MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E

Total Repeats: 407

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020294	ATGT	2	8	2551	2558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020294	GATT	2	8	2586	2593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020294	ATTT	2	8	8687	8694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020294	TGTA	2	8	8701	8708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020294	ATGT	2	8	16623	16630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020294	AATT	2	8	18970	18977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020294	TAAG	2	8	18980	18987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020294	CAAG	2	8	25484	25491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020294	TTAT	2	8	32801	32808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020294	TTGT	2	8	32834	32841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020294	TTTA	2	8	37329	37336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020294	ATTT	2	8	37345	37352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020294	TTTA	2	8	38770	38777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020294	TTAA	2	8	46549	46556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020294	TAAA	2	8	50153	50160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020294	ATAA	2	8	61645	61652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020294	ATTT	2	8	63384	63391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020294	ATTA	2	8	63564	63571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020294	ATTA	2	8	66501	66508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020294	ATTA	2	8	71511	71518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020294	TTAG	2	8	75130	75137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020294	ATTT	2	8	75873	75880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020294	AATT	2	8	75900	75907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020294	GTTT	2	8	75930	75937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020294	TAAA	2	8	78855	78862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020294	TTAA	2	8	78864	78871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020294	AATA	2	8	78924	78931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020294	TTAT	2	8	79713	79720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020294	ATTT	2	8	79740	79747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020294	ATAA	2	8	81628	81635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020294	AAAT	2	8	96429	96436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020294	ATTT	2	8	97129	97136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020294	TTAG	2	8	100724	100731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020294	TAAA	2	8	100780	100787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020294	TAAT	2	8	100789	100796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020294	TTTA	2	8	101011	101018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020294	TAAA	2	8	104776	104783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020294	TGTT	2	8	104798	104805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020294	ATGA	2	8	105427	105434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020294	TATT	2	8	107095	107102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020294	CTTA	2	8	110790	110797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020294	AATT	2	8	112554	112561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020294	TCAC	2	8	113111	113118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020294	AATT	2	8	113177	113184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020294	TTGT	2	8	113199	113206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020294	TTTA	2	8	117809	117816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020294	ATTA	2	8	120627	120634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020294	TTAT	2	8	120640	120647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020294	TAAT	2	8	120785	120792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020294	TTTG	2	8	120804	120811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020294	ATTA	2	8	120856	120863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020294	TCCT	2	8	121950	121957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020294	TTAT	2	8	126984	126991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020294	TATT	2	8	129269	129276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020294	ATTT	2	8	130466	130473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020294	ATTA	2	8	131690	131697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020294	TTAG	2	8	131796	131803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020294	GATT	2	8	132606	132613	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020294	AATT	2	8	132678	132685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020294	TAAT	2	8	132777	132784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020294	TATT	2	8	138857	138864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020294	ATTT	2	8	141007	141014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020294	ATTA	2	8	144770	144777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020294	GATA	2	8	144801	144808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020294	AATC	2	8	144890	144897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020294	TATT	2	8	151030	151037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020294	ATTT	2	8	151232	151239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020294	TTAA	2	8	152937	152944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020294	TTGT	2	8	160202	160209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020294	TGTC	2	8	165429	165436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020294	TTTG	2	8	170175	170182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020294	ATTA	2	8	170191	170198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020294	ATAA	2	8	170208	170215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020294	TATT	2	8	170221	170228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020294	AATT	2	8	170238	170245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020294	GTTG	2	8	170426	170433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020294	CATA	2	8	170464	170471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020294	TAAA	2	8	170696	170703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020294	TAGT	2	8	171691	171698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020294	TTTA	2	8	176707	176714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020294	ATCA	2	8	181476	181483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020294	TTAT	2	8	181577	181584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020294	TAAT	2	8	181647	181654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020294	ATAC	2	8	188287	188294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020294	TTAG	2	8	188904	188911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020294	TTGT	2	8	190236	190243	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020294	GAAA	2	8	191029	191036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020294	TACC	2	8	191417	191424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020294	GCGA	2	8	192763	192770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020294	CAAA	2	8	193303	193310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020294	AAAG	2	8	193598	193605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020294	TACG	2	8	195218	195225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020294	TTGA	2	8	200037	200044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020294	GTTT	2	8	201041	201048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020294	ATTT	2	8	201976	201983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020294	AAAG	2	8	202599	202606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020294	ATTT	2	8	202608	202615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020294	GTTT	2	8	206493	206500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020294	TTAA	2	8	206516	206523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020294	TTAA	2	8	208765	208772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020294	TGAT	2	8	212127	212134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020294	AGTA	2	8	212156	212163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020294	TATT	2	8	217226	217233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020294	TAAT	2	8	218894	218901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020294	TTTG	2	8	222796	222803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020294	TACT	2	8	222850	222857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020294	ATTT	2	8	222874	222881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020294	TGTT	2	8	226469	226476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020294	TAAT	2	8	226746	226753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020294	ATCA	2	8	230065	230072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020294	TTGT	2	8	230184	230191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020294	GAAA	2	8	230977	230984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020294	TACC	2	8	231365	231372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020294	GCGA	2	8	232711	232718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020294	CAAA	2	8	233251	233258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020294	AAAG	2	8	233546	233553	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020294	TACG	2	8	235166	235173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020294	ATTG	2	8	238028	238035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020294	TCAA	2	8	240163	240170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020294	ATTT	2	8	240576	240583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020294	TGTT	2	8	243657	243664	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020294	CTAT	2	8	243820	243827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020294	TCAA	2	8	251757	251764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020294	TTGT	2	8	257316	257323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020294	ATTT	2	8	259376	259383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020294	TTTG	2	8	260090	260097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020294	CTTA	2	8	262946	262953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020294	TTTG	2	8	262987	262994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020294	GTTT	2	8	264812	264819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020294	AACT	2	8	271165	271172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020294	TTTA	2	8	277651	277658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020294	TTTG	2	8	278999	279006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020294	ATTT	2	8	279031	279038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020294	TATT	2	8	279053	279060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020294	TGAT	2	8	279091	279098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020294	TTGG	2	8	279395	279402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020294	GTTT	3	12	281879	281890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020294	TAAA	2	8	281894	281901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020294	TATC	2	8	283307	283314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020294	ATGT	2	8	290268	290275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020294	ATAA	2	8	291499	291506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020294	ATTT	2	8	296553	296560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020294	TAAT	2	8	298290	298297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020294	TAAA	2	8	299422	299429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020294	TGAT	2	8	299433	299440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020294	TTAT	2	8	300941	300948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020294	ATTT	2	8	300973	300980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020294	ATTT	2	8	302764	302771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020294	TTTA	2	8	305186	305193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020294	AAGA	2	8	317890	317897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020294	TAGT	2	8	319704	319711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020294	AAAC	2	8	320534	320541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.