MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia chromaiodes str. 640 chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020075	TATGTA	2	12	9199	9210	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020075	AAAGAT	2	12	9272	9283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020075	ATTTAT	2	12	10852	10863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020075	AGAAAA	2	12	29731	29742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020075	TTAAAT	2	12	40537	40548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020075	TAAGCA	2	12	49179	49190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020075	AATTTT	2	12	49640	49651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020075	CAAATA	2	12	56072	56083	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020075	ATTTTT	2	12	56213	56224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020075	TCAATT	2	12	58663	58674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020075	TATTTT	2	12	62343	62354	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020075	TTAATT	2	12	67677	67688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020075	TTAATT	2	12	82751	82762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020075	TTAATT	2	12	83894	83905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020075	TATTTT	2	12	93678	93689	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020075	AAATAT	2	12	103991	104002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020075	TAAATA	2	12	106787	106798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020075	CCAATA	2	12	112483	112494	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020075	ATTTTT	2	12	117514	117525	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020075	TTTATT	2	12	136111	136122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020075	GTAACA	2	12	150417	150428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020075	ATAAAA	2	12	163902	163913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020075	ATTTAT	2	12	186497	186508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020075	CTAATA	2	12	192985	192996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020075	TATAAA	2	12	193659	193670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020075	TTAAAT	2	12	200966	200977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020075	TTGGCA	6	36	201114	201149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020075	TATTTC	2	12	219566	219577	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020075	TGATTT	2	12	221949	221960	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020075	ATGCTC	2	12	226943	226954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020075	ATAGAT	2	12	233000	233011	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020075	TAATTA	2	12	241244	241255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020075	AAAATA	2	12	260504	260515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020075	CATATA	2	12	266182	266193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020075	GCATAT	2	12	291142	291153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020075	AATTTT	2	12	293353	293364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020075	ATTACG	2	12	299317	299328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020075	ACTTTT	2	12	310714	310725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020075	AAATTA	2	12	310835	310846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020075	TATAAT	2	12	310923	310934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020075	TATCTA	3	18	312780	312797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020075	TTATAA	2	12	312988	312999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020075	ATAATT	2	12	318605	318616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020075	TATAAT	2	12	329520	329531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020075	TAAAAA	2	12	332663	332674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020075	TAAAAA	2	12	348075	348086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020075	AGTATA	2	12	354873	354884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020075	ATTTTT	2	12	356871	356882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020075	TATACA	2	12	358339	358350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020075	AAAATA	2	12	358868	358879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020075	ATTTTT	2	12	362152	362163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020075	TACAAA	2	12	362660	362671	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020075	AATATC	2	12	367736	367747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020075	TAAATT	2	12	368182	368193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020075	AATTAT	2	12	369492	369503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020075	TATCTA	2	12	376911	376922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020075	AAAATA	2	12	388971	388982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020075	GTATAG	2	12	397979	397990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020075	AACACT	2	12	398713	398724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020075	ATCTTA	2	12	406837	406848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020075	TTATAA	2	12	414678	414689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020075	AATTAA	2	12	419689	419700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020075	ACATAT	2	12	420402	420413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020075	TAATTA	2	12	442829	442840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020075	AAATAT	2	12	451780	451791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020075	ACTCCA	2	12	454588	454599	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020075	ATAAAA	2	12	458977	458988	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020075	TAAAAA	2	12	471884	471895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020075	TAAAAA	2	12	476919	476930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020075	TATAAT	2	12	477968	477979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020075	TTATAT	2	12	482261	482272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020075	AATCAT	2	12	482356	482367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020075	ATTATG	2	12	491294	491305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020075	AAATTA	2	12	502302	502313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020075	TCAAAT	2	12	503895	503906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020075	TCAAAT	2	12	506905	506916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020075	ATTTAA	2	12	515881	515892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020075	ATACTT	2	12	517316	517327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020075	TTTTTA	2	12	525148	525159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020075	TATTTA	2	12	526341	526352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020075	AAAACA	2	12	526372	526383	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020075	TAATTT	2	12	530604	530615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020075	AATTAA	2	12	530680	530691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020075	TAAAAA	2	12	532072	532083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020075	TTTTAC	2	12	545891	545902	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020075	ATTTAA	2	12	553227	553238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020075	CAATAT	2	12	562667	562678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020075	AATACA	2	12	564108	564119	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020075	TATTTA	2	12	567108	567119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020075	ATAAAA	2	12	578260	578271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020075	CATATA	2	12	578399	578410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020075	TACAGT	2	12	581138	581149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020075	AATAAA	2	12	581158	581169	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020075	TCAATA	2	12	586261	586272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020075	ATATTT	2	12	592793	592804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020075	TACATT	2	12	609534	609545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020075	AAACAT	2	12	609569	609580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020075	TTAAAA	2	12	609693	609704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020075	AAACAT	2	12	617039	617050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020075	AATAAC	2	12	623340	623351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020075	TTATTT	2	12	627307	627318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020075	ATTTTA	2	12	644110	644121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020075	GTTCTG	2	12	644899	644910	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020075	CCAAAA	2	12	653792	653803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020075	ATTAAA	2	12	654019	654030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020075	CTATTT	2	12	657441	657452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020075	TAATTT	2	12	657599	657610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020075	AATGAA	2	12	664465	664476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020075	AATATA	2	12	668862	668873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020075	GAATAT	2	12	670264	670275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020075	GTTTTT	2	12	676582	676593	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020075	TAAAAA	2	12	677994	678005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020075	TTTTAA	2	12	683798	683809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020075	TTTAGA	2	12	696688	696699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020075	TTTTAA	2	12	705973	705984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020075	TTTTTA	2	12	707531	707542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020075	ATATGT	2	12	712255	712266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020075	ATATTT	2	12	720212	720223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020075	TTTTTA	2	12	736759	736770	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020075	AATTTT	2	12	737048	737059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020075	TTTATT	2	12	743745	743756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020075	AAATAT	2	12	751224	751235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020075	AAAATT	2	12	755074	755085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020075	TTTTTC	2	12	758024	758035	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020075	AATATA	2	12	763908	763919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020075	CCCTCC	2	12	772854	772865	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
127	NC_020075	AAATAT	2	12	772893	772904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020075	TTTATT	2	12	773379	773390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020075	AATATT	2	12	777371	777382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020075	CTAATT	2	12	784709	784720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.