MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium galatii TCC219

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020284	ATTTA	2	10	8364	8373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020284	TAAAT	2	10	17722	17731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020284	TATTT	2	10	33453	33462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020284	TAATT	2	10	36837	36846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020284	AAAGT	2	10	52512	52521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020284	TAAGT	2	10	64126	64135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020284	TATTT	2	10	68981	68990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020284	TAAAT	2	10	80977	80986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020284	TCTTA	2	10	97449	97458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020284	AATTA	2	10	104931	104940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020284	CATTT	2	10	108354	108363	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020284	TGGTT	2	10	121218	121227	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020284	GCGGA	2	10	122388	122397	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020284	CATGC	2	10	122597	122606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_020284	TTTAT	2	10	122677	122686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020284	TTTTA	2	10	122720	122729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020284	AAACA	2	10	122795	122804	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020284	TATTG	2	10	137837	137846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020284	TTAAT	2	10	146617	146626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020284	TATTT	2	10	154591	154600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020284	AACAA	2	10	155564	155573	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020284	GTTTT	2	10	161245	161254	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020284	TCTTT	2	10	170803	170812	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020284	ATTTT	2	10	186965	186974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020284	TCGTG	2	10	189595	189604	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020284	CTCAT	2	10	193095	193104	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020284	ATTTT	2	10	193522	193531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020284	ATGTA	2	10	198671	198680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020284	ATTAA	2	10	204558	204567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020284	TAAAT	2	10	212805	212814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020284	TCGTG	2	10	225537	225546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020284	CTCAT	2	10	229037	229046	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_020284	ATTTT	2	10	229464	229473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020284	ATTTT	2	10	232758	232767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020284	GTCAG	2	10	237171	237180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020284	TAATT	2	10	246574	246583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020284	TTATC	2	10	252829	252838	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020284	TATAT	2	10	263826	263835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020284	TAATA	2	10	271521	271530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020284	AATAA	2	10	289611	289620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020284	TTAAT	2	10	305395	305404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020284	GTTAT	2	10	308078	308087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020284	TTTAA	2	10	310986	310995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020284	TTTAA	2	10	312756	312765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020284	AATTA	2	10	315679	315688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020284	TTAAG	2	10	323189	323198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020284	AATTA	2	10	325301	325310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020284	TTAAG	2	10	325319	325328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020284	TAAAT	2	10	325415	325424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020284	GTTTT	2	10	325502	325511	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020284	AGTTT	2	10	336942	336951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020284	TTTTA	2	10	344077	344086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020284	AATAA	2	10	348406	348415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020284	ATTTT	2	10	350665	350674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020284	TTTTA	2	10	359334	359343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020284	ATATT	2	10	364954	364963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020284	TTGTG	2	10	368017	368026	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020284	TATAT	2	10	390329	390338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020284	TTATT	2	10	391945	391954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020284	TATAT	2	10	393258	393267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020284	ATTAA	2	10	394426	394435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020284	TATAA	2	10	411826	411835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020284	ATAGA	2	10	414108	414117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020284	GATTT	2	10	438747	438756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020284	TTATG	2	10	439170	439179	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020284	ACTAT	2	10	452811	452820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020284	CTTCT	2	10	454330	454339	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_020284	TTTAT	2	10	465844	465853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020284	TAATA	2	10	475844	475853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020284	GTATT	2	10	485273	485282	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020284	TAATA	2	10	493404	493413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020284	TTTAT	2	10	493441	493450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020284	TTTCT	2	10	517305	517314	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020284	AAATC	2	10	527065	527074	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020284	CAAAT	2	10	533074	533083	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020284	GAAAC	2	10	533207	533216	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020284	ATATT	2	10	537545	537554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020284	TAAAA	2	10	537557	537566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020284	ATATA	2	10	548788	548797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020284	ATAAA	2	10	557023	557032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020284	AAATA	2	10	560926	560935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020284	AATAA	2	10	561002	561011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020284	TAATA	2	10	563522	563531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020284	ATTTC	2	10	576603	576612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020284	ATATA	2	10	589177	589186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020284	CAAAT	2	10	593616	593625	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020284	AACAA	2	10	604961	604970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020284	ATTTA	2	10	631530	631539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020284	TAAAC	2	10	641758	641767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020284	AAAAC	2	10	641840	641849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020284	AAGAA	2	10	643925	643934	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020284	TAAAA	2	10	645855	645864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020284	GATGA	2	10	646282	646291	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020284	CACGA	2	10	649783	649792	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_020284	ATTCT	2	10	652922	652931	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020284	AAATT	2	10	653480	653489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020284	TAAAA	2	10	671682	671691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020284	AATTT	2	10	682047	682056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020284	AAATT	2	10	697381	697390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020284	AAATA	2	10	697613	697622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020284	AATTA	2	10	700079	700088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020284	ATTTA	2	10	700308	700317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020284	TATAA	2	10	706151	706160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020284	TTAAA	2	10	706176	706185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020284	AATTA	2	10	710479	710488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020284	TATAT	2	10	713471	713480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020284	TAAAC	2	10	722534	722543	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020284	ATAGT	2	10	731040	731049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020284	ACAAA	2	10	743439	743448	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020284	AGTAA	2	10	743458	743467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020284	ATTGA	2	10	744337	744346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020284	AATTT	2	10	745996	746005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020284	AAACT	2	10	753734	753743	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020284	TAAAT	2	10	755686	755695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020284	TTATA	2	10	761962	761971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020284	ATAAA	2	10	774632	774641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020284	TCAAT	2	10	791414	791423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020284	TAAGA	2	10	791512	791521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020284	TAAAT	2	10	810986	810995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020284	AATTT	2	10	815152	815161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020284	TATGT	2	10	822054	822063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.