MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 3558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020248	A	6	6	798893	798898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_020248	ATTG	2	8	798901	798908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020248	TAC	2	6	798932	798937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_020248	TTTAC	2	10	798959	798968	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2505	NC_020248	TAGTT	2	10	798977	798986	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020248	TAA	2	6	798992	798997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020248	TCT	2	6	799010	799015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_020248	CTC	2	6	799029	799034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_020248	TCT	2	6	799156	799161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_020248	CCCTC	2	10	799164	799173	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2511	NC_020248	TC	3	6	799172	799177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_020248	TGA	2	6	799178	799183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020248	CTTG	2	8	800454	800461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_020248	CT	3	6	800575	800580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_020248	CAA	2	6	800588	800593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_020248	TCA	2	6	800622	800627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_020248	AGT	2	6	800639	800644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_020248	CAA	2	6	800752	800757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_020248	CCTA	2	8	800861	800868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_020248	AAT	2	6	800904	800909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020248	A	6	6	800956	800961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020248	TTC	2	6	801560	801565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_020248	TGG	2	6	801584	801589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020248	TC	3	6	801613	801618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2525	NC_020248	TAAT	2	8	801646	801653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020248	AAGAA	2	10	801654	801663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020248	TAA	3	9	801687	801695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_020248	ATT	2	6	801739	801744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_020248	ATCA	2	8	801751	801758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_020248	TAA	2	6	801772	801777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_020248	AGT	2	6	801819	801824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020248	ACTC	2	8	803584	803591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_020248	ACT	2	6	803602	803607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_020248	TATC	2	8	803647	803654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2535	NC_020248	A	7	7	803733	803739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_020248	CTCA	2	8	803749	803756	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_020248	A	6	6	803792	803797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_020248	ATC	2	6	804175	804180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_020248	A	9	9	804219	804227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020248	A	7	7	805994	806000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020248	CTATGT	2	12	806073	806084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2542	NC_020248	TCT	2	6	806090	806095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_020248	A	7	7	806177	806183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_020248	T	6	6	806216	806221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020248	TTC	2	6	806946	806951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_020248	A	6	6	806998	807003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_020248	TTA	2	6	807024	807029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020248	ATGA	2	8	807059	807066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_020248	CTT	2	6	807103	807108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_020248	AT	3	6	807126	807131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020248	ACAT	2	8	807169	807176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_020248	AT	4	8	807202	807209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020248	AAC	2	6	807279	807284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_020248	AGCA	2	8	807458	807465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_020248	GAAA	2	8	807466	807473	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020248	CAA	2	6	807497	807502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_020248	TA	3	6	807522	807527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020248	CCT	2	6	810758	810763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_020248	ATC	2	6	810777	810782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2561	NC_020248	CTT	2	6	810855	810860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_020248	TAA	2	6	810895	810900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020248	GTTTT	2	10	810903	810912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_020248	T	6	6	810909	810914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_020248	ATT	2	6	811793	811798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020248	T	6	6	811835	811840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020248	TATT	2	8	811866	811873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020248	ATA	2	6	813336	813341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_020248	AGTA	2	8	813349	813356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_020248	TAA	2	6	813359	813364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_020248	A	6	6	813363	813368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_020248	T	8	8	813377	813384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_020248	A	7	7	813389	813395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_020248	A	7	7	813409	813415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020248	A	7	7	813417	813423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020248	CAA	2	6	815466	815471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2578	NC_020248	GTT	2	6	815518	815523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_020248	CATG	2	8	816730	816737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2580	NC_020248	A	6	6	819721	819726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020248	A	6	6	819757	819762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_020248	AGA	2	6	819783	819788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_020248	ATT	2	6	819851	819856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_020248	TCT	2	6	820246	820251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_020248	GAAT	2	8	820253	820260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_020248	GGGCA	2	10	824232	824241	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2589	NC_020248	A	8	8	826637	826644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_020248	T	10	10	826646	826655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020248	A	6	6	826664	826669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_020248	TCTTT	2	10	826680	826689	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2593	NC_020248	T	6	6	830085	830090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_020248	CT	3	6	830179	830184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_020248	T	8	8	830187	830194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_020248	CT	3	6	830217	830222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_020248	ATT	2	6	830235	830240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020248	GA	3	6	830254	830259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_020248	GAA	2	6	831974	831979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_020248	A	6	6	831978	831983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_020248	A	6	6	832052	832057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_020248	CAAAAC	2	12	832058	832069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_020248	A	6	6	832082	832087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_020248	TTA	2	6	832105	832110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_020248	A	8	8	833182	833189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_020248	TAAA	2	8	833202	833209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_020248	AAAT	2	8	833284	833291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_020248	TCA	2	6	833382	833387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_020248	TGC	2	6	833434	833439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_020248	A	8	8	833440	833447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_020248	CTG	2	6	833450	833455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_020248	A	6	6	833467	833472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_020248	TCCA	2	8	833669	833676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_020248	A	6	6	833683	833688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_020248	TAT	2	6	833698	833703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_020248	A	7	7	836620	836626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_020248	ATTTT	2	10	836640	836649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_020248	ATG	2	6	836668	836673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2620	NC_020248	A	7	7	836784	836790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_020248	ATG	2	6	836797	836802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_020248	TC	4	8	836869	836876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_020248	TA	3	6	836922	836927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_020248	CAG	2	6	836995	837000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2626	NC_020248	CCT	2	6	837275	837280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2627	NC_020248	CTC	2	6	837301	837306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2628	NC_020248	AAC	2	6	837308	837313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_020248	GAA	2	6	837318	837323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_020248	A	6	6	837322	837327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_020248	CAA	2	6	837339	837344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_020248	CAA	2	6	837359	837364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_020248	ACA	2	6	837431	837436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_020248	TTC	2	6	837510	837515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_020248	TTC	2	6	837550	837555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_020248	A	6	6	837635	837640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_020248	AAC	2	6	837642	837647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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