MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 1521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020053	CAC	2	6	152534	152539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_020053	TC	3	6	152562	152567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_020053	GTT	2	6	153033	153038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020053	TAC	2	6	153051	153056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_020053	TTA	2	6	153097	153102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020053	TCA	2	6	153128	153133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_020053	GACT	2	8	153165	153172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_020053	GATC	2	8	153175	153182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_020053	TAAT	2	8	153211	153218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020053	AG	3	6	153268	153273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020053	CA	3	6	153280	153285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_020053	CAA	2	6	156021	156026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020053	TGG	2	6	156031	156036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020053	CAT	2	6	158293	158298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_020053	CCA	2	6	158330	158335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_020053	TCTA	2	8	158354	158361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_020053	CTAA	2	8	158383	158390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_020053	ATCG	2	8	158412	158419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_020053	ACA	2	6	158442	158447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020053	TCGA	2	8	159375	159382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_020053	TTCA	2	8	159430	159437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_020053	ACA	2	6	159447	159452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020053	ATCT	2	8	160497	160504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_020053	TTC	2	6	160505	160510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020053	ATCAA	2	10	160526	160535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
526	NC_020053	TCT	2	6	161303	161308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_020053	GCA	2	6	161406	161411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020053	GAT	2	6	161428	161433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020053	GGT	2	6	161634	161639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020053	GTC	2	6	161644	161649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020053	CTGC	2	8	162332	162339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_020053	AT	3	6	162399	162404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020053	AGT	2	6	162421	162426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020053	AAC	2	6	162453	162458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_020053	TCTG	2	8	162557	162564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_020053	ATC	2	6	162568	162573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_020053	AAGTTT	2	12	162579	162590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020053	AGT	2	6	162950	162955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020053	TACTT	2	10	162970	162979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
540	NC_020053	ACC	2	6	162985	162990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_020053	GCCA	2	8	163658	163665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
542	NC_020053	TAG	2	6	163674	163679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020053	GGT	2	6	164211	164216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020053	GTT	2	6	165000	165005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020053	AAT	2	6	165010	165015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020053	CAG	2	6	165040	165045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020053	TTG	2	6	165059	165064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020053	AAG	2	6	165116	165121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020053	GGT	2	6	165143	165148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020053	TGT	2	6	165241	165246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020053	TCC	2	6	166355	166360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_020053	TTAAAT	2	12	166390	166401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020053	CTT	2	6	166455	166460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020053	GTT	2	6	166476	166481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020053	CAA	2	6	166709	166714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020053	TGGT	2	8	166742	166749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020053	CGG	2	6	166770	166775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020053	TGC	2	6	166879	166884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_020053	T	6	6	167005	167010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020053	CGG	2	6	167083	167088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020053	CGAT	2	8	167111	167118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_020053	GATGTA	2	12	167166	167177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020053	CGAT	2	8	167194	167201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_020053	TCGA	2	8	167861	167868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020053	TAGCC	2	10	167953	167962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
566	NC_020053	TGA	2	6	167999	168004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020053	T	6	6	168848	168853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020053	AGA	2	6	169673	169678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020053	ATT	2	6	170325	170330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020053	TG	3	6	171471	171476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020053	CGAT	2	8	171571	171578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_020053	GCA	2	6	171598	171603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_020053	CTG	2	6	171607	171612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_020053	TTC	2	6	173029	173034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_020053	TTC	2	6	173048	173053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_020053	AAC	2	6	173112	173117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_020053	CCA	2	6	173127	173132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_020053	AAC	2	6	173766	173771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_020053	CTTG	2	8	173772	173779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_020053	TCGA	2	8	174154	174161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_020053	ACC	2	6	175541	175546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_020053	CTT	2	6	175570	175575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_020053	AAT	2	6	176535	176540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020053	TCT	2	6	176553	176558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_020053	ATT	2	6	176588	176593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020053	CTCTGG	2	12	176631	176642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_020053	TTC	2	6	176643	176648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_020053	CCCG	2	8	176716	176723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
589	NC_020053	TCCGC	2	10	176730	176739	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
590	NC_020053	ACGC	2	8	176775	176782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
591	NC_020053	ATG	2	6	177775	177780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020053	GAA	2	6	177789	177794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020053	GTATCC	2	12	178438	178449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020053	TCA	2	6	178899	178904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020053	TCGA	2	8	178994	179001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_020053	TTA	2	6	179003	179008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020053	GATG	2	8	179313	179320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020053	TTA	2	6	179352	179357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020053	ATA	2	6	179435	179440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020053	TCTT	2	8	179457	179464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_020053	AGA	2	6	179466	179471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020053	TATT	2	8	180508	180515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020053	ATT	2	6	180528	180533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020053	TAAAT	2	10	182012	182021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020053	TAT	2	6	182081	182086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020053	TAA	2	6	182188	182193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020053	CAG	2	6	184381	184386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_020053	TGAG	2	8	184478	184485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020053	CGA	2	6	184523	184528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_020053	GTT	2	6	185167	185172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020053	CTG	2	6	185185	185190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_020053	TAAA	2	8	186340	186347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020053	A	6	6	186345	186350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020053	GATC	2	8	186360	186367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_020053	CGATC	2	10	186377	186386	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
616	NC_020053	CCA	2	6	186388	186393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_020053	ATA	2	6	187003	187008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020053	CAC	2	6	187011	187016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_020053	AGA	2	6	187027	187032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020053	CCA	2	6	187079	187084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_020053	CGAT	2	8	187469	187476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_020053	TCGA	2	8	187479	187486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_020053	CCAG	2	8	187638	187645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
624	NC_020053	ATT	2	6	188220	188225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020053	ATTA	2	8	188238	188245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020053	GCTGC	2	10	188293	188302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
627	NC_020053	GCCGC	2	10	188360	188369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
628	NC_020053	CGAT	2	8	188443	188450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_020053	CTA	2	6	188582	188587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020053	GTTT	2	8	188627	188634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020053	GTT	2	6	188661	188666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020053	TTGC	2	8	188697	188704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_020053	CCCT	2	8	188830	188837	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
634	NC_020053	GCT	2	6	189057	189062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020053	GATC	2	8	189075	189082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_020053	CTGCCA	2	12	189109	189120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
637	NC_020053	GAA	2	6	189121	189126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020053	AGG	2	6	189203	189208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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777	NC_020053	CAG	2	6	220913	220918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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783	NC_020053	TCTA	2	8	221065	221072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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788	NC_020053	TTG	2	6	222390	222395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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795	NC_020053	CAT	2	6	225507	225512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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802	NC_020053	AT	3	6	226193	226198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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