MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 3558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020248	AAC	2	6	310936	310941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_020248	TA	3	6	310996	311001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020248	TGC	2	6	311002	311007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_020248	AT	3	6	311140	311145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020248	TATTT	2	10	311288	311297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020248	GCA	2	6	311421	311426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_020248	TA	3	6	311445	311450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020248	T	6	6	311466	311471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020248	T	6	6	311606	311611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020248	CTG	2	6	311842	311847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_020248	TCC	2	6	311853	311858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_020248	CTT	2	6	311899	311904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_020248	GTT	2	6	311977	311982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020248	CAA	2	6	312025	312030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_020248	TCCAGA	2	12	312056	312067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_020248	CTGC	2	8	312202	312209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_020248	AG	3	6	312224	312229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020248	CCTT	2	8	312303	312310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_020248	ACC	2	6	312339	312344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_020248	TTGA	2	8	312367	312374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020248	ATC	2	6	312393	312398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_020248	TGG	2	6	312409	312414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020248	GTT	2	6	312420	312425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020248	T	6	6	312424	312429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020248	CAA	2	6	312475	312480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_020248	A	6	6	312547	312552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020248	T	6	6	312630	312635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020248	CTG	2	6	312670	312675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_020248	GA	3	6	312681	312686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020248	GCAATC	2	12	312699	312710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_020248	TAT	2	6	312733	312738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020248	CCA	2	6	312756	312761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_020248	GAA	2	6	312810	312815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020248	TAT	2	6	312862	312867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020248	CTG	2	6	312877	312882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020248	CGT	2	6	312937	312942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_020248	CTT	2	6	312967	312972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020248	G	13	13	313004	313016	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020248	CCG	2	6	313031	313036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_020248	GAG	2	6	313094	313099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020248	GAG	2	6	313148	313153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020248	GCA	2	6	313214	313219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020248	AGC	2	6	313302	313307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_020248	TTC	2	6	313332	313337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_020248	TTC	2	6	313342	313347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_020248	TAGT	2	8	313392	313399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020248	T	6	6	313430	313435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020248	GCT	2	6	313499	313504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_020248	AATAT	2	10	313553	313562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020248	AG	3	6	313567	313572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020248	CGA	2	6	313576	313581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020248	A	8	8	313654	313661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020248	A	6	6	313663	313668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020248	AG	3	6	313682	313687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020248	GA	3	6	313732	313737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020248	TGT	2	6	316279	316284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020248	A	6	6	316293	316298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020248	TCT	2	6	316303	316308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_020248	A	6	6	316347	316352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020248	TGA	2	6	319032	319037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020248	TAAGA	2	10	319076	319085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020248	AGA	2	6	319093	319098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020248	AAC	2	6	319109	319114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_020248	ATGC	2	8	319148	319155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_020248	CAG	2	6	319166	319171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_020248	AC	3	6	319236	319241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_020248	TTCG	2	8	319269	319276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_020248	AGGA	2	8	319286	319293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020248	GAA	2	6	319390	319395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020248	TGT	2	6	319433	319438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020248	AAT	2	6	319451	319456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020248	GCA	2	6	319466	319471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_020248	TTG	2	6	319492	319497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020248	AGT	2	6	319542	319547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020248	CTT	2	6	319561	319566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_020248	GCA	2	6	319585	319590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020248	GAT	2	6	319595	319600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020248	AAG	2	6	319601	319606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020248	TC	3	6	319626	319631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_020248	TGA	2	6	319723	319728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020248	GA	3	6	319776	319781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020248	GTT	2	6	319864	319869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020248	GAG	2	6	319874	319879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020248	AGT	2	6	319884	319889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020248	TAG	2	6	320020	320025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020248	AG	3	6	320024	320029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020248	GTT	2	6	320049	320054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020248	ATC	2	6	320115	320120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_020248	AGG	2	6	320457	320462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020248	GTT	2	6	320515	320520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020248	CGA	2	6	320582	320587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_020248	C	16	16	320654	320669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1093	NC_020248	TTAG	2	8	320694	320701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020248	AAC	2	6	320756	320761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_020248	CTG	2	6	320770	320775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_020248	AGAACC	2	12	320825	320836	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_020248	TG	3	6	320849	320854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020248	AGT	3	9	320935	320943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020248	TTTA	2	8	320959	320966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020248	AGA	2	6	321012	321017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020248	CTT	2	6	321030	321035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_020248	CCA	2	6	321059	321064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_020248	TGA	2	6	321120	321125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020248	TAC	2	6	321177	321182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_020248	TAT	2	6	321186	321191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020248	CAAA	2	8	321193	321200	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_020248	GAA	2	6	321218	321223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020248	GTT	2	6	321235	321240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020248	GGA	2	6	321310	321315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020248	ATT	2	6	321340	321345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020248	AAGAC	2	10	321425	321434	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_020248	ATG	2	6	321455	321460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020248	GTA	2	6	321593	321598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020248	GAAA	2	8	321634	321641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020248	T	6	6	321669	321674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020248	AC	3	6	321706	321711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_020248	TA	3	6	321726	321731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020248	GTT	2	6	321809	321814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020248	CTT	2	6	321819	321824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_020248	AAT	2	6	324627	324632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020248	TG	3	6	324649	324654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020248	GA	3	6	324695	324700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020248	TGCA	2	8	327404	327411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_020248	TA	3	6	327466	327471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020248	AAG	2	6	327472	327477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020248	TGAAA	2	10	327500	327509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020248	A	7	7	327507	327513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020248	AAAG	2	8	327541	327548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020248	AG	3	6	327612	327617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020248	A	6	6	331748	331753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020248	TGAAAA	2	12	331800	331811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020248	ATT	2	6	331879	331884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020248	GAA	2	6	331889	331894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020248	AAG	2	6	331909	331914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020248	T	6	6	332240	332245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020248	TAA	2	6	332252	332257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_020248	A	6	6	422885	422890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_020248	T	6	6	423242	423247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_020248	TTA	2	6	423249	423254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_020248	TAT	2	6	424481	424486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_020248	AAT	2	6	424513	424518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1437	NC_020248	TTTA	2	8	432895	432902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_020248	T	6	6	433046	433051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_020248	CTT	2	6	433195	433200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_020248	AG	3	6	433349	433354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_020248	AGT	2	6	433367	433372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_020248	G	6	6	433635	433640	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_020248	AGG	2	6	433670	433675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_020248	AGA	2	6	433685	433690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_020248	AAG	2	6	433717	433722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_020248	CTGT	2	8	433780	433787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1454	NC_020248	TCT	2	6	433791	433796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1455	NC_020248	CTT	2	6	433820	433825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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