MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii (ex Strigomonas culicis) chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019814	AATTT	2	10	1766	1775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019814	AAATT	2	10	2323	2332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019814	GTATA	2	10	12235	12244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019814	ACAAA	2	10	12290	12299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019814	CTGAT	2	10	21915	21924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019814	AATGA	2	10	22119	22128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019814	CCGAA	2	10	26050	26059	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019814	TATAC	2	10	30818	30827	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019814	AATTT	2	10	30930	30939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019814	ATTTT	2	10	47891	47900	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019814	ATTAC	2	10	58030	58039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019814	ATTTT	2	10	62194	62203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019814	TATAT	2	10	62213	62222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019814	AAATG	2	10	70934	70943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019814	GTATA	2	10	71128	71137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019814	ATAAC	2	10	71153	71162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019814	ATAAA	2	10	77892	77901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019814	AATCA	2	10	100832	100841	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019814	TAAAT	2	10	104367	104376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019814	TGAAA	2	10	109698	109707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019814	TAATA	2	10	113117	113126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019814	ATTTT	2	10	113426	113435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019814	CTAAT	2	10	113657	113666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019814	ATATA	2	10	116803	116812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019814	ATTAA	2	10	120499	120508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019814	CTACA	2	10	123512	123521	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019814	TAAGA	2	10	140329	140338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019814	AACAA	2	10	150262	150271	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019814	TATCA	2	10	170659	170668	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019814	TAATG	2	10	183164	183173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019814	TTTTA	2	10	183184	183193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019814	AAATT	2	10	188661	188670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019814	GGATA	2	10	218095	218104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019814	TAACT	2	10	220302	220311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019814	ATTAA	2	10	235076	235085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019814	TAGTT	2	10	239177	239186	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019814	TTTAT	2	10	239979	239988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019814	AGTTT	2	10	251897	251906	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019814	TATTT	2	10	259684	259693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019814	TATAT	2	10	261798	261807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019814	TTATA	2	10	262085	262094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019814	ATATT	2	10	273516	273525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019814	TTTAT	2	10	278789	278798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019814	TAATT	2	10	282396	282405	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019814	GCGGA	2	10	293382	293391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019814	CATGC	2	10	293606	293615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019814	TTTTA	2	10	323841	323850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019814	TTGAT	2	10	325972	325981	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019814	TATAT	2	10	326257	326266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019814	AACAA	2	10	326563	326572	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019814	TTGTT	2	10	326602	326611	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019814	GTTTT	2	10	332236	332245	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019814	TGTTT	2	10	332848	332857	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019814	TTTGT	2	10	333097	333106	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019814	TCTGT	2	10	356725	356734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019814	ATTTC	2	10	357812	357821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019814	TCGTG	2	10	360442	360451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019814	CTCAT	2	10	363936	363945	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019814	TATGT	2	10	368858	368867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019814	CATTT	2	10	375323	375332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019814	AATTA	2	10	384821	384830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019814	AGTTA	2	10	387591	387600	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019814	GATCA	2	10	398657	398666	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019814	ATTTT	2	10	432952	432961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019814	TATTT	3	15	436697	436711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019814	GTTAT	2	10	443047	443056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019814	TTTTA	2	10	443078	443087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019814	TAATT	2	10	447657	447666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019814	TATTG	2	10	449289	449298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019814	ATTAA	2	10	458032	458041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019814	TTAAG	2	10	460301	460310	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019814	TGTTT	2	10	479049	479058	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019814	TATTT	2	10	485496	485505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019814	ATAAA	2	10	485530	485539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019814	GCAAT	2	10	488783	488792	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019814	TTTTA	2	10	494045	494054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019814	ATATT	2	10	499710	499719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019814	TATAC	2	10	520059	520068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019814	TATTT	2	10	521190	521199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019814	TATAA	2	10	546484	546493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019814	TAAAT	2	10	557461	557470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019814	AAATT	2	10	571728	571737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019814	AATCT	2	10	571848	571857	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019814	ATTTA	2	10	573253	573262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019814	ATTTT	2	10	573327	573336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019814	AGTAT	2	10	582100	582109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019814	TTTGC	2	10	582141	582150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019814	TATAT	2	10	589105	589114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019814	TATCA	2	10	590322	590331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019814	TAAAA	2	10	590876	590885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019814	TAATA	2	10	609916	609925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019814	TTAAA	2	10	610247	610256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019814	TTTAT	2	10	611306	611315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019814	AATCT	2	10	622153	622162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019814	TATAT	2	10	627761	627770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019814	CTTAG	2	10	627810	627819	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019814	TAATA	2	10	639741	639750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019814	TAAAT	2	10	639759	639768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019814	ATTAA	2	10	639778	639787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019814	ACCTA	2	10	648970	648979	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_019814	TTTCT	2	10	651541	651550	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019814	ATAAA	2	10	659974	659983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019814	CAAAT	2	10	667243	667252	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019814	AATGA	2	10	667279	667288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019814	AATAA	2	10	667358	667367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019814	CATCA	2	10	669963	669972	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019814	ATTAT	2	10	680621	680630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019814	TTTTA	2	10	690152	690161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019814	TAAAA	2	10	696939	696948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019814	ATTAG	2	10	700902	700911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019814	GATAA	2	10	700937	700946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019814	TACAA	2	10	722031	722040	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019814	CTACT	2	10	723714	723723	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_019814	AAAAT	2	10	738334	738343	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019814	TAAAT	2	10	747081	747090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019814	TAATA	2	10	762231	762240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019814	ATTTA	2	10	764593	764602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019814	TAAAC	2	10	774903	774912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019814	CTATA	2	10	774976	774985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019814	TCCTG	2	10	775105	775114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_019814	GATGA	2	10	779473	779482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019814	CTCCC	2	10	781475	781484	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
123	NC_019814	CACGA	2	10	782968	782977	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019814	AGCTC	2	10	784242	784251	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019814	AATGA	2	10	787887	787896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019814	AGATA	2	10	787948	787957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019814	AATTA	2	10	788040	788049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019814	TAAAA	2	10	798732	798741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019814	TAATA	2	10	809753	809762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019814	ACATA	2	10	810614	810623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019814	GATGA	2	10	815176	815185	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019814	CTCCC	2	10	817178	817187	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_019814	CACGA	2	10	818671	818680	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019814	AGCTC	2	10	819945	819954	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.