MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 2109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020050	ATT	2	6	118137	118142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020050	ATAAAT	2	12	118161	118172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020050	ATT	2	6	118199	118204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020050	ATAAAT	2	12	118223	118234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020050	ATT	2	6	118261	118266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020050	ATAAAT	2	12	118285	118296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020050	CAT	2	6	118389	118394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020050	AC	3	6	118423	118428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_020050	CA	3	6	118430	118435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_020050	TGA	2	6	118488	118493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020050	ATT	2	6	118541	118546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020050	AAC	2	6	118550	118555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020050	TCA	2	6	118571	118576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020050	GCTCTA	2	12	118594	118605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_020050	AAG	2	6	119652	119657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020050	TCC	2	6	119670	119675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_020050	TGC	2	6	119684	119689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020050	GTGA	2	8	119802	119809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020050	GAA	2	6	119820	119825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020050	TA	3	6	121171	121176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020050	TTTAA	2	10	121237	121246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020050	TTG	2	6	121281	121286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020050	CA	3	6	121320	121325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_020050	AACC	2	8	121577	121584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_020050	GCT	2	6	122432	122437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020050	TA	3	6	122475	122480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020050	AAT	2	6	122484	122489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020050	ACT	2	6	122505	122510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020050	AAG	2	6	122511	122516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020050	CAA	2	6	122522	122527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020050	CAA	2	6	122594	122599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020050	GCC	2	6	122613	122618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_020050	GCCC	2	8	122631	122638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
534	NC_020050	GCC	2	6	122654	122659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_020050	TACTC	2	10	122660	122669	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
536	NC_020050	A	6	6	122695	122700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020050	AAGC	2	8	122807	122814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_020050	ATC	2	6	122849	122854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020050	CTGT	2	8	122857	122864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_020050	ACTT	2	8	122866	122873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_020050	ACTT	2	8	123045	123052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_020050	TAAC	2	8	123074	123081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_020050	ACT	2	6	123093	123098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_020050	AG	3	6	123713	123718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020050	TAT	2	6	123759	123764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020050	TCAAT	2	10	123771	123780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_020050	TTG	2	6	123846	123851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020050	TTC	3	9	123914	123922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020050	AAG	2	6	123951	123956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020050	T	6	6	125149	125154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020050	GTTT	2	8	125168	125175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020050	CTTG	2	8	125176	125183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_020050	CAA	2	6	125218	125223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020050	TCCCC	2	10	125293	125302	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
555	NC_020050	ACT	2	6	125391	125396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020050	TTG	2	6	125489	125494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020050	CCT	2	6	128226	128231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_020050	CTG	2	6	129474	129479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_020050	CTT	2	6	129511	129516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_020050	GGAGG	2	10	129521	129530	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020050	TCC	2	6	130094	130099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_020050	AGT	2	6	130149	130154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020050	TGG	2	6	131222	131227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020050	AGTC	2	8	131263	131270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_020050	GTA	2	6	131298	131303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020050	CAA	2	6	131352	131357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_020050	CAA	2	6	131371	131376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_020050	TTA	2	6	131380	131385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020050	GATG	2	8	131413	131420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020050	TAGA	2	8	131432	131439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020050	CAAA	2	8	131768	131775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_020050	CTA	2	6	131815	131820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_020050	ATA	2	6	131852	131857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020050	AAG	2	6	131973	131978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020050	CCA	2	6	132002	132007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_020050	ATT	2	6	132023	132028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020050	TGC	2	6	132032	132037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_020050	CAG	2	6	132040	132045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_020050	TCAT	2	8	132059	132066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_020050	CGC	2	6	132078	132083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_020050	TG	3	6	132179	132184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020050	ACC	2	6	132222	132227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_020050	TGCACC	2	12	132228	132239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
