MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020260	TTCATT	2	12	14069	14080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020260	TAACCA	2	12	56145	56156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020260	TCCTCT	2	12	98362	98373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020260	ACCCCA	2	12	133981	133992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020260	TATTGA	2	12	153358	153369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020260	ATCGGT	2	12	154514	154525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020260	AAGTGA	2	12	181616	181627	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020260	AAATTT	2	12	211767	211778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020260	GCTTTA	2	12	226989	227000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020260	ATCGCC	2	12	254951	254962	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020260	CTAAAA	2	12	351220	351231	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020260	AGGGGC	2	12	401702	401713	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020260	GATCCC	2	12	520456	520467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020260	CCTTGT	2	12	542173	542184	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020260	GCTTAT	2	12	543721	543732	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020260	GCGCAT	2	12	554473	554484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020260	GAAATG	2	12	635946	635957	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020260	AGGTGC	2	12	656768	656779	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020260	GGTTGG	2	12	730178	730189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020260	TGAAAA	2	12	731613	731624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020260	ACATTT	2	12	765724	765735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020260	CGGTTG	2	12	789598	789609	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020260	CGGCCG	2	12	846539	846550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020260	ACTTGC	2	12	859307	859318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020260	ATGCAG	2	12	891380	891391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020260	TTTCTG	2	12	935755	935766	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020260	AAAGAA	2	12	947904	947915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020260	TTTTCT	2	12	956077	956088	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020260	GAAAAT	2	12	960039	960050	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020260	CTTTTT	2	12	1011946	1011957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020260	GAAATA	2	12	1020536	1020547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020260	CGTTGC	2	12	1024495	1024506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020260	TAAAAT	2	12	1083335	1083346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020260	GCAAGA	2	12	1096545	1096556	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020260	TTTCCC	2	12	1111054	1111065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020260	TCGTTG	2	12	1130762	1130773	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020260	GTAGGT	2	12	1131453	1131464	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020260	TATTGT	2	12	1235061	1235072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020260	CATGAA	2	12	1277663	1277674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020260	CTGAAC	2	12	1312182	1312193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020260	AAAGCT	2	12	1364017	1364028	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020260	TTTGAG	2	12	1377086	1377097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020260	TACTTT	2	12	1391314	1391325	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020260	TATTAG	2	12	1394240	1394251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020260	TCAGGT	2	12	1522736	1522747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020260	ATGATA	2	12	1563174	1563185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020260	TTAATT	2	12	1592193	1592204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020260	GCTCCT	2	12	1632078	1632089	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020260	GCCTTA	2	12	1663992	1664003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020260	GCTTAC	2	12	1705477	1705488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020260	GTAAGC	2	12	1705587	1705598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020260	GTAAGC	2	12	1706467	1706478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020260	ATCTAT	2	12	1718866	1718877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020260	AATTGT	2	12	1722221	1722232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020260	TGAATA	2	12	1773503	1773514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020260	CAGGGG	2	12	1791903	1791914	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020260	TTACGC	2	12	1838131	1838142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020260	GCTTTT	2	12	1845754	1845765	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020260	GTTCAG	2	12	1854076	1854087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020260	CGGTGG	2	12	1886085	1886096	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020260	GCCGGT	2	12	1887711	1887722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020260	CTTTAA	2	12	1887864	1887875	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020260	GATATA	2	12	1892525	1892536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020260	TTTCTG	2	12	1913549	1913560	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020260	CGCTGG	2	12	1923939	1923950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020260	GCATTG	2	12	1944777	1944788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020260	TATTTA	2	12	2003478	2003489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020260	TTGACG	2	12	2008293	2008304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020260	CGCAAA	2	12	2039299	2039310	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020260	TATCAG	2	12	2062187	2062198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020260	ATCGTT	2	12	2138885	2138896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020260	TACTGA	2	12	2226316	2226327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020260	ATTACA	2	12	2261769	2261780	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020260	GCTTAC	2	12	2332845	2332856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020260	CTGCAT	2	12	2401260	2401271	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020260	ACCATA	2	12	2405359	2405370	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020260	CCCCAC	2	12	2411325	2411336	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
