MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii (ex Angomonas deanei ATCC 30255)

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019815	TATT	2	8	19	26	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019815	GATA	2	8	56	63	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019815	ACAA	2	8	189	196	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019815	GAAA	2	8	898	905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019815	TACC	2	8	1286	1293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019815	ATTA	2	8	2305	2312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019815	AAAC	2	8	2496	2503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019815	ACCC	2	8	2532	2539	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019815	ACTG	2	8	2555	2562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019815	GCGA	2	8	2652	2659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019815	AAAG	2	8	3487	3494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019815	ATTA	2	8	5328	5335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019815	TGTT	2	8	5389	5396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019815	TTTA	2	8	5542	5549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019815	ATTG	2	8	9491	9498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019815	TTAA	2	8	9587	9594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019815	TTGA	2	8	9642	9649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019815	ATTT	2	8	9661	9668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019815	GTTT	2	8	9749	9756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019815	ATTT	2	8	10120	10127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019815	AAAT	2	8	10196	10203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019815	AATT	2	8	10312	10319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019815	TAGT	2	8	10343	10350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019815	TACT	2	8	10426	10433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019815	TAAT	2	8	14337	14344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019815	TTAT	2	8	16549	16556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019815	TTAC	2	8	19778	19785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019815	TAAC	2	8	19800	19807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019815	TGGA	2	8	19939	19946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019815	TTGT	2	8	22553	22560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019815	TAAA	2	8	23526	23533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019815	ATTA	2	8	26186	26193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019815	CCAA	2	8	26383	26390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019815	TATT	2	8	26790	26797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019815	TGAT	2	8	26868	26875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019815	AAAT	2	8	29016	29023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019815	TTAC	2	8	34385	34392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019815	TGTT	2	8	34591	34598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019815	TATT	2	8	37901	37908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019815	GATA	2	8	37938	37945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019815	ACAA	2	8	38071	38078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019815	GAAA	2	8	38780	38787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019815	TACC	2	8	39168	39175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019815	ATTA	2	8	40188	40195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019815	AAAC	2	8	40379	40386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019815	ACCC	2	8	40415	40422	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_019815	ACTG	2	8	40438	40445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019815	GCGA	2	8	40535	40542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019815	AAAG	2	8	41370	41377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019815	ATTA	2	8	43211	43218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019815	TGTT	2	8	43272	43279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019815	TTTA	2	8	43425	43432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019815	TATG	2	8	43847	43854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019815	TTTA	2	8	43929	43936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019815	ATGA	2	8	47347	47354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019815	AATT	2	8	48488	48495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019815	TTTG	2	8	53968	53975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019815	TAAT	2	8	60318	60325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019815	ATAA	2	8	63834	63841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019815	TTGT	2	8	77125	77132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019815	TATG	2	8	77250	77257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019815	GTAT	2	8	84043	84050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019815	AATA	2	8	93581	93588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019815	TATT	2	8	93967	93974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019815	TATT	2	8	96373	96380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019815	ATTT	2	8	100067	100074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019815	ATTA	2	8	101949	101956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019815	TATT	2	8	104973	104980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019815	TTTG	2	8	105011	105018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019815	GTTT	2	8	107022	107029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019815	TTTA	2	8	108996	109003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019815	TTTG	2	8	110661	110668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019815	AATT	2	8	110731	110738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019815	TTGT	2	8	116812	116819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019815	TTTG	2	8	119732	119739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019815	AAAG	2	8	119922	119929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019815	GAAT	2	8	119935	119942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019815	AGTA	2	8	120014	120021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019815	AAAT	2	8	120973	120980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019815	TATT	2	8	124310	124317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019815	TTTA	2	8	127863	127870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019815	CTTA	2	8	130010	130017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019815	TTGA	2	8	130725	130732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019815	ATAG	2	8	132240	132247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019815	CCTG	2	8	145567	145574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019815	TTAT	2	8	145667	145674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019815	TTAA	2	8	150462	150469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019815	AATT	2	8	150648	150655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019815	TGTT	2	8	150780	150787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019815	TAAT	2	8	151453	151460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019815	AAAT	2	8	151591	151598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019815	ATAA	2	8	162363	162370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019815	TAAT	2	8	163869	163876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019815	TTAA	2	8	164040	164047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019815	ATTT	2	8	169834	169841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019815	GGAA	2	8	184201	184208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019815	TAAA	2	8	184766	184773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019815	ATTT	2	8	185535	185542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019815	TATT	2	8	185586	185593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019815	AATA	2	8	189233	189240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019815	TAAT	2	8	189372	189379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019815	TTAT	2	8	193590	193597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019815	TATT	2	8	193603	193610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019815	TGAT	2	8	193718	193725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019815	ATGC	2	8	201138	201145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019815	AATT	2	8	201167	201174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019815	TAAT	2	8	201540	201547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019815	GTTA	2	8	201550	201557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019815	CATA	2	8	201565	201572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019815	TTAT	2	8	205891	205898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019815	AATT	2	8	207416	207423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019815	ATTT	2	8	211094	211101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019815	TTAA	2	8	214674	214681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019815	TAAA	2	8	223117	223124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019815	ATTT	2	8	229410	229417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019815	AAAT	2	8	230024	230031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019815	ATTT	2	8	230122	230129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019815	TTTA	2	8	230260	230267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019815	ATTT	2	8	230412	230419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019815	TCTT	2	8	230430	230437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019815	TATT	2	8	234219	234226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019815	ATTT	2	8	245674	245681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019815	GATT	2	8	245738	245745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019815	TTTA	2	8	246082	246089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019815	TTAA	2	8	248697	248704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019815	ATTA	2	8	251697	251704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019815	TTAT	2	8	258267	258274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019815	TTTA	2	8	262888	262895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019815	GTTT	2	8	262973	262980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019815	AACA	2	8	263039	263046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019815	TTTA	2	8	266598	266605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019815	ATTT	2	8	267783	267790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019815	ATTT	2	8	269182	269189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019815	TGAT	2	8	269251	269258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019815	TAAA	2	8	271424	271431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019815	TTAT	2	8	271435	271442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019815	TATT	3	12	274091	274102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019815	AAAT	2	8	274118	274125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019815	CTAT	2	8	274472	274479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019815	TAGT	2	8	274613	274620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019815	TATT	2	8	274656	274663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019815	TTAA	2	8	276592	276599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019815	TGTT	2	8	277485	277492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019815	TTAA	2	8	287831	287838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019815	ATCA	2	8	287885	287892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019815	TAAT	2	8	287897	287904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019815	ATTT	2	8	289668	289675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019815	AAGA	2	8	289698	289705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019815	ATTA	2	8	289708	289715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019815	TAAT	2	8	292104	292111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019815	ATTA	2	8	296922	296929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019815	ATTT	2	8	296980	296987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019815	CACC	2	8	297470	297477	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
154	NC_019815	GTAT	2	8	298534	298541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.