MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020285	GTAA	2	8	8352	8359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020285	TAAA	2	8	8413	8420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020285	TTAT	2	8	8503	8510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020285	TAAT	2	8	14137	14144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020285	AAAC	2	8	16624	16631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020285	TTAA	2	8	21339	21346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020285	TATG	2	8	25096	25103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020285	TAAC	2	8	32313	32320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020285	ATTA	2	8	32400	32407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020285	TTCA	2	8	38459	38466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020285	TAAT	2	8	38591	38598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020285	TTTA	2	8	38738	38745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020285	TTGA	2	8	44720	44727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020285	TTAG	2	8	45591	45598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020285	TGAG	2	8	46421	46428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020285	GATA	2	8	46968	46975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020285	GATA	3	12	47116	47127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020285	ATTT	2	8	47423	47430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020285	TGAT	2	8	47452	47459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020285	ATTA	2	8	49146	49153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020285	TGTA	2	8	49168	49175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020285	TAAA	2	8	49249	49256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020285	ATTT	3	12	49767	49778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020285	TAAT	2	8	49812	49819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020285	ATGA	2	8	49950	49957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020285	ATTT	2	8	50639	50646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020285	TAGT	2	8	50724	50731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020285	ATTT	2	8	50739	50746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020285	TTTA	2	8	52220	52227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020285	TCTT	2	8	59319	59326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020285	TATT	2	8	62424	62431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020285	CCAT	2	8	62504	62511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020285	TTAA	2	8	68321	68328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020285	TGCT	2	8	68375	68382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020285	TTTA	2	8	68419	68426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020285	TAAT	2	8	72101	72108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020285	AAAT	2	8	75611	75618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020285	TTAA	2	8	80129	80136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020285	TTAG	2	8	80191	80198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020285	ATAA	2	8	80228	80235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020285	TTTA	2	8	82982	82989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020285	ATAA	2	8	84215	84222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020285	AATT	2	8	90940	90947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020285	ATTA	2	8	101811	101818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020285	GTTT	2	8	102647	102654	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020285	TCAT	2	8	102715	102722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020285	TATT	2	8	102779	102786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020285	TAAA	2	8	105155	105162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020285	TCCT	2	8	106791	106798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020285	AAAT	2	8	113251	113258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020285	ATTA	2	8	113590	113597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020285	TATG	2	8	113637	113644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020285	ATTA	2	8	113744	113751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020285	ATTA	2	8	122833	122840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020285	TATT	2	8	123817	123824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020285	TAAT	2	8	126684	126691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020285	TTTA	2	8	132246	132253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020285	AGTT	2	8	133837	133844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020285	ATTA	2	8	134634	134641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020285	TGTA	2	8	137827	137834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020285	TTAT	2	8	140604	140611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020285	TTAA	2	8	140663	140670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020285	ATTT	2	8	140711	140718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020285	TATT	2	8	144606	144613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020285	CAAA	2	8	146683	146690	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020285	TAAT	2	8	152717	152724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020285	TTTC	2	8	152868	152875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020285	TATT	2	8	154664	154671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020285	ATTT	2	8	155000	155007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020285	ATAA	2	8	156664	156671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020285	TTGT	2	8	167172	167179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020285	AATT	2	8	169461	169468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020285	ATTA	2	8	173460	173467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020285	ATAA	2	8	179874	179881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020285	TTTA	2	8	185767	185774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020285	TTTA	2	8	186902	186909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020285	ATTA	2	8	188134	188141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020285	ACAA	2	8	188230	188237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020285	ATGA	2	8	188923	188930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020285	TACC	2	8	189429	189436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020285	CATA	2	8	190318	190325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020285	TATT	2	8	190409	190416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020285	ACTG	2	8	190673	190680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020285	GCGA	2	8	190770	190777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020285	AAAG	2	8	191605	191612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020285	TGTT	2	8	193499	193506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020285	TAAA	2	8	194780	194787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020285	TATT	2	8	194817	194824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020285	TAAT	2	8	197968	197975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020285	CTTA	2	8	198213	198220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020285	CTAG	2	8	198260	198267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020285	TTAT	2	8	198343	198350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020285	TTAT	2	8	198487	198494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020285	TATT	2	8	198561	198568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020285	TTAT	2	8	204672	204679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020285	ATTT	2	8	204696	204703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020285	ATGC	2	8	205899	205906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020285	TTTA	2	8	209421	209428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020285	ATTT	2	8	209451	209458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020285	TTTA	2	8	209528	209535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020285	TATT	2	8	212272	212279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020285	TTAA	2	8	212397	212404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020285	TCTA	2	8	212566	212573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020285	ATTT	2	8	216510	216517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020285	ATTT	2	8	220402	220409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020285	ATTA	2	8	223837	223844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020285	ACAA	2	8	223933	223940	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020285	ATGA	2	8	224626	224633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020285	TACC	2	8	225132	225139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020285	CATA	2	8	226021	226028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020285	TATT	2	8	226112	226119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020285	ACTG	2	8	226376	226383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020285	GCGA	2	8	226473	226480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020285	AAAG	2	8	227308	227315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020285	TGTT	2	8	229202	229209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020285	AGTT	2	8	229447	229454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020285	TATC	2	8	233514	233521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020285	TTTG	2	8	233680	233687	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020285	TTTA	2	8	233692	233699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020285	TGAT	2	8	235042	235049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020285	ATTG	2	8	236786	236793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020285	ATTT	2	8	238986	238993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020285	AGAT	2	8	240949	240956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020285	TTAT	2	8	244032	244039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020285	TAAT	2	8	251691	251698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020285	GTAT	2	8	252663	252670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020285	ATTT	2	8	252672	252679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020285	ATTT	2	8	252694	252701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020285	AATT	2	8	263452	263459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020285	TATT	2	8	263621	263628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020285	TTTA	2	8	263716	263723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020285	CATA	2	8	263862	263869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020285	AAAT	2	8	270600	270607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020285	TTCT	2	8	270614	270621	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020285	TATT	2	8	271331	271338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020285	TTTA	2	8	274625	274632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020285	AGAA	2	8	281081	281088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020285	AATT	2	8	283622	283629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020285	AATA	2	8	288059	288066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020285	CTAA	2	8	288522	288529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020285	AACA	2	8	288770	288777	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020285	ATTT	2	8	288896	288903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020285	TTAA	2	8	289457	289464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020285	CTTA	2	8	291719	291726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020285	TTTG	2	8	292237	292244	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020285	TAAA	2	8	296354	296361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020285	ATTT	2	8	301472	301479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020285	AGTA	2	8	302622	302629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020285	ATAA	2	8	305120	305127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020285	AATT	2	8	315283	315290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020285	TTTG	2	8	317643	317650	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020285	AATA	2	8	317693	317700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.