MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 3558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020248	A	8	8	169065	169072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020248	TTA	2	6	169085	169090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020248	A	6	6	169099	169104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020248	TTTTC	2	10	169215	169224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
505	NC_020248	TAA	2	6	169225	169230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020248	TTG	2	6	169282	169287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020248	ACA	2	6	169300	169305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020248	AGT	2	6	169318	169323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020248	GTA	2	6	169383	169388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020248	T	9	9	169418	169426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020248	AG	3	6	169502	169507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020248	A	6	6	169542	169547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020248	ACA	2	6	169562	169567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020248	GAT	2	6	169622	169627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020248	T	6	6	169646	169651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020248	AG	3	6	169684	169689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020248	CTGTT	2	10	169694	169703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
518	NC_020248	AATGA	2	10	169729	169738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020248	TTG	2	6	169757	169762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020248	GTT	2	6	169973	169978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020248	TAGT	2	8	170038	170045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020248	T	6	6	172929	172934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020248	TAAAGA	2	12	173097	173108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020248	TA	3	6	173129	173134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020248	AG	3	6	173173	173178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020248	GGT	2	6	173473	173478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020248	T	6	6	173508	173513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020248	CAAAA	2	10	173536	173545	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
529	NC_020248	A	7	7	173542	173548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020248	CTC	2	6	173558	173563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_020248	TTA	2	6	173573	173578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020248	AAGA	2	8	173636	173643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020248	GGC	2	6	173662	173667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_020248	AGT	2	6	173728	173733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020248	AGA	2	6	173842	173847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020248	AGA	2	6	173860	173865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020248	CGCAT	2	10	173906	173915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
538	NC_020248	AT	3	6	175368	175373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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540	NC_020248	ACA	2	6	179209	179214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020248	GTT	2	6	179226	179231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020248	TAC	2	6	179240	179245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020248	GTA	2	6	179259	179264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020248	ATT	2	6	179288	179293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020248	AAC	2	6	179314	179319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_020248	TAAA	2	8	179320	179327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020248	A	6	6	179325	179330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020248	ATT	2	6	179358	179363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020248	TTTA	2	8	179380	179387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020248	AAT	2	6	179388	179393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020248	AACT	2	8	179396	179403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_020248	TAA	2	6	179411	179416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020248	AG	3	6	179435	179440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020248	A	8	8	179448	179455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020248	GAG	2	6	179527	179532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020248	CAT	2	6	185537	185542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_020248	TTC	2	6	185628	185633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_020248	AAT	2	6	185653	185658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020248	TAG	2	6	185686	185691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020248	CAT	2	6	185698	185703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020248	AACA	2	8	185935	185942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_020248	AAT	2	6	185979	185984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020248	T	6	6	186029	186034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020248	GTT	2	6	186076	186081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020248	GATT	2	8	187263	187270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020248	T	6	6	187269	187274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020248	GAT	2	6	187312	187317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020248	AATGT	2	10	187344	187353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020248	TTC	2	6	187355	187360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_020248	ATT	2	6	187409	187414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020248	ATA	2	6	191403	191408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020248	TCA	2	6	191412	191417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_020248	CTT	2	6	191651	191656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_020248	ACG	2	6	191772	191777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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583	NC_020248	GTTT	2	8	193682	193689	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020248	TTA	2	6	193752	193757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_020248	TTTTA	2	10	193884	193893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_020248	T	7	7	193968	193974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020248	TTC	2	6	195018	195023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_020248	TCT	2	6	195052	195057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_020248	CAT	2	6	195059	195064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_020248	ACA	2	6	195091	195096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_020248	TTG	2	6	195099	195104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020248	ACA	2	6	195150	195155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020248	TGT	2	6	195240	195245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020248	CCCTA	2	10	195246	195255	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
597	NC_020248	AGT	2	6	195294	195299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_020248	TATT	2	8	195407	195414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020248	CAG	2	6	195418	195423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_020248	TAAA	3	12	195438	195449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020248	TCT	2	6	195487	195492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_020248	TAA	2	6	195588	195593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020248	TTA	2	6	195613	195618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020248	A	6	6	195653	195658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020248	TAA	2	6	195666	195671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020248	A	6	6	195708	195713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020248	GAA	2	6	195718	195723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020248	CTA	2	6	195724	195729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_020248	GTT	2	6	195739	195744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020248	G	6	6	195765	195770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020248	TCT	3	9	196345	196353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_020248	CTT	2	6	196355	196360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_020248	TTA	2	6	196386	196391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020248	T	6	6	196403	196408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020248	GTTT	2	8	196488	196495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020248	T	8	8	196493	196500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020248	GAA	2	6	196544	196549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020248	CACT	2	8	198136	198143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_020248	ACA	2	6	198157	198162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_020248	CTTT	2	8	198390	198397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_020248	TTA	2	6	198398	198403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020248	ATTA	2	8	198407	198414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020248	TAA	2	6	198430	198435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020248	A	6	6	198473	198478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020248	TTC	3	9	198480	198488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020248	TTC	2	6	198524	198529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020248	CTT	2	6	198533	198538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020248	CTTT	2	8	198564	198571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_020248	AATC	2	8	198572	198579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_020248	GTTTT	2	10	198597	198606	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020248	T	6	6	198603	198608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020248	A	6	6	198649	198654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020248	ATTA	2	8	198709	198716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020248	TAA	2	6	198735	198740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020248	AGG	2	6	199093	199098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020248	ATT	2	6	199102	199107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020248	AGA	2	6	199182	199187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020248	A	6	6	199187	199192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020248	AC	3	6	199195	199200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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