MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Uzinura diaspidicola str. ASNER

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020135	AAAG	2	8	13913	13920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020135	CCGT	2	8	15473	15480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020135	ATAA	2	8	17354	17361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020135	AAAT	2	8	32564	32571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020135	AATA	2	8	32599	32606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020135	TGGT	2	8	32761	32768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020135	GGTT	2	8	32769	32776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020135	TAAA	2	8	34394	34401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020135	TGGA	2	8	39308	39315	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020135	ATTA	2	8	40435	40442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020135	ATAG	2	8	42565	42572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020135	ATAA	2	8	42985	42992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020135	ATAG	2	8	44464	44471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020135	TTGA	2	8	44843	44850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020135	TCGC	2	8	44948	44955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020135	TAAT	2	8	45193	45200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020135	AACT	2	8	46701	46708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020135	TAAT	2	8	48451	48458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020135	ATCA	2	8	48517	48524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020135	TAGA	2	8	48971	48978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020135	ACAT	2	8	48979	48986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020135	AGAT	2	8	49038	49045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020135	AGTA	2	8	49466	49473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020135	AGGA	2	8	50857	50864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020135	TTTA	2	8	50885	50892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020135	ATTT	2	8	51382	51389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020135	GAAG	2	8	51850	51857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020135	TTAT	2	8	52692	52699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020135	GCCT	2	8	52883	52890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020135	AAAT	2	8	53291	53298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020135	AGTA	2	8	53657	53664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020135	GTAT	2	8	53846	53853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020135	GATA	2	8	54055	54062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020135	TTAT	2	8	54094	54101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020135	TAAA	2	8	58002	58009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020135	TAAA	2	8	73754	73761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020135	TTAT	2	8	73799	73806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020135	AAAT	2	8	73919	73926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020135	TTAT	2	8	73960	73967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020135	TTTA	2	8	74998	75005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020135	TCTT	2	8	75010	75017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020135	TCTA	2	8	75254	75261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020135	TGAT	2	8	75369	75376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020135	CAAA	2	8	75556	75563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020135	ATAA	2	8	75783	75790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020135	GTTT	2	8	75802	75809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020135	AGGA	2	8	81844	81851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020135	TTCT	2	8	89636	89643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020135	AAGT	2	8	89719	89726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020135	CTAT	2	8	93609	93616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020135	TAAA	2	8	98251	98258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020135	AAAT	2	8	103645	103652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020135	TTTC	2	8	110923	110930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020135	AGAA	2	8	112560	112567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020135	TTTA	2	8	112840	112847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020135	TTTC	2	8	116064	116071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020135	TTTA	2	8	116120	116127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020135	CTTC	2	8	119262	119269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020135	AAAT	2	8	123576	123583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020135	TATT	2	8	129541	129548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020135	GTTC	2	8	130044	130051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020135	TTTA	2	8	130104	130111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020135	CATT	2	8	130187	130194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020135	TAAA	2	8	131093	131100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020135	TATC	2	8	131118	131125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020135	CCAT	2	8	131367	131374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020135	AGAA	2	8	131398	131405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020135	ATAA	2	8	131531	131538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020135	TACA	2	8	133416	133423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020135	TTTG	2	8	133887	133894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020135	TCCA	2	8	134079	134086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020135	AAAG	2	8	134346	134353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020135	ATAA	2	8	135061	135068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020135	ATTT	2	8	136435	136442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020135	TAAA	2	8	137048	137055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020135	ATGG	2	8	137068	137075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020135	AGAA	2	8	137130	137137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020135	TAAA	2	8	137530	137537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020135	TAAA	2	8	139645	139652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020135	TAAA	2	8	139726	139733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020135	TTTG	2	8	155018	155025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020135	TATT	2	8	155067	155074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020135	TTCT	2	8	155171	155178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020135	CATA	2	8	155495	155502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020135	TAAA	2	8	156238	156245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020135	TAAA	2	8	162517	162524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020135	ATTT	2	8	169100	169107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020135	TAAT	2	8	171316	171323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020135	TAGA	2	8	175368	175375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020135	AAAG	2	8	175452	175459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020135	GATA	2	8	175537	175544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020135	AAGA	2	8	181666	181673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020135	TACA	2	8	181874	181881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020135	TAAT	2	8	189863	189870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020135	TAAA	2	8	190019	190026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020135	AAAG	2	8	199358	199365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020135	TAAA	2	8	204192	204199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020135	TTTA	2	8	213040	213047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020135	TAAA	2	8	213097	213104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020135	TTCT	2	8	231598	231605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020135	GTTT	2	8	233401	233408	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020135	ATCT	2	8	233435	233442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020135	TATT	2	8	234862	234869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020135	AATA	2	8	244765	244772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020135	TATT	2	8	244910	244917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020135	AATC	2	8	247173	247180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020135	AAAG	2	8	249109	249116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020135	TAAA	2	8	251733	251740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020135	TAAA	2	8	256606	256613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020135	AAAG	2	8	258434	258441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020135	AGTA	2	8	258543	258550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020135	AAAT	2	8	261377	261384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.