MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E

Total Repeats: 2571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020283	TCA	2	6	785527	785532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_020283	TAA	2	6	785537	785542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020283	TAA	2	6	785545	785550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020283	A	7	7	785549	785555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020283	AAT	2	6	785596	785601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020283	ACT	2	6	785606	785611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_020283	TAA	2	6	785622	785627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020283	T	6	6	785931	785936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_020283	TAAAA	2	10	785940	785949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020283	TCA	2	6	785960	785965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_020283	A	7	7	791554	791560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_020283	ACC	2	6	791585	791590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_020283	T	6	6	796401	796406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_020283	A	6	6	796410	796415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_020283	TAA	2	6	796442	796447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_020283	A	6	6	796821	796826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020283	A	6	6	796853	796858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_020283	T	6	6	798067	798072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_020283	A	6	6	798074	798079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020283	AAT	2	6	798104	798109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020283	TAA	2	6	800781	800786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020283	A	7	7	800845	800851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_020283	TA	3	6	801247	801252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020283	TAA	3	9	801257	801265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020283	A	7	7	801299	801305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020283	AT	3	6	801327	801332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020283	CAT	2	6	801337	801342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_020283	AAT	2	6	801390	801395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_020283	ACA	2	6	801411	801416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_020283	ACA	2	6	809833	809838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_020283	TAA	2	6	810303	810308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020283	A	6	6	810317	810322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_020283	A	7	7	810862	810868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_020283	AAAAC	2	10	811055	811064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2535	NC_020283	AAC	2	6	813304	813309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_020283	AT	4	8	813314	813321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_020283	TAC	2	6	813322	813327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_020283	A	6	6	813329	813334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_020283	AAAAT	2	10	814573	814582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020283	TGG	2	6	814758	814763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020283	AGG	2	6	814764	814769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_020283	TAT	2	6	814854	814859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020283	AC	3	6	814865	814870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_020283	TTA	2	6	814871	814876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020283	A	7	7	814887	814893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_020283	ACT	2	6	814896	814901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_020283	AT	3	6	814903	814908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020283	T	9	9	814929	814937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_020283	A	8	8	814939	814946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020283	T	6	6	817556	817561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020283	TAAAT	2	10	817585	817594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020283	TTA	2	6	817602	817607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020283	TTTA	2	8	817611	817618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020283	AAT	6	18	817619	817636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020283	AT	3	6	817635	817640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020283	T	7	7	817666	817672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020283	A	8	8	817696	817703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020283	TAA	2	6	817731	817736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020283	T	6	6	817749	817754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020283	A	8	8	817761	817768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_020283	AAG	2	6	817780	817785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020283	TA	3	6	817808	817813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020283	CTA	2	6	820812	820817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_020283	TAA	2	6	821481	821486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_020283	AT	3	6	821751	821756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020283	AT	3	6	821811	821816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020283	TATT	2	8	821827	821834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020283	TGG	2	6	821871	821876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_020283	T	7	7	821877	821883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_020283	GTA	2	6	821900	821905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_020283	AT	3	6	821923	821928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.