MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020053	CA	3	6	10784	10789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020053	GC	3	6	13836	13841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020053	AT	3	6	40796	40801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020053	CT	4	8	42190	42197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020053	TC	3	6	51051	51056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020053	TC	3	6	51571	51576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020053	TG	3	6	59144	59149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020053	AT	3	6	61602	61607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020053	AT	3	6	62240	62245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020053	GC	3	6	62476	62481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020053	CT	3	6	62503	62508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020053	TC	3	6	64021	64026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020053	TC	3	6	64442	64447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020053	GT	3	6	68110	68115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020053	AG	3	6	68402	68407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020053	TA	4	8	69061	69068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020053	CT	3	6	80805	80810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020053	TA	3	6	80938	80943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020053	TA	3	6	81837	81842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020053	AT	3	6	81933	81938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020053	AG	3	6	81939	81944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020053	AG	3	6	81948	81953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020053	AT	3	6	82479	82484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020053	AT	3	6	82488	82493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020053	GT	3	6	84323	84328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020053	CT	3	6	85888	85893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020053	AG	3	6	85902	85907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020053	AT	3	6	100212	100217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020053	CA	3	6	107804	107809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020053	CT	3	6	114710	114715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020053	AT	3	6	114794	114799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020053	CT	3	6	119052	119057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020053	TC	3	6	120947	120952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020053	AG	3	6	124793	124798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020053	TC	3	6	126251	126256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020053	AT	3	6	127252	127257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020053	GA	3	6	127357	127362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020053	CT	3	6	135790	135795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020053	AG	3	6	137292	137297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020053	TG	3	6	145779	145784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020053	AG	3	6	147824	147829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020053	CT	3	6	147918	147923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020053	TA	3	6	148299	148304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020053	CT	3	6	148820	148825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020053	TC	3	6	152562	152567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020053	AG	3	6	153268	153273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020053	CA	3	6	153280	153285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020053	AT	3	6	162399	162404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020053	TG	3	6	171471	171476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020053	CT	3	6	189257	189262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020053	AG	3	6	189362	189367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020053	TC	3	6	192328	192333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020053	CG	3	6	192611	192616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020053	AG	3	6	204304	204309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020053	AT	3	6	205513	205518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020053	CG	3	6	209140	209145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020053	AT	3	6	209976	209981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020053	GA	3	6	216735	216740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020053	GA	3	6	225370	225375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020053	AT	3	6	225387	225392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020053	AT	3	6	226178	226183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020053	AT	3	6	226193	226198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020053	GA	3	6	228313	228318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020053	TC	3	6	228506	228511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020053	GA	3	6	228716	228721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020053	TC	3	6	231584	231589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020053	AC	3	6	245810	245815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020053	CG	3	6	246636	246641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020053	GA	3	6	246783	246788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020053	AG	3	6	248377	248382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020053	AT	3	6	248441	248446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020053	CT	3	6	250031	250036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020053	AT	4	8	252799	252806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020053	CA	3	6	254598	254603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020053	AT	3	6	275795	275800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020053	AT	3	6	276288	276293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020053	CT	3	6	296543	296548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020053	TC	3	6	296585	296590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020053	CG	3	6	313156	313161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020053	AT	5	10	313874	313883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020053	CG	3	6	316619	316624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020053	AT	3	6	322077	322082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020053	CA	3	6	328699	328704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020053	AT	3	6	340705	340710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020053	CA	3	6	341015	341020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020053	AT	3	6	362805	362810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020053	AT	3	6	366128	366133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020053	CT	3	6	378946	378951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020053	AG	3	6	378960	378965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020053	AG	3	6	379897	379902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020053	TA	3	6	381461	381466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020053	CT	3	6	382888	382893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020053	CT	3	6	382897	382902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020053	AT	3	6	382903	382908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020053	AT	3	6	383025	383030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020053	AG	3	6	384091	384096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020053	TA	3	6	385859	385864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020053	AT	3	6	386421	386426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020053	CT	3	6	395835	395840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020053	AT	3	6	396074	396079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020053	CT	3	6	396600	396605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020053	GC	3	6	404740	404745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020053	AC	3	6	404767	404772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020053	AT	3	6	408763	408768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020053	GT	3	6	410974	410979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020053	TA	3	6	420586	420591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020053	TA	3	6	421382	421387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020053	GA	3	6	422140	422145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020053	GT	3	6	422247	422252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020053	GC	3	6	431752	431757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020053	AG	3	6	432127	432132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020053	TA	3	6	445730	445735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020053	CT	3	6	446562	446567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.