78	NC_020260	CAATTT	2	12	2416220	2416231	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020260	CGTGAA	2	12	2446013	2446024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020260	AAGCGC	2	12	2446127	2446138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020260	GCTTAC	2	12	2448285	2448296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020260	TGCGGC	2	12	2499833	2499844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020260	CAAAAC	2	12	2503864	2503875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020260	GTAAGC	2	12	2527107	2527118	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020260	CTTTCA	2	12	2562501	2562512	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020260	GTAAGC	2	12	2595912	2595923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020260	CCTTTT	2	12	2653518	2653529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020260	TGCGTT	2	12	2693678	2693689	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020260	GCAGCG	2	12	2709269	2709280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020260	ATCGAT	2	12	2827847	2827858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020260	CCATCA	2	12	2829622	2829633	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020260	TCCAAA	2	12	2847302	2847313	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020260	TTTTTG	2	12	2924753	2924764	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020260	TTTTAT	2	12	2955177	2955188	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020260	TTTCTG	2	12	2956001	2956012	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020260	AATTTT	2	12	2971547	2971558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020260	AGCGGA	2	12	2975073	2975084	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020260	TGCTGA	2	12	2976292	2976303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020260	GCCGTC	2	12	2976396	2976407	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020260	CCCAGC	2	12	2976576	2976587	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_020260	CTTTAC	2	12	2998081	2998092	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020260	ATCACG	2	12	3003455	3003466	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020260	TAGCAT	2	12	3009780	3009791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020260	AGCGGT	2	12	3016047	3016058	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020260	CACGCC	2	12	3020162	3020173	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020260	AAAAAC	2	12	3022023	3022034	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020260	TTGTGG	2	12	3061749	3061760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020260	TCCGGC	2	12	3079682	3079693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020260	CCTTTT	2	12	3133264	3133275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020260	AATAAA	2	12	3181149	3181160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020260	AAAAAC	2	12	3218651	3218662	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020260	GCCCGC	2	12	3282180	3282191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020260	ATCATT	2	12	3315604	3315615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020260	CTTCCC	2	12	3324354	3324365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_020260	TCAGCA	2	12	3359493	3359504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020260	CCGCGC	2	12	3359552	3359563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_020260	GCTGGC	2	12	3360178	3360189	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020260	TATGTG	2	12	3368158	3368169	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020260	GTGGCT	2	12	3368525	3368536	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020260	AGGACG	2	12	3368685	3368696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020260	AATGCC	2	12	3368842	3368853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020260	CGCCAG	2	12	3377653	3377664	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020260	ATATTG	2	12	3383967	3383978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020260	CAGTGT	2	12	3394048	3394059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020260	TTAAAA	2	12	3394270	3394281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020260	ACCAAA	2	12	3395916	3395927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020260	TAACCC	2	12	3396020	3396031	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020260	GTAAAA	2	12	3405286	3405297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020260	GAATCT	2	12	3458656	3458667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020260	TTTATA	2	12	3469718	3469729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020260	GGTTAA	2	12	3515911	3515922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020260	GCAAAA	2	12	3609026	3609037	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020260	GCCGGT	2	12	3705100	3705111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020260	ACCGTG	2	12	3707291	3707302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020260	CGGTGA	2	12	3708024	3708035	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_020260	GCGTCA	2	12	3708366	3708377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020260	TCGACC	2	12	3708398	3708409	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020260	ACCGCC	3	18	3708898	3708915	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020260	AGGGTA	2	12	3834005	3834016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020260	TGAGTA	2	12	3834139	3834150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020260	AAGGGA	2	12	3836536	3836547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020260	GGAAAA	2	12	3843167	3843178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020260	CGTCCG	2	12	3854246	3854257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020260	TGGCGT	2	12	3894178	3894189	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_020260	TATCCT	2	12	3909157	3909168	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_020260	TCATTT	2	12	3923700	3923711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_020260	AATTAT	2	12	4106531	4106542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020260	CAAAAA	2	12	4180496	4180507	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_020260	AATGAT	2	12	4237089	4237100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020260	AAAACC	2	12	4282813	4282824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020260	CATTTT	2	12	4292512	4292523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.