MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 4638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	TAAT	2	8	4496	4503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020291	TAAA	2	8	9096	9103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020291	ACAA	2	8	9317	9324	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020291	AAGA	2	8	9345	9352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020291	GTGA	2	8	9839	9846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020291	TACT	2	8	11018	11025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020291	AGAA	2	8	11502	11509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020291	GCGA	2	8	11531	11538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020291	GCTA	2	8	12769	12776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020291	CTGA	2	8	14160	14167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020291	AAGT	2	8	17131	17138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020291	ATTG	2	8	17396	17403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020291	GCGT	2	8	17474	17481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020291	GATA	2	8	17598	17605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020291	TAAT	2	8	17621	17628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020291	ATTA	2	8	17689	17696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020291	GCGT	2	8	17796	17803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020291	TAAT	2	8	18018	18025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020291	ATGT	2	8	27325	27332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020291	GTTA	2	8	29044	29051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020291	ACGG	2	8	29072	29079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020291	AATA	2	8	29339	29346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020291	TTAC	2	8	29375	29382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020291	ATAA	2	8	29544	29551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020291	TAAA	2	8	31396	31403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020291	ATTT	2	8	31414	31421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020291	AAAT	2	8	31764	31771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020291	AGCA	2	8	31868	31875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020291	ATGT	2	8	32246	32253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020291	AGCA	2	8	32379	32386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020291	CATA	2	8	34028	34035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020291	TAAT	2	8	34065	34072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020291	AAGG	2	8	34826	34833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020291	TAAT	2	8	36542	36549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020291	GATA	2	8	37308	37315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020291	GGGA	2	8	37373	37380	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020291	AAAT	2	8	38159	38166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020291	AAAT	2	8	40267	40274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020291	TAAA	2	8	40422	40429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020291	TGAG	2	8	40593	40600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020291	AAAT	2	8	41097	41104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020291	TTAT	2	8	41226	41233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020291	AATA	2	8	41314	41321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020291	TAAA	2	8	41563	41570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020291	TCTT	2	8	46200	46207	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020291	TAAT	2	8	46449	46456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020291	ATAA	2	8	48225	48232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020291	ATAA	2	8	48253	48260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020291	ATTT	2	8	48271	48278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020291	TTAT	2	8	55321	55328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020291	AATT	2	8	55408	55415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020291	TAAT	2	8	58369	58376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020291	TAAA	2	8	58396	58403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020291	TTAA	2	8	59181	59188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020291	ATTA	2	8	59214	59221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020291	TTTA	2	8	60979	60986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020291	AAGG	2	8	61492	61499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020291	TAAG	2	8	64704	64711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020291	TAAA	2	8	64769	64776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020291	ATTA	2	8	67883	67890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020291	TATT	2	8	68294	68301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020291	AAGG	2	8	70961	70968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020291	ACTT	2	8	75482	75489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020291	AAAG	2	8	75728	75735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020291	AATA	2	8	79474	79481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020291	TATG	2	8	81961	81968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020291	ATAA	2	8	81969	81976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020291	TTAT	2	8	82050	82057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020291	ATAA	2	8	84853	84860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020291	GATT	2	8	84867	84874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020291	AATC	2	8	84888	84895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020291	AAAT	2	8	85629	85636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020291	TTTA	2	8	92374	92381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020291	AATT	2	8	92387	92394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020291	GTAA	2	8	92694	92701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020291	TAAT	2	8	92817	92824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020291	ATTT	2	8	99228	99235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020291	TAAA	2	8	99305	99312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020291	TAAT	2	8	100557	100564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020291	AAAG	2	8	100665	100672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020291	CAAA	2	8	101172	101179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020291	AATT	2	8	101375	101382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020291	TAAA	2	8	101667	101674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020291	TAAT	2	8	101686	101693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020291	TAAG	2	8	101700	101707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020291	ATAA	2	8	101755	101762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020291	TATT	2	8	103960	103967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020291	TAAT	2	8	104103	104110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020291	AGAT	2	8	106936	106943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020291	AATA	2	8	107030	107037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020291	ATTT	2	8	107060	107067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020291	ACTA	2	8	107072	107079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020291	TAGT	2	8	107095	107102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020291	AAAT	2	8	108586	108593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020291	AATG	2	8	108681	108688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020291	AAAT	2	8	110868	110875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020291	TAAT	2	8	111994	112001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020291	TAAT	2	8	112613	112620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020291	TAAA	2	8	115235	115242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020291	AAAG	2	8	122793	122800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020291	TAAT	2	8	122828	122835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020291	AAAG	2	8	126711	126718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020291	AATA	2	8	129197	129204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020291	TAAT	2	8	129281	129288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020291	AATA	2	8	130126	130133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020291	ATTA	2	8	137094	137101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020291	TAAT	2	8	138870	138877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020291	TAAA	2	8	138899	138906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020291	TATT	2	8	140900	140907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020291	AATT	2	8	144351	144358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020291	AATT	2	8	144366	144373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020291	TTAA	2	8	146121	146128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020291	ATTT	2	8	147586	147593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020291	TTAA	2	8	148901	148908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020291	GTGA	2	8	149573	149580	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020291	TACT	2	8	150753	150760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020291	AGAA	2	8	151284	151291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020291	GCGA	2	8	151313	151320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020291	GCTA	2	8	152551	152558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020291	CTGA	2	8	153942	153949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020291	ACAA	2	8	155656	155663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020291	ATTA	2	8	155766	155773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020291	TTAA	2	8	165025	165032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020291	ATTT	2	8	165038	165045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020291	TAAT	2	8	167920	167927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020291	AAAG	2	8	173276	173283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020291	AAAT	2	8	177425	177432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020291	TTAA	2	8	178472	178479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020291	GTAT	2	8	188606	188613	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020291	ATAA	2	8	188666	188673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020291	TTAA	2	8	189076	189083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020291	CAAT	2	8	193266	193273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020291	AATA	2	8	193341	193348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020291	ATAA	2	8	200715	200722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020291	GAGT	2	8	201323	201330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020291	AAAT	2	8	206369	206376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020291	TAAT	2	8	206428	206435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020291	AAAT	2	8	206439	206446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020291	TAAT	2	8	209526	209533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020291	TTAA	2	8	209545	209552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020291	TGTT	2	8	212929	212936	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020291	AGGG	2	8	213023	213030	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020291	AAGA	2	8	213982	213989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020291	AAAT	2	8	214027	214034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020291	GAAT	2	8	219660	219667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020291	CTTG	2	8	221972	221979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020291	ATTA	2	8	223237	223244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020291	AAAG	2	8	227042	227049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020291	TATT	2	8	227063	227070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020291	ATTT	2	8	229375	229382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020291	GATT	2	8	229537	229544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020291	AAAT	2	8	238695	238702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020291	TTTA	2	8	238789	238796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_020291	TGAG	2	8	731716	731723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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