10	723352	723361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020294	TAAAT	2	10	727341	727350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020294	TTAAG	2	10	735450	735459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020294	AGTTT	2	10	735850	735859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020294	AATAC	2	10	737964	737973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_020294	TTTTA	2	10	745500	745509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020294	TATTG	2	10	751152	751161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020294	TTTCA	2	10	757883	757892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020294	TAATC	2	10	763977	763986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020294	AAATG	2	10	775218	775227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020294	TGAAT	2	10	778133	778142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020294	AATTG	2	10	781468	781477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020294	ACAAA	2	10	802329	802338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020294	TAAAA	2	10	807295	807304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020294	TTAAT	2	10	811650	811659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020294	ACAAA	2	10	823038	823047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020294	TAAAA	2	10	828649	828658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.