584	NC_020050	ACC	2	6	132253	132258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_020050	ATT	2	6	132274	132279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020050	AAGCA	2	10	132307	132316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_020050	GCA	2	6	132340	132345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_020050	GA	4	8	135409	135416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020050	TAG	2	6	137778	137783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020050	TCA	2	6	137822	137827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_020050	TCA	2	6	137835	137840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_020050	AGC	2	6	137846	137851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_020050	TGA	2	6	137921	137926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020050	A	6	6	137971	137976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020050	TTAG	2	8	137977	137984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020050	CGC	2	6	138067	138072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_020050	GCAA	2	8	138083	138090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_020050	GCG	2	6	138109	138114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020050	TTG	2	6	138148	138153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020050	TAA	2	6	138187	138192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020050	ATT	2	6	140348	140353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020050	GAC	2	6	140410	140415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_020050	AGA	2	6	140418	140423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020050	A	6	6	140567	140572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020050	ACC	2	6	140669	140674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_020050	GATG	2	8	140685	140692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020050	TAA	2	6	140742	140747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020050	TTGG	2	8	140837	140844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020050	TCGC	2	8	140914	140921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_020050	ACCC	2	8	140968	140975	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
611	NC_020050	AGGG	2	8	141053	141060	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020050	GAT	2	6	141085	141090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020050	ATT	2	6	141113	141118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020050	TA	3	6	141167	141172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020050	TAGT	2	8	141311	141318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020050	TGC	2	6	141379	141384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_020050	TGA	2	6	141441	141446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020050	G	6	6	143244	143249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020050	AG	4	8	145228	145235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020050	AT	3	6	149074	149079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020050	TG	3	6	149091	149096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020050	T	6	6	149123	149128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020050	GTAA	2	8	149527	149534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020050	AAACC	2	10	149557	149566	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
625	NC_020050	CAAA	2	8	150005	150012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_020050	CTA	2	6	150052	150057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020050	AAG	2	6	150210	150215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020050	CCA	2	6	150240	150245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_020050	ATT	2	6	150261	150266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020050	TGC	2	6	150270	150275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020050	TCAT	2	8	150298	150305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_020050	CGC	2	6	150317	150322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_020050	TG	3	6	150418	150423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020050	CCAAG	2	10	150471	150480	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
635	NC_020050	AAC	2	6	150490	150495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020050	ATT	2	6	150512	150517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020050	GCA	2	6	150552	150557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_020050	GCA	2	6	150578	150583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_020050	AAT	2	6	153707	153712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020050	GAC	2	6	153794	153799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_020050	GA	3	6	153847	153852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020050	CCT	2	6	154535	154540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_020050	TAA	2	6	154560	154565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_020050	GAC	2	6	154574	154579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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646	NC_020050	CTA	2	6	154621	154626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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648	NC_020050	GA	3	6	154789	154794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
649	NC_020050	TCC	2	6	154800	154805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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652	NC_020050	TGA	2	6	157117	157122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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655	NC_020050	GCAA	2	8	157279	157286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
656	NC_020050	GCG	2	6	157305	157310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_020050	CAA	2	6	159543	159548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_020050	AAT	2	6	159576	159581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_020050	TTC	2	6	159671	159676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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670	NC_020050	GTT	2	6	161439	161444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
671	NC_020050	TAA	2	6	161457	161462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
672	NC_020050	TGG	2	6	161470	161475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
673	NC_020050	TTCAAT	2	12	161639	161650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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679	NC_020050	AAC	2	6	162153	162158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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695	NC_020050	TAA	2	6	171872	171877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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725	NC_020050	CA	3	6	176924	176929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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769	NC_020050	ATC	2	6	183292	183297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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771	NC_020050	GCGG	2	8	183990	183997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
772	NC_020050	GCA	2	6	184046	184051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_020050	CCA	2	6	184052	184057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
774	NC_020050	TC	3	6	184084	184089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
775	NC_020050	TAGT	2	8	184150	184157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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948	NC_020050	AT	3	6	217585	217590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_020050	TTTGA	2	10	217868	217877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_020050	TTG	2	6	217982	217987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
957	NC_020050	TTC	2	6	217997	218002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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965	NC_020050	ACA	2	6	218287	218292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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971	NC_020050	T	6	6	219288	219293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
972	NC_020050	TAAT	2	8	219387	219394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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977	NC_020050	TATT	2	8	219662	219669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
978	NC_020050	CTG	2	6	219735	219740